Во время правления Ивана IV дворец не раз горел (1547, 1584), но затем его вновь восстанавливали. Особенно украсили дворец при Борисе Годунове. Стены покоев расписали сюжетами, взятыми из жизни и быта. В дальнейшем они послужило основой для росписи Грановитой палаты.

Во время польской интервенции дворец подвергся страшному опустошению, драгоценности из царской казны были расхищены, мебель сожжена. Но постепенно дворец привели в порядок, украсили и пристроили новые помещения. Например, в 1635 – 1636 годах был построен Теремной дворец с Верхоспасским собором.

На протяжении XVII века дворец продолжает расширяться. Русские и иностранные художники украшают его с небывалой роскошью. Стены палат покрывают золочеными, с тисненым рисунком кожами, а потолки некоторых покоев – серебром. В 1679 году в хоромах Потешного дворца был учрежден первый в Москве театр, где магистр Ян Готфрид ставил комедийные спектакли.

Случившийся в 1682 году пожар разрушил многие дворцовые постройки, в том числе Грановитую палату, Золотую Царицыну палату, Терема и др. Впоследствии они были восстановлены и украшены с еще большей пышностью любимцем царевны Софьи – князем В.В. Голицыным.

Наивысшего расцвета Кремлевский дворец достиг в последней четверти XVII века. Его великолепие было необычайно. Дворец весь был расписан яркими красками и золотом, украшен художественной резьбой, драгоценными коврами, тканями и чудесной золотой и серебряной утварью. По свидетельству архитекторов, царский дворец к 1753 году состоял примерно из тысячи различных комнат.

После переезда царского двора в новую столицу – Санкт-Петербург дворцовые кремлевские здания на протяжении почти всего XVIII века приходили в упадок. Они долго не ремонтировались после пожаров, стояли без кровли и внутренней отделки. Пустующие покои часто занимались приказами и заселялись жильцами.

В 1769 году Екатерина II поручила гениальному русскому архитектору В.И. Баженову составить проект нового Большого Кремлевского дворца, причем поставила условия – сохранить соборы и другие архитектурные памятники Кремля. Для проекта были сделаны все чертежи, планы и построена очень дорогая деревянная модель будущего дворца.

После утверждения проекта приступили к очистке строительной площадки дворца. Для этого были разобраны некоторые древние здания Кремля, в том числе Годуновский запасной дворец, Житный двор, корпус старинных приказов, часть южной Кремлевской стены, Безымянная и Тайницкая башни. В 1773 году у подножья Кремлевского холма, почти на самом берегу Москвы-реки, был заложен Кремлевский дворец. Но вскоре по распоряжению Екатерины II его строительство было приостановлено, и гениальному проекту Баженова не суждено было осуществиться. Причиной этого послужила якобы осадка грунта у южной стены Архангельского собора, а на самом деле – недостаток средств в государственной казне.

В конце XVIII века дворцовые здания в Кремле пришли в крайнюю ветхость, некоторые из них полуобвалились. Из-за опасения обвалов была запрещена даже езда в экипажах недалеко от дворца. Вскоре по распоряжению специальной комиссии были снесены и безвозвратно погибли многие древние архитектурные памятники – Сретенский собор, Гербовая башня, часть Потешного дворца, дворец Бориса Годунова, Троицкое подворье и некоторые другие.

Во время Отечественной войны 1812 года многие кремлевские постройки были разрушены французами, сгорели при пожарах. После окончания войны некоторые из них восстановили и надстроили.

Одним из самых больших залов дворца является Георгиевский зал. Длина его 61 метр, ширина – 20,5, высота 17,5 метра. Зал посвящен военному ордену Георгия Победоносца, который с древнейших времен почитался на Руси, как олицетворение воинской доблести. Наградой за храбрость и подвиг первоначально была монета с изображением Георгия. Она была введена в конце XVI века, при царе Федоре Ивановиче.

Екатерина II в 1769 году учредила специальный военный орден, которым награждали за военные подвиги, храбрость и смелость в бою. Девиз ордена: «За службу и храбрость». Орден имел четыре степени, состоял из золотого креста с белой эмалью и звезды, которая нашивалась на мундир. Им награждали офицеров-дворян. Позднее был введен Георгиевский крест для награждения солдат. Первоначально он был одной степени, а затем стал четырехстепенным (первая и вторая степени – золотые, третья и четвертая – серебряные).

Орденами Георгия были награждены А.В. Суворов (I степень – за сражение под Рымником в сентябре 1789 года) и М.И. Голенищев-Кутузов (I степень – за Отечественную войну 1812 года).

Георгиевский зал был выполнен по замыслу зодчего как своеобразный храм славы русского оружия. Отделка и замечательные лепные украшения зала посвящены победам русской армии в XV – XVIII веках. Знаки ордена Георгия I степени размещены в простенках между колоннами и на сводах. На каждой доске укреплен вензель того царя, при котором основана воинская часть, начиная от Михаила Романова до Александра III.

Сводчатый потолок зала покоится на массивных пилястрах, к которым приставлено 18 цинковых витых колонн. Над колоннами водружены статуи, олицетворяющие победы русского оружия. Каждая из них имеет щит с изображением гербов краев и областей, входивших в состав Русского государства. Статуи выполнены известным скульптором И.П. Витали.

В простенках между колонн и на откосах пилястр укреплено более сотни мраморных досок, на которых золотыми буквами написаны названия полков, бригад, батарей и кораблей, получивших знаки ордена Георгия и имена георгиевских кавалеров. Эти названия и имена занесены в книги награждений, некоторые из них хранятся в этом же зале в бронзовых золоченых ларцах.