В 1902 году министр внутренних дел Российской империи В.К. Плеве рассмотрев дело Воронежского комитета решил, что кандидатура Ф.Щербина не соответствует для руководства экспедицией.

После этого Ф. Щербина под свою ответственность, добился разрешение на систематизацию материалов, проведение экспертизы и подготовку к изданию «МКЗ», без финансирования от Министерства Земледелия и государственного имущества. В качестве доказательства можно привести его слова: «Еще раз позволю себе сказать, что окончание работ экспедиции в тех ее частях, которых ведение лежало на мне как заведующем экспедицией, я считаю нравственной своей обязанностью довести до конца без всякого денежного вознограждения». В начале ХХ века ученый П.Г.Галузо отмечал что, во взглядах Ф. Щербина были некоторые элементы демократизма.

Работу экспедиции продолжил Е.П. Добровольский, а позднее возглавил Лев Карлович Чермак. Он был помощником Щербина, который находился под тайным наблюдением полиции. Также он был дворянином, который был изгнан на 3 года в Омск за свои политические взгляды. Позднее выяснилось что он был одним из тех кто содействовал организации эсеров в крае. В 1896-1897 гг. он был взят в экспедицию в качестве регистратора, но позднее стал одним из приближенных Ф. Щербина. После его ухода Л.Чермак был назначен руководителем экспедиции (1902-1903 гг.).

По заявлению исследователя М. Кул-Мухаммеда Л. Чермак высказывал справедливое мнение о казахах. Отмечая, что на него повлиял великий казахский акын Абай Кунанбаев, подтвердил свое мнение словами А.Букейханова, из опубликованного им в газете «Казах» статьи: «После получения отчета Ф. Щербиным в 1900 году, написавший вторую норму был Л. Чермак. Он был другом великого Абая, и последовал по пути опального Михаэлиса». Таким образом приходит к выводу, что Чермак был знаком с Абаем через Михаэлиса. Также М. Кул-Мухаммед изучив труды Ф. Щербина, Л. Чермака, А. Букейханова отмечает, что они придерживались антиколониальной позиции. Например, Л. Чермак поддержал норму Щербина. Подтверждением тому служит его высказывание: «Сокращение нормы – сознательное разрушение хозяйства киргизов, вынуждение их к голодному существованию, принуждение бросить традиционное ремесло».

Наряду с этим, Л.К. Чермак написав свой труд «Формы киргизского землепользования», редактировал предисловие и разделы «МКЗ». А.Букейханов высоко ценил верность Л. Чермака науке и писал: «В научной сфере он никогда не изменял своим мнениям и принципам ни перед какой либо угрозой».

В этот период центр Омской экспедиции попал под строгое наблюдение полиции. Так как о них, представитель министерства внутренних дел В.Д.Даль доложил Николаю ІІ: «…члены экспедиции среди населения ведут антиправительственную агитацию». В свою очередь Николай ІІ в срочном порядке принял резолюцию об освобождении от должности всех исследователей. В июне 1903 года все члены экспедиции за свои антиправительственные взгляды были арестованы и Омское бюро закрыто. Но до сих пор нет данных об истинных причинах остановки работ экспедиции и об антиправительственных убеждениях исследователей. Таким образом, обработка оставшихся материалов была продолжена в Петербурге. Несмотря на роспуск экспедиции, собранные материалы томами выпускались до 1909 года.

Созданная в 1896 – 1903 гг. экспедиция, основной целью ставила исследование всех уездов Степного края, и использование его итогов Министерством государственного имущества в целях проведения земельной политики в Казахстане. В задачи экспедиции входили: исследование и описание природы, истории края, важность аулов и волостей, также выяснение методов ведения хозяйства, землепользования и необходимой территории для кочевых и полукочевых хозяйств, определение объема территории для фонда переселенцев. Особое внимание, в хозяйственно – статистическом исследовании, обращалось на переселение крестьян из центральных регионов России.

Материалы экспедиции были использованы для экспроприации «излишних» земель казахов Российским правительством. Эти материалы о состоянии хозяйства казахов конца ХІХ в. и начала ХХ в. являются уникальными. Члены экспедиции пришли к мнению, что земельные нормы превышают и нет необходимости в большой территории кочевьям казахов, так как в некоторых местах они переходят к оседанию и земледелию. Но в последующих исследованиях после экспедиции Щербина, земельные нормы для казахов были еще снижены. В данном случае А. Букейханов поддерживал нормы Щербина. Несмотря на это, работа экспедиции под руководством Ф. Щербина выделяется тем, что впервые была научно обоснована колониальная политика Российского царизма и всесторонне исследована история казахского народа.

Материалы «МКЗ» для Тургайской и Уральской областей были собраны коллективом партии созданной в 1904 – 1912 гг.

Основываясь на архивные материалы, можно прийти к мнению, что в исследовательскую партию входили: кроме заведующего и главного статиста входили агроном Скалов, руководитель работ Батманов и его помощники Прозоровский и Седельников. Также, заведующий техническим отделом Шамышевский, старшие топографы Заболотский , Ядрихинский и топографы Баранов, Данилин, Малянчиков, Романов, Э. Яржиновский, В. Яржиновский, Сапарянц, Скобейко, Янулевич, Ленневич, Котковский. Всего участвовало 14 топографов. В документе по названию «Отчет о работах в Тургайской и Уральской областях за 1905 г.» имеются данные о заработной плате, дополнительных выплатах для проезда и арендуемого жилья.

По данным «МКЗ», первые работы в Тургайско-Уральских областях, с 1904 года вели статист Карлсон, Л.Н. Рум и бывший депутат І Государственной Думы Т.И. Седельников. Позднее к ним присоединились Батманов, Н.П. Шевалье. В числе специалистов, исследовавших географию, природу и растения края были 2 гидротехника – Рейнвальд и Миронов, горнорудный инженер Казицин, геолог В.П. Семенов. Про названных членов статистической партии в научных трудах мало сведений.

К примеру, Л.Н. Рум родился 19 мая 1869 года, учился в Пермском и Черниговской гимназиях. В 1889 году поступив в медицинский факультет Казанского университета, в 1891 году переводится на юридический факультет. В 1892-1894 гг. участвуя в различных кружках, обучается в нескольких лицеях. В 1898 году был взят под строгий контроль за хранение незаконных изданий и был переселен в Вологодскую губернию. В 1901 году Л.Н. Рум приглашен в Министерство земледелия и государственного имущества, где работал старшим топографом в Пермско-Вологодской организации по переселению, а также редактировал сборник «Итоги экономического исследования крестьянского населения Усть-Сысольского уезда Вологодской губернии», опубликованный в 1904 году. В том же году в октябре он был отправлен в город Оренбург и в течении нескольких лет работал в Урало-Тургайской статистической партии.