Также Альфа-легион взял из древних мифов наименование «лернейцы». Похоже, что так называли наиболее опытные ударно-штурмовые части Легиона, в особенности приданные роты терминаторов и, в ряде источников, прорывные отделения и дредноуты. В частности, боевые записи о конкретных подразделениях лернейских терминаторов указывают, что те были экипированы усовершенствованными штурмовыми средствами телепортации и специализированным тяжелым вооружением, например, компактными конверсионными излучателями и генераторами фазового поля. Первоочередная задача лернейцев состояла в том, чтобы быстро изолировать и уничтожить наиболее сильные передовые части и мощные полевые активы, находившиеся в распоряжении противника, причем сделать это настолько демонстративно и кроваво, чтобы не просто ликвидировать возможную угрозу для атаки Альфа Легиона, но и еще сильнее подорвать боевой дух врага психологическим шоком от нападения. Лернейцы действовали с таким расчетливым зверством и хладнокровной жестокостью, что быстро стали известны и за пределами Альфа-легиона. В определенных источниках также перечислены другие именные и специализированные отряды, такие как «Ратосфен», «Шайтан», «Кварин» и «Ехидна», которые, если они вообще существовали на самом деле, остаются совершенно загадочными. Кроме того, присутствуют ссылки на «Хрисаор», что могло относиться к библиаруму Легиона (возможно, также включая более широкую структуру сбора информации), который, как подозревают, имел большую численность до Никейского Совета. Хотя считается, что Альфарий не присутствовал на Совете, он — по крайней мере, внешне — принудил свой Легион подчиняться его решению, что быстро прекратилось в ходе Ереси.

В вопросе структуры и возможностей Альфа-легиона важно использование им агентов и вооруженных бойцов из числа людей и аугментированных людей. Во время Великого крестового похода многие Легионы Космического Десанта применяли сборные подразделения Эксцертус Империалис для поддержки своих действий, а многие экспедиционные флоты использовали полки Империалис Ауксиллиа (или Имперской Армии), подчиненные в боевой структуре Легионес Астартес, но Альфа-легион задействовал обособленные подразделения, специально натренированные на шпионаж, проникновение и терроризм, которые были верны одному лишь Легиону. Этим агентам и оперативникам, работавшим индивидуально или как часть сети, зачастую было мало что известно друг о друге, а во многих случаях — и о личности их подлинных хозяев, однако все они были в равной мере хорошо обучены, психологически настроены на беспощадную и фанатичную верность, а также зачастую подвергались хирургическим или биохимическим усовершенствованиям для улучшения способностей. При контакте с мирами людей, которые надлежало привести к Согласию, эти улучшенные и высококвалифицированные агенты (называемые «спаратои», вероятно от древнего термина, который согласно ряду источников, означал «посеянные») шли впереди Легиона, внедряясь в ряды населения и выступая в роли шпионов, агитаторов и саботажников. Их основная роль состояла в распространении разлада, создании масштабной паники и нанесении ущерба инфраструктуре с целью критически ослабить врага перед тем, как в бой вступит сам Легион. Когда, наконец, Альфа-легион обнаруживал свои истинные намерения, спаратои и их сеть агентов-марионеток организовывали волну диверсий и ложных атак, еще сильнее дестабилизируя противника, зачастую — ценой собственных жизней. Очевидно, что еще до Ереси сеть спаратоев протянулась и внутри самого Империума и его вооруженных сил, став злокачественным образованием, которое проявилось лишь после вспышки гражданской войны. Невозможно подтвердить другие сообщения — о настоящих легионерах, которые неизвестным способом также внедрялись в ряды гражданских и даже нижние эшелоны других Легионес Астартес, маскируясь под них.

Командная иерархия

Как и в случае со многим, касающимся Альфа-легиона, нельзя уверенно установить их командную структуру, однако можно сделать вывод, что определенные шаблоны были если не постоянными, то достаточно часто повторяющимися, чтобы считать их важными.

Первым из них является специализация. В любой конкретно взятой группировке беспрекословно соблюдалась цепь командования, однако эта цепь была изменчивой — условной и чрезвычайно децентрализованной по своей сути. Могло считаться, что армией командует офицер вроде капитана, однако полномочия совершенно естественным образом передавались отдельным специалистам, например, мастерам осады или вигилаторам, и считались абсолютными и неоспоримыми в их сфере компетенции.

