По установившейся к тому времени традиции царь Египта передал один экземпляр завещания на хранение своим союзникам и покровителям в Рим. Однако в конце пятидесятых годов до н.э. Рим и сам переживал глубокий кризис. Цезарь, победоносно завершивший войну в Галлии, теперь готовился к столкновению с фактическим соправителем Помпеем, который тогда господствовал в столице. Вспоминая о судьбе завещания Птолемея, Цезарь писал впоследствии: «Один экземпляр его завещания был доставлен его посланцами в Рим для хранения в казначействе. Однако из-за гражданских смут исполнить волю Птолемея оказалось невозможным, и завещание оказалось