1899, 1 июля – Виленский военный округ. Прибыл «для ближайшего ознакомления со службой Генерального штаба» в масштабах округа.

1899, июль – Виленский военный округ. Принял участие в трех частных учениях.

1899, сентябрь – Виленский военный округ. Превосходно аттестован начальством.

1900 – женился на потомственной дворянке Агриппине Владимировне Де-Прейс, уроженке Казанской губернии.

1901 – родилась дочь Ольга (1901–1982; работала в Казанской филармонии).

1901, 15 сентября – Генеральный штаб. Офицер разведки при Варшавском военном округе. Должность – помощник старшего адъютанта штаба округа Н. А. Монкевица.

1902 – присвоено звание «капитан».

1903 – родился сын Михаил (1903–1922; в 1921 г. добровольцем ушел в Красную армию. Воевал на Туркестанском фронте с басмачами. Умер от ран. Его сын и внук – офицеры Советской и Российской армии).

1903, 20 января – военный министр Куропаткин получил одобрение царя на создание в рамках военного ведомства особого «разведочного отделения».

1904, октябрь – Русско-японская война. 2-я Маньчжурская армия. Штаб. Управление генерал-квартирмейстера. Оперативный отдел. Помощник старшего адъютанта.

1905 – родилась дочь Татьяна (1905–1959; обладала прекрасным голосом, солистка Ансамбля песни и пляски Татарской АССР).

1905, май – Варшавский округ. Начальник отделения разведки и контрразведки (официальное наименование должности – старший адъютант штаба округа).

1907 – русская разведка получила правовой статус, штатное расписание, финансовое обеспечение как автономная служба при штабах округов.

1907 – родилась дочь Елена (скончалась в 20-е годы).

1908, декабрь – присвоено звание «полковник».

1911, июнь – военный министр Сухомлинов утвердил «Положение о контрразведывательных органах» и «Инструкцию начальникам контрразведывательных органов».

1911 – русская контрразведка получила свой правовой статус, штатное расписание, финансовое обеспечение как автономная служба при штабах округов.

1912 – совместно с полковником Военной прокуратуры А. С. Резановым дорабатывает поправки к уголовному законодательству, ужесточающие наказание за шпионаж.

1912, апрель – Госдума ужесточила наказания за государственную измену «путем шпионства».

1912, 5 июля – царь утвердил новое законодательство по уголовному преследованию шпионов.

1914, июль – по «Положению о полевом управлении войск в военное время» страна искусственно расчленялась на две «отдельные части» – фронт и тыл.

1914, 1 августа – назначен начальником Разведывательного отделения штаба главнокомандующего армиями Северо-Западного фронта Н. В. Рузского.

1914, 29 августа – назначен начальником отделения управления генерал-квартирмейстера штаба М. Д. Бонч-Бруевича.

1915, 17 марта— главнокомандующий Северо-Западным фронтом Н. В. Рузский сдал дела М. В. Алексееву; нарушилась вертикаль Рузский – Бонч-Бруевич – Батюшин.

1915, 21 апреля – назначен на должность командира кавалерийского полка 4-й кавалерийской бригады.

1915, 8 августа – Северо-Западный фронт разделен на два фронта – Северный и Западный.

1915, 12 августа – отозван в Петроград в связи с назначением на должность генерала для поручений при главнокомандующем армиями Северного фронта генерал-адъютанте Н. В. Рузском.

1915, 15 августа – прибыл к новому месту службы в Петроград и вступил в должность; приказ армиям Северного фронта № 1.

1915, 15 сентября – представлен к званию генерал-майора.

1915, декабрь – присвоено звание «генерал-майор».

1916, конец мая – с разрешения царя создана оперативно-следственная комиссия по делам Рубинштейна, Абрама Доброго, Израиля Бабушкина, Иовеля Гопнера.

1916, июнь – Оперативно-следственная комиссия приступила к работе (Петроград, Фонтанка, 90). На двери рабочего кабинета Н. С. Батюшина появилась вывеска: «Комиссия генерала Батюшина».

1916, осень – втянут в разработку Распутина.

1917, март – демократическая пресса начала массовую атаку на «Комиссию Батюшина».

1917, 8 апреля – арестован.

1917, ноябрь – освобожден из-под ареста.

1918, конец года – в Белом движении. Состоял при генерал-лейтенанте Д. Н. Пархомове, начальнике штаба Крымско-Азовской армии генерала А. А. Боровского.

1919, март – после расформирования армии Боровского поступил в распоряжение штаба Вооруженных сил Юга России.