После прихода к власти большевиков ради защиты Отечества от немецких войск Щастный пошел с ней на сотрудничество, выбрав свой собственный путь. В январе 1918 года назначен помощником начальника военного отдела Центробалта, а фактически был командующим Балтийского флота. Только 5 апреля его официально назначили начальником Морских сил (наморси) Балтийского моря.

Вот что рассказывает о подвиге Алексея Михайловича в статье «Алексей Щастный. Спаситель Балтийского флота» В. Кулиниченко:

«В первой декаде апреля возникла реальная угроза его захвата: разведка сообщила — германская эскадра уже на подходе к Гельсингфорсу. Ранним утром 11 апреля с борта немецкого флагмана поступила радиограмма-ультиматум: “Германское командование вынуждено занять Гельсингфорс для защиты интересов Финляндии сегодня, а не 12 апреля в 12 часов дня. Все суда и вооруженные пункты просят поднять бело-красные флаги…” На немецкой эскадре были убеждены — теперь русский флот никуда не денется, капкан должен захлопнуться…

С первых дней переговоров в Бресте о заключении мира между Германией и Россией Балтийский флот — предмет тайных планов германского командования. В договорных документах оговаривался отвод в российские порты всех военных кораблей или немедленное их разоружение. А фактически немцы замышляли захват Балтийского флота. (…)

Враг рассчитывал, что в марте—апреле Гельсингфорс будет отрезан от Кронштадта сплошными ледяными нагромождениями торосов, в таких условиях не было даже попыток переходов. Однако когда днем 11 апреля германская эскадра подошла к Гельсингфорсу, немцы увидели на горизонте лишь дымы уходящих русских кораблей. Это взял курс на Кронштадт третий (и последний) отряд флота. Путь каравану из 167 кораблей, шедшему шестью колоннами, как и первым двум отрядам, покинувшим Гельсингфорс в середине марта — начале апреля, пробивали ледоколы. Всего за этот поход, который войдет в историю Балтфлота под названием “ледовый”, в плавную базу придут 211 кораблей». А ведь эти спасенные корабли стали основой Балтийского флота молодой республики!

20 апреля третий отряд кораблей под командованием Щастного прибыл в Кронштадт, а 27 мая его арестовали прямо в кабинете Л. Троцкого “за преступления по должности и контрреволюционные действия”».

«На процессе по делу Щастного некоторые закулисные интриги вокруг кораблей Балтийского флота затронул сам единственный свидетель Лев Троцкий, — рассказывает подоплеку ареста автор статьи. — Чтобы убедиться в этом, достаточно внимательно прочесть относительно большой кусок стенограммы Ревтрибунала, хотя здесь Троцкий и напустил немало тумана. “На самом деле в самый острый момент ко мне приходили представители английского адмиралтейства и запрашивали о том, примем ли мы меры для уничтожения Балтийского флота. О личности английских офицеров хорошо осведомлены Беренс и Альтфатер, Когда этот вопрос был затронут на военном совещании, Щастный крайне неопределенно высказался о возможности уничтожения. Лишь после его отъезда этот вопрос был рассмотрен на том же совещании конкретнее… В это время к одному из членов коллегии явился английский офицер и заявил, что Англия настолько заинтересована в взрыве наших судов, что готова заплатить тем матросам, которые возьмутся за это дело…”»

Единственное, что долгое время не удавалось установить, так это фамилию английского офицера, предложившего Троцкому денежные суммы. Изучение дела позволило дать ответ на этот вопрос. Он содержится в показаниях Альтфатера следователю Кишисенну от 5 июля 1918 года: «Фамилия английского офицера, упомянутого в показаниях Л. Троцкого, комендэр Кроми — он английский морской агент…»

Не это ли явилось причиной и расправы над Щастным «вождя и организатора Красной Армии», что он выступил против продажи Балтийского флота на сторону или даже его уничтожения?

Произвести следственные действия по делу Щастного в срочном порядке Кингисеппу предписал ВЦИК. Этот вопрос специально рассматривался 28 мая на заседании Президиума высшего органа Советской власти. В деле имеется выписка из протокола № 26 следующего содержания: «…п.2. Об аресте бывшего начальника морских сил Балтики Щастного (отношение т. Троцкого). Одобрить действия Наркома по военным делам т. Троцкого и поручить т. Кингисеппу в срочном порядке производство следствия и представить свое заключение в Президиум ВЦИК. Подпись секретаря ВЦИК Аваиссова».

Из выписки следует, что единственным основанием для одобрения ареста явилось письмо Л. Троцкого в Президиум ВЦИК, написанное в тот же день: «Уважаемые товарищи. Препровождаю Вам при сем постановлении об аресте бывшего начальника морских сил Балтики Щастного. Он арестован вчера и препровожден в Таганскую тюрьму. Ввиду исключительной государственной важности совершенных им преступлений мне представлялось бы абсолютно необходимым прямое вмешательство в это дело ЦИКа… С товарищеским приветом Л. Троцкий».

Несмотря на слабую доказательную базу обвинения, Щастный был приговорен 21 июня 1918 года к расстрелу. А, как известно, декрет о восстановлении смертной казни был принят большевиками 13-го. Более того, приговор Щастному стал самым первым таким приговором в Советской России. В 4 часа 40 минут утра 22 июня капитан 1-го ранга Щастный был расстрелян.

Говорят, перед расстрелом мужественный морской офицер сказал: «Смерть мне не страшна. Свою задачу я выполнил — спас Балтийский флот».

Он действительно спас Балтийский флот дважды, несмотря на свой несправедливый приговор: