С 1925 г. — заместитель командующего, командующий войсками Ленинградского военного округа.

С 1927 г. — командующий войсками Московского военного округа, с 1928 г. — начальник штаба РККА, с 1931 г. — командующий войсками Приволжского военного округа, с 1932 г. — начальник и комиссар Военной академии имени М.В. Фрунзе.

С 1935 г. — командующий войсками Ленинградского военного округа, с 1937 г. — начальник Генерального штаба Красной Армии и заместитель наркома обороны.

В 1941 г. — заместитель народного комиссара обороны СССР и постоянный советник при Ставке Главного командования.

О личности маршала Советского Союза Шапошникова можно говорить много и долго, но при этом не сказать главного...

Во-первых, интеллектуальное влияние Бориса Михайловича на высший военный и политический эшелон Советского руководства было, в сущности, колоссально, хотя и не безгранично. Он вносил очень ценные предложения о дислокации войск в западных пограничных округах. Он предполагал основные силы этих округов держать в рамках старой государственной границы за линией мощных укрепленных районов, а во вновь освобожденные области Западной Белоруссии и Западной Украины, а также в Прибалтику выдвинуть лишь части прикрытия, способные обеспечить развертывание главных сил в случае внезапного нападения.

Во-вторых, выдающийся труд Шапошникова «Мозг армии» отмечал сам Сталин среди четырех книг военно-исторического характера по вопросам стратегии и военного искусства.

Борис Михайлович был для него учителем, равно как и для Жукова, Василевского и Антонова.

Он помогал вождю в постижении таинственной для него стратегии, военного искусства, а также алгоритма принятия решения как Верховного Главнокомандующего. И если маршал порой не мог переубедить вождя, если тот был уверен в своей правоте, то всегда компенсировал этот недостаток тонким и масштабным умом генштабиста.

В-третьих, на Сталина абсолютно производили впечатление его эрудиция и интеллигентность. Как теоретик и практик Б.М. Шапошников в военных вопросах разъяснял вождю многие архисложные аспекты. Был его лучшим советником и помощником. Только одна помощь Сталину в постижении искусства накопления, выдвижения и использования стратегических резервов стоит многого. При этом Борис Михайлович всегда оставался ярко выраженным военспецом, прекрасно понимающим несостоятельность новой политической системы, но никогда не дававшим повода усомниться в своей преданности ей.

Все знавшие его полководцы и военачальники называли Шапошникова аккуратным, выдержанным, трудолюбивым и организованным человеком. А еще в высшей степени деликатным. Он часто брал на себя вину подчиненных за несвоевременную информацию.

В нем видели обладателя лучших человеческих качеств, всегда отмечали в его деятельности педагогичность и методичность.

Сильной стороной его являлось умение организовать подготовку высших начальников и высших штабов. Военные игры он всегда проводил на сложном оперативном фоне, основу которого составлял, как правило, какой-либо исторический факт.

Шапошникова называли обаятельным человеком. Прекрасным, знающим, душевным и удивляющим своей феноменальной памятью. Он никогда не пользовался блокнотом, однако ничего не забывал.

Основными чертами характера Бориса Михайловича были: вежливость, такт во взаимоотношениях с подчиненными, способность их внимательно выслушать, готовность оказать им помощь.

Шапошникова отличали исключительная точность и аккуратность, непримиримость к любым нарушениям дисциплины. Его лицо всегда было неизменно спокойным, распоряжения краткими и точными, а слово «голубчик» обязательным.

Самым строгим наказанием у Бориса Михайловича было объявление выговора, ибо в его понятии объявление выговора начальником Генерального штаба должно было подсказать виновному подать рапорт об освобождении от занимаемой должности.

Всегда внутренне и внешне подтянутый, организованный, он сочетал в себе душевную красоту и огромную эрудицию, высокую культуру и блестящее знание военного дела. Его личное обаяние было огромным.

Кто знает, не все ли эти качества стали весомым аргументом для Сталина на категорический отказ от ареста и какого-либо преследования Бориса Михайловича, когда следователи НКВД собрали на него «увесистое» дело?

Борис Михайлович работал всегда. Его редко можно было застать в кабинете отдыхающим. Работоспособность же просто поражала Сталина. В 1938 г. из-за этого пристрастия он даже получил следующее приказание наркома обороны Ворошилова: «Приказываю прервать работу на 6 суток для отдыха, согласно заключения врачей». Но он игнорировал даже такие приказы.

Мало кто знает, что маршал Шапошников был человеком глубоко верующим. Он никогда не снимал старинной нательной ладанки с очень древней казацкой иконкой, которой было почти 200 лет. Кроме нее, он носил еще старый фамильный крест работы Фаберже. Более того, Борис Михайлович никогда не скрывал того, что верит в Бога. Верит истинно!