В конце концов, не получив подкреплений из крепости, полк сибирских стрелков полковника Третьякова был вынужден отступить вместе с батареями, расстрелявшими свой боезапас. Врагу оставлялись тактически выгодная и хорошо укрепленная в инженерном отношении позиция.

Удержать ее не помог и огонь с пришедших на подмогу из Порт-Артура канонерской лодки «Бобр», эсминцев «Бойкий» и «Бурный», которые стреляли из бухты Хунуэза. Но с началом отлива им пришлось отойти от берега. Корабли обстреливали неприятеля до тех пор, пока у них не закончились снаряды.

 Цзиньчжоуский бой стал одним из самых кровопролитных в ходе войны. Японцы из 30 тысяч человек (всего 2-я армия на это время насчитывала 36 тысяч человек), участвовавших в штурме укреплений на перешейке, потеряли около 4,5 тысячи солдат и 133 офицера. Потери полка сибирских стрелков и полевых батарей составили 1375 солдат (почти каждый третий) и 28 офицеров (почти половина из участвовавших в бою).

Защитники Порт-Артура тяжело перенесли оставление полевой укрепленной позиции у Цзиньчжоу — «ключа к Артуру». Военный инженер М.Н. Лилье писал:

«...Прекрасно укрепленная Цзиньчжоуская позиция, поглотившая такую массу труда, энергии и средств, была взята штурмом в течение одного дня».

Другой участник обороны Порт-Артура, С.А. Рашевский, в своем дневнике в тот день записал:

 «Та позиция, про которую говорили, что ее взять невозможно, что там надо положить целую армию, — сдается после второго натиска. Неужели же нам так трудно было отстоять эту позицию или хотя бы подольше задержаться на ней?»

Тот же Рашевский в своих размышлениях о дальнейшем ходе Японской войны и судьбе русской крепости на берегу Желтого моря писал в дневнике следующее:

«...По-моему, главная цель войны — Артур и Артур. С взятием Артура японцы выигрывают кампанию наполовину, если не более. Мы лишаемся при этом нашего флота, дорогих фортов и батарей..., а главное — базы для действий 2-й эскадры, помимо того, с падением Артура, вероятно... европейские их (японцев. — А.Ш.) друзья, Америка и Англия, станут денежно поддерживать их».

Весьма показательна и другая запись Рашевского:

«Все те, которые для оттенения собственной деятельности кричали, что Артур неприступен, — преступники перед нашим отечеством, благодаря им Артур очутился в нынешнем тяжелом положении...

Дай Бог нам отсидеться и отстоять ради чести и славы России наш Артур, но, видимо, что это будет стоить гарнизону Артура больших усилий и жертв».

...События в войне развивались не столь стремительно, как ожидалось сторонами. С занятием японцами порта Дальний крепость Порт-Артур оказалась фактически окруженной с моря и суши. В Дальнем стала сосредотачиваться осадная 3-я императорская армия под командованием генерал-полковника Маресукэ Ноги. Ему не случайно поручалось главнокомандующим маршалом Ивао Оямой осада русской крепости: именно генерал Ноги в 1894 году во время Японо-китайской войны захватил у китайцев Порт-Артур, блестяще проводя операцию.

Судьбой для России было уготовлено так, что обороной Порт-Артура по ранее утвержденным свыше планам руководил начальник Квантунского укрепленного района генерал-лейтенант A.M. Стессель, по свидетельству современников, едва ли не самый некомпетентный представитель царского сухопутного командования на Дальнем Востоке.

Стессель, опасаясь наступления японцев от Цзиньчжоу, приказал двум дивизиям сибирских стрелков — 4-й и 7-й генерал-майоров Фока и Кондратенко отступить к Волчьим горам, то есть под стены крепости без боя. Это лишало возможности защитников Порт-Артура заняться укреплением сухопутного фронта.

С большим трудом начальнику 7-й дивизии Р.И. Кондратенко удалось настоять на том, чтобы не отводить сразу войска под стены Порт-Артура, а занять позиции на удобных для боя высотах восточнее перевала Шининцзы по линии Суан-цайгоу — Лунвантан с целью встретить здесь наступающих японцев.

Передовую позицию заняла 4-я Восточно-Сибирская дивизия, четыре полка которой были подкреплены полком из дивизии генерал-майора Кондратенко. Они занимали линию обороны в 28 километров, которую обойти с флангов было невозможно. Сибирские стрелки спешно занялись инженерными работами: рылись окопы и траншеи, оборудовались батарейные позиции, блиндажи и другие укрытия для личного состава, устанавливались проволочные заграждения, а в ряде мест — фугасы.

О том, насколько плохо была поставлена разведка японских сил и их действий, свидетельствует следующее. В дивизионный штаб Фока несколько раз поступали донесения о движении японских войск к Порт-Артуру, но все они оказались неверными.

Противник, понесший большие потери в бою за Цзиньчжоу, собирался с силами: Осадная 3-я армия еще только высаживалась в порту Дальнем. Японцы сами опасались контрудара крепостного гарнизона, который в мае 1904 года превосходил их численно. Однако в штабе Квантунского укрепленного района на такой шаг никто не решился.