После победы над фашистской Германией работы у контрразведчика Ивашутина не уменьшилось. США — один из основных союзников СССР в войне против Гитлера, стали теперь нашим главным противником, и американская разведка всячески стремилась внедрить на территорию СССР своих агентов. Для достижения этих целей использовались все методы. На территорию СССР забрасывались агенты-парашютисты, другие агенты иностранных разведок пытались тайно пересечь советские границы и раствориться на просторах страны, которая с большим трудом залечивала тяжелые раны войны.

Американские, английские и германские разведки активно использовали для достижения своих целей и «пятую колонну» — военизированные националистические организации, сохранившиеся на Украине и в Прибалтике. На Украине тайно действовали Организация украинских националистов (ОУН) и Украинская повстанческая армия (УПА). В Литве орудовали бандиты «Армии освобождения Литвы» и «Союза литовских партизан». В Латвии — «Латышское национальное партизанское объединение», «Латышская организация сопротивления» и другие, в Эстонии — «Эстонский национальный комитет» и «Союз вооруженной борьбы». Эти профашистские подпольные организации были хорошо вооружены, получали поддержку от иностранных разведок и причиняли Москве и местным органам власти большую головную боль.

Борьбу с националистическим подпольем на Украине было поручено возглавить генералу Ивашутину. В сентябре 1952 года он был назначен министром государственной безопасности УССР, а в 1953 году стал заместителем министра внутренних дел Украины.

Поставленные задачи он выполнил: руководители националистических организаций были уничтожены, однако многие рядовые члены этих организаций ушли в подполье, на долгие годы прекратив террористические акты и затаились. Перед отъездом из Киева в Москву Петр Иванович сказал руководителям украинского правительства:

— Борьба с бандеровцами не окончена. Пройдут годы, осужденные отбудут свои сроки. Далеко не все из них вернутся на Украину раскаявшимися. Вырастут дети и внуки репрессированных — в их душах сохранится обида за своих отцов и дедов… При мощной подпитке с Запада, на волне украинского национализма и русофобии бандеровщина возродится. Поэтому необходимо адекватное противодействие — политическое, экономическое и социальное, но особенно — идеологическое.

Противодействие, видимо, было неадекватным. В начале XXI века прогноз генерала Ивашутина оправдался.

В 1954 году генерал-полковник П. И. Ивашутин был назначен на должность заместителя председателя Комитета государственной безопасности при Совете Министров СССР

Как и другие заместители председателя этой организации, он отвечал за эффективную работу конкретных управлений и служб. Ивашутин курировал деятельность 3-го Главного управления КГБ (военная контрразведка), а также 4, 5 и 6-го управлений, ряда отделов и Комиссию по аттестации офицерского состава Комитета государственной безопасности.

Назначение Ивашутина на высокую должность в центральном аппарате КГБ, несомненно, было связано с дальнейшим обострением советско-американских отношений, усилением интереса американской разведки к государственным и военным секретам СССР Американцы всячески пытались добыть сведения о советском военно-экономическом потенциале, но часто они делали это очень недобросовестно и порой докладывали Белому дому недостоверные сведения о Советском Союзе. Так, в 1947 году директор ЦРУ контрадмирал Р. Хилленкоттер, переоценив возможности СССР, сообщал президенту Трумэну о быстром наращивании советского атомного потенциала. По его оценкам, в 1955 году СССР должен был иметь 50 атомных бомб — однако такого объема советский атомный арсенал достиг значительно позже.

Подобные «прогнозы» иногда преднамеренно просачивались в прессу, пугавшую американцев советской военной угрозой, между тем как под пропагандистский шум в США наращивались темпы создания межконтинентальных баллистических ракет, разрабатывались планы атомной войны против СССР В январе 1954 года президент Эйзенхауэр заявил: «…Если мы сможем одновременно совершить атомное нападение на все передовые базы ВВС коммунистов, противник будет обескровлен с самого начала боевых действий.»

Советские атомные бомбы и базы ВВС пугали президента Эйзенхауэра не случайно. Поводом тому послужила очередная ошибка американской разведки, агенты которой действовали в Москве. А. Даллес, возглавивший в 1953 году ЦРУ США, писал: «.В 1954 году появились свидетельства того, что СССР производит тяжелые межконтинентальные бомбардировщики дальнего радиуса действия, сравнимые с нашими В-52…»

Американская разведка предположила, что «русские. планируют выпускать тяжелые бомбардировщики с темпом, который позволяет их экономика и технология.» Даллес писал: «Все это привело к предположениям в нашей стране об «отставании по бомбардировщикам».

Причиной этих вымыслов стал воздушный парад в Москве, состоявшийся 1 мая 1954 года. На том параде был продемонстрирован опытный образец советского реактивного межконтинентального бомбардировщика М-4, который пролетел над Красной площадью в сопровождении истребителей МиГ-17.