Осенью 1940 года на острове Валаам, в монастырских корпусах, была организована школа боцманов и юнг. В 1941 году все они ушли на оборону Ленинграда.

В 1944 году финские войска покинули остров, и позднее там было размещено подсобное хозяйство Питкярантского целлюлозного завода, организовано лесничество, восстановлена метеостанция.

В 1950 году в бывших кельях и скитах устроили Дом инвалидов войны и труда, куда помещались инвалиды войны с материка, в том числе из Ленинграда. Дом инвалидов переведен на материк в 1984 году.

Валаамский монастырь. Братия на сенокосе. 1900-е гг.

Только с 1960-х годов на остров стали приходить первые теплоходы с туристами. В 1979 году на территории организован музей-заповедник, и позже началась реставрация памятников.

13 декабря 1989 года, в день памяти апостола Андрея Первозванного, на остров ступили шесть монахов, ознаменовав начало возрождения Валаамской обители.

27 февраля 1994 года архимандрит Панкратий заново освятил часовню Валаамского монастыря на Синопской набережной в Санкт-Петербурге, это завершило процесс возврата этой часовни монастырю.

13 декабря 2005 года впервые зазвучал 1000-пудовый благовест – колокол «Андрей Первозванный», установленный на колокольне в монастыре.

По состоянию на 2011 год, в монастыре общее количество насельников – 217 человек, включая скиты и подворья. Из них: иеромонахов – 37; иеродиаконов – 12; монахов – 89; рясофорных послушников – 19; послушников – 60. Постоянно в монастыре работает от 30 до 40 трудников.

Валаамский монастырь – ставропигиальный, т. е. находится под наблюдением и каноническим управлением Патриарха Московского и всея Руси. Указом Патриарха Алексия II в Валаамской обители восстановлено игуменство, которое предусмотрено старинным Уставом Валаамского монастыря, утвержденным к применению также указом Патриарха. Устав Святого Валаама составлен по типу и строгости Афонских монастырей; повелевает ничего не предпринимать «настоятелю без совета братии». Поэтому регулярно собирается Духовный Собор старшей братии, в который входят игумены, духовник, благочинный, гостинник, ризничий, помощник игумена по приему паломников, скитоначальники, казначей, эконом.

Богослужебный суточный круг в Валаамском монастыре начинается в 17.00 вечерней с малым повечерием. Затем читается валаамское монашеское правило, три канона с акафистом Божией Матери, и чин прощения.

После правила братия направляется в трапезную на ужин. В 21.00 удар колокола возвещает время безмолвия, во время которого монахи читают келейное правило, состоящее из Иисусовой молитвы и поклонов.

Утреня, предваряемая полунощницей, в монастыре совершается в 5.00. После этого братия переходит в храм Валаамской иконы Божией Матери, где служится ранняя Божественная литургия. Служба заканчивается в начале девятого. После утреннего чая (келейно) и краткого отдыха монашествующие, послушники и трудники отправляются на послушания, распределенные благочинным. В 13.00 – обед в братской трапезной. За трапезой очередной монах читает святоотеческие творения. Присутствие всей братии обязательно. После трапезы в 13.30 каждый день у раки основателей монастыря преподобных Сергия и Германа, Валаамских чудотворцев, служится молебен, а в среду – молебен у чтимого списка иконы Божией Матери, именуемой «Всецарица». В воскресенье после вечерни соборно служится молебен с акафистом преподобным Сергию и Герману. В 21.00 – выход из храма.

Каждый монах вместе со своим духовником или с настоятелем индивидуально решает, когда лучше молиться, читать келейное правило. Для новоначальных насельников келейное правило длится обычно полчаса, затем, по мере приобретения навыка и духовного опыта, продолжительность чтения правила постепенно возрастает.

В 22.00 отход ко сну. Сон у братии длится обычно 4–5 часов ночью и пару часов днем, после обеда. Всего на сон в сутки выделяется 6–7 часов, как об этом предписывается в святоотеческих книгах.

На Валаам ежегодно прибывают около 100 тыс. паломников, из которых около 90 тыс. – туристы.

В монастырских гостиницах могут быть размещены, одновременно, до 200 паломников.

Скиты Валаамского архипелага:

Скит Всех Святых (Белый скит);

Святоостровский скит (преподобного Александра Свирского) восстановлен в 2001 году после пожара 1999 года;

Ильинский скит (уничтожен в 1950-е гг., заново отстроен в 2006 г.);

Никольский скит;

Предтеченский скит;

Коневский скит (разобран в 1950-х гг., ныне восстановлен);

Свято-Авраамиевский скит (разрушен);

Воскресенский скит (Красный скит);

Гефсиманский скит;

Смоленский скит (восстановлен в 2005 г.);

Свято-Владимирский скит (построен в 2007 г.).

Скиты на других островах Ладожского озера:

Германовский скит (остров Сюскюансаари) с церковью Александра Невского, в настоящее время лежит в руинах;