Ученый без практики, что пчела без меда. И Дж. Алиев хорошо понимал неразрывную связь теории и практики. Под его руководством коллектив лаборатории института земледелия, начиная с 70-х годов, разрабатывает физиологогенетические основы продуктивности растений, которые помогли раскрыть потенциальные возможности сельхозкультур Азербайджана. В этих целях в лаборатории создается ценнейший генофонд пшеницы по фотосинтетическим признакам. При этом широко была использованы коллекции опорного пункта Всесоюзного института растениеводства – Араблинки, что неподалеку от Дербента. Генофонд обогатился генотипами пшеницы, привезенными Дж. Алиевым в 1981 году из международного центра по улучшению сортов пшеницы и кукурузы в Мексике.

Для реализации новых идей и научной комплексной программы нужен был высококвалифицированный коллектив. И Дж. Алиев, работая в институте Ботаники Академии наук и в институте земледелия, занялся подготовкой научных кадров, привлекая выпускников вузов республики. Сознавая, что наука успешно развивается на стыке научных дисциплин, он привлек химиков, физиков, математиков, которые повысили свой теоретический уровень в крупнейших научных центрах бывшего Союза. Благодаря этому впервые в республике было положено начало применения математических методов и компьютерной техники при решении теоретических и практических вопросов биологии и сельскохозяйственной науки. Ныне некоторые из них успешно работают в научных центрах Германии, Японии, Франции, Голландии, США,Канаде.

Когда человек отдает все лучшее, что у него есть, это всегда много стоит. Дж. Алиев отдал ученикам все, что имела душа и богатый опыт, глубокие знания. По его инициативе и содействию подготовлено около 250 кандидатов и докторов наук. Сам он воспитал более 50 молодых ученых, ставших впоследствии кандидатами и докторами наук.

В начале 80-х по его инициативе в Пиршаги начали строить селекционный комплекс с фитотронами и теплицами, который был введен в эксплуатацию в 1986 году. Он нужен был для выращивания растений в искусственно регулируемых условиях, а также изучения как влияет на них температура, освещенность, влажность и другие факторы. Здесь можно было получить несколько урожаев в год и ускорять селекционные процессы. В строительстве комплекса Дж Алиев вложил частицу своей души, окружив себя заботами и неугомонными хлопотами. Вкупе они составляли стержень его комплексной программы.

Ученый и коллектив, что называется, были у цели, когда в перестроечный 1988 год по заданию имперского Центра и его сателлитов в Баку нагрянула комиссия в Пиршаги в поисках «жареных» фактов, чтобы свести счеты с братом опального в то время Гейдара Алиева. Как ни старались прислужники, так называемой ударной группы, криминала обнаружить не удалось ни в строительстве фитотронов, ни в работе института земледелия. На основе наспех подготовленной справки коллегия Министерства сельского хозяйства отстранила от должности его директора Асада Мусаева, назначив на его место Спартака Алиева, который не мог отличить семян ячменя от пшеницы. Обрушив шквал клеветнических измышлений на Дж. Алиева сторонники А.Везирова парализовали работу научного коллектива, и молодые специалисты были вынуждены покинуть стены породнившегося института. В качестве обвинения «перестройщики» указали на то, что Дж. Алиев привлекал к работе физиков, химиков, математиков и тем самым нанес «большой вред» биологической науке. На самом деле невежи сами того, не сознавая, выплеснули на улицу будущее института, которое с таким усердием выпестовал ученый.

Аналогичное явление произошло 220 лет назад с английским ученым Джоном Пристли, стоявшего у истоков фотосинтеза. Проводя опыты, он обнаружил, что растения могут «исправлять» воздух «испорченный» горячей свечей или животными. За это открытие он был награжден Золотой медалью королевского общества. Однако кучка негодяев, подстрекаемые правительством, напали и подожгли лабораторию, где хранились ценные приборы и результаты проведенных опытов. Д. Пристли остался жив, но наукой он больше не занимался. Следует подчеркнуть, что в те времена открытия были сделаны химиками и физиками. Вот об этом не знали «перестройщики».

В отличие от английского коллеги азербайджанский ученый продолжал работать. Путь его научных изысканий был долог, но ради поставленной цели он был готов пройти его до конца. Ни горбачевы, ни везировы, ни ученые-негодяи, не смогли сломить его ни духовно, ни нравственно. Он верил в истину и справедливость, зная, что наступит день, и она снова восторжествует. Сила народа в справедливости, гласит народная мудрость. Но она была нарушена и Дж. Алиев не мог молчать, когда того требовало время и обязательства. Он выступал в прессе, давал интервью, беседовал с журналистами, подвергая острой критике главных прорабов перестройки, предателей принципов и позиции угнетателей и прихлебателей нового режима, при котором вместо нормальной жизни царили хаос и беспредел. Он всегда говорил то, что думал и чувствовал и, мнение его всегда было обоснованно. С таким видением вещей может быть только ученый планетарного явления.

В наше недавнее время большой смуты все рушилось и уничтожалось, злобно и безжалостно. Но благодаря усилиям академика и его коллектива удалось собрать сохранить около 10 тысяч сортов по фотосинтетическим признакам являющихся базовым материалом для новой селекции. За прошедшие 26 лет институтом выведено, передано в Госсортоиспытание республики свыше 60 сортов зерновых культур, районировано 16 сортов пшеницы, среди которых Мирбашир-50,Гарагылчыг-2,Тертер, Вюгар, Шираслан-23,Мирбашир-128 получили высокий отзыв у земледельцев. Они высокоурожайны, с хорошим качеством и устойчивостью к стрессам, вредителям, болезням. В настоящее время интенсивные сорта пшеницы Баракатлы-95,Алинджа-84,Гийметли 2/17,Тертер-2,Пиршахин проходят испытание. Районированы два сорта ячменя, по одному – ржи, овса, тритикали, чечевицы, фасоли, по два – нута, кукурузы, табака.

Особым доверием у хлеборобов пользуется твердая пшеница Гарагылчыг-2. Этот сорт короткостебельный, созревает быстро и дает по 7-8 тонн с гектара. Зерна крупные, янтарного цвета в золотом колосе. И вот уже 15 лет эта культура выращивается на полях Мугани и Ширвана, других зонах Азербайджана.

С приходом к власти Гейдара Алиева в июне 1993 года полностью изменилось отношение и взгляды на науку, как производительную силу общества. Уже в 1994 году с целью улучшения семеноводческой деятельности и обеспечения специализированных хозяйств высокондиционными семенами на базе института земледелия, создали научно-производственное объединение «Элита», при котором с нынешнего года начал действовать Республиканский селекционный центр. Под руководством академика Дж. Алиева ведутся научные разработки, совершенствуются теоретические основы селекции и семеноводства с внедрением достижений науки, в области физиологии, генетики, биохимии, защиты растений и технологии, развиваются новые направления биотехнологии, генной и клеточной инженерии, математических методов и компьютерной техники, выводятся высокоурожайные сорта зерновых культур, табака, ведутся работы по ведению первичного семеноводства и производства элиты, совершенствованию приемов обработки почвы, и зональной системы земледелия, изучением загрязнения почв радионуклидами, радиоактивного распада накапливающихся в урожае. Исследования в этой области легли в основу недавно вышедшей монографии в Москве «Искусственные и естественные радионуклиды почвенно-растительном покрове Азербайджана».