При переходе налогоплательщика на упрощенную систему налогообложения суммы НДС, принятые к вычету налогоплательщиком по товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, и имущественным правам в порядке, предусмотренном главой 21 НК РФ, подлежат восстановлению в налоговом периоде, предшествующем переходу на этот режим налогообложения, то есть суммы НДС должны быть восстановлены в последнем налоговом периоде по этому налогу, предшествующем переходу организации на упрощенную систему налогообложения.

В соответствии с п. 4 ст. 166 НК РФ общая сумма НДС исчисляется по итогам каждого налогового периода применительно ко всем операциям, признаваемым объектом налогообложения согласно подпунктам 1 – 3 п. 1 ст. 146 настоящего Кодекса, момент определения налоговой базы которых, установленный ст. 167 НК РФ, относится к соответствующему налоговому периоду, с учетом всех изменений, увеличивающих или уменьшающих налоговую базу в соответствующем налоговом периоде.

На основании п. 10 ст. 167 НК РФ моментом определения налоговой базы при выполнении строительно-монтажных работ для собственного потребления является последнее число каждого налогового периода.

Таким образом, если организация выполняет строительно-монтажные работы для собственного потребления, то она должна по итогам последнего налогового периода по НДС, предшествующего переходу на упрощенную систему налогообложения, исчислить этот налог со всех фактических расходов на выполнение строительно-монтажных работ в этом периоде и уплатить его в бюджет.

Согласно подпункту 22 п. 1 ст. 346.16 НК РФ уплаченная в бюджет со стоимости строительно-монтажных работ сумма НДС включается в состав расходов при определении налоговой базы по налогу, уплачиваемому в связи с применением упрощенной системы налогообложения.

В соответствии с п. 2.1 ст. 346.25 НК РФ при переходе организации на упрощенную систему налогообложения в налоговом учете на дату такого перехода отражается остаточная стоимость приобретенных (сооруженных, изготовленных) основных средств и приобретенных (созданных самой организацией) нематериальных активов, которые оплачены до перехода на эту систему налогообложения, в виде разницы цены приобретения (сооружения, изготовления, создания самой организацией) и суммы начисленной амортизации в соответствии с требованиями главы 25 настоящего Кодекса.

Остаточная стоимость таких основных средств и нематериальных активов учитывается в следующем порядке:

– в отношении основных средств и нематериальных активов со сроком полезного использования до трех лет включительно – в течение одного календарного года применения упрощенной системы налогообложения;

– в отношении основных средств и нематериальных активов со сроком полезного использования от трех до 15 лет включительно в течение первого календарного года применения упрощенной системы налогообложения – 50 % стоимости, второго календарного года – 30 % стоимости и третьего календарного года – 20 % стоимости;

– в отношении основных средств и нематериальных активов со сроком полезного использования свыше 15 лет – в течение первых 10 лет применения упрощенной системы налогообложения равными долями стоимости основных средств.

При этом налогоплательщик, применяющий упрощенную систему налогообложения, может учесть в расходах стоимость только оплаченных основных средств и нематериальных активов.

Срок полезного использования основных средств определяется в соответствии с Классификацией основных средств, включаемых в амортизационные группы, утвержденной постановлением Правительства РФ от 01.01.2002 № 1 и применяемой при исчислении налога на прибыль.

В отношении основных средств и нематериальных активов, которые введены в эксплуатацию и амортизируются, стоимость которых не полностью учтена в расходах, формирующих налоговую базу по налогу на прибыль и которые не оплачены поставщикам, остаточная стоимость таких средств и активов будет определяться согласно приведенным в п. 2.1 ст. 346.25 НК РФ правилам, однако признать эти объекты в налоговом учете при применении упрощенной системы налогообложения налогоплательщик может только после оплаты их стоимости поставщикам.

В отношении основных средств и нематериальных активов, являющихся амортизируемым имуществом, но еще не введенных в эксплуатацию по состоянию на 31 декабря, следует отметить, что их стоимость не учтена в расходах для целей налогообложения прибыли, поэтому после перехода на упрощенную систему налогообложения их первоначальная стоимость должна учитываться в период применения упрощенной системы налогообложения в расходах, формирующих налоговую базу по единому налогу, после выполнения на основании подпунктов 1, 2 п. 3 ст. 346.16 НК РФ двух условий: данные объекты введены в эксплуатацию и расходы на их приобретение оплачены поставщику.