Также предполагалось, что каждое подразделение Легиона будет действовать как самостоятельная и самоуправляемая ячейка, не нуждающаяся во внешнем командовании, и будет выполнять свою роль в глобальном плане сражения, руководствуясь собственными соображениями, и подобное считалось во всех отношениях целесообразным. Альфа-легион делал такой упор на единство действий и доверял своим воинам столько инициативы, что по проявляемой боевой скоординированности и реакции на изменение обстоятельств, возможно, превосходил всех прочих Легионес Астартес. Командующие Альфа-легиона редко замечались выступающими в роли чемпионов или военачальников в общепринятом понимании, чего можно было бы ожидать от Легионес Астартес. Казалось, они не жаждут ни личной славы, ни ощущения великого столкновения оружия. Вместо этого они имели обыкновение бесстрастно наблюдать за тем, как разворачивается сражение, следя за схемами ударов и вызванным ими кровопролитием, и вмешивались лишь по необходимости — отдавая приказы, которые бы склонили чашу весов в пользу Альфа-легиона, или же лично нанося удар в уязвимую точку, где они могли причинить наибольший ущерб.

Что касается почтительных обращений и титулов, то Альфа-легион, похоже, использовал для передачи информации о роли и полномочиях меняющийся набор терминов. Видно, что временами Альфа-легион сознательно копировал системы, применявшиеся другими Легионами (например, Сынами Хоруса или Кровавыми Ангелами), хотя остается неизвестным, делалось ли это для внедрения в конкретную стратегию проверенной схемы организации, или же в качестве своего рода насмешки. При тщательном изучении записей помимо таких схем обнаруживается несколько особых дополнительных уровней командования, не встречавшихся у прочих Легионов. Известно, что одним из таких уникальных титулов, использовавшихся Альфа-легионом, был «мастер-терзатель» или «джхариук» — ведущий командир, обладавший полным контролем над всеми силами Альфа-легиона в конкретной зоне боевых действий. Хотя номинальный чин мастера-терзателя мог различаться, его задача состояла в том, чтобы отслеживать изменение хода событий в конфликте до мельчайших подробностей и соответственно преобразовывать действия Легиона, создавая и отменяя боевые планы со стратагемами с потрясающей быстротой. Известно, что должность мастера-терзателя считалась в Альфа-легионе наивысшим достижением, и их печально известное умение контролировать поле боя высоко ценилось (пусть даже сам Легион зачастую воспринимался с недоверием) командующими и стратегами других Легионов Космического Десанта. Следует отметить, что мастера-терзатели входили в число тех немногих членов Легиона, помимо советников, чьи личные имена попадали в открытые записи, хотя остается неизвестным, имели ли эти имена реальную основу, или же были всего лишь псевдонимами отдельных воинов, а возможно, что и группы индивидов.

Военная диспозиция

Невозможно получить точные цифры относительно военной мощи Альфа-легиона в начале войн Ереси Хоруса. Источники и оценки сильно разнятся, иные делают экстравагантные утверждения, которые могут как переоценивать, так и недооценивать состав Альфа-легиона. Наиболее современные событиям источники, датируемые периодом около Бойни в месте высадки, называют численность Альфа-легиона между 120000 и 130000 легионеров, помещая его в среднюю категорию по мощи среди Легионов.

Отдельные теоретики сильно снижали эту цифру, примерно до 90000 — крупнейшей концентрации сил Альфа-легиона, когда-либо замеченной оперирующей на одном театре военных действий. Впрочем, если оглянуться назад и тщательно проверить факты, то свидетельства о деятельности множественных боевых групп в сильно удаленных местах указывают на численность куда выше, чем в обоих этих оценках, вплоть до порядка 180000 легионеров. Если эта цифра верна, то она делает Альфа-легион одним из самых грозных уже только по размеру. Об этом обстоятельстве не догадывалась ни одна из сторон последовавшей войны.

Что касается доступа к военному снаряжению и звездолетам, то Альфа-легион был внушительно оснащен. Опять же, трудно придти к истинным оценкам, однако большинство визуальных и перекрестных рапортов показывают, что Альфа-легион имел обширный доступ к самым современным видам снаряжения Легионес Астартес, которые не ограничивались доспехами типов «Максимус» и «Тартарос», новыми боевыми танками типа «Сикаран» и их подвидами, обширными запасами плазменного вооружения и конверсионных излучателей, а также специализированными боеприпасами, неизвестными за пределами Легиона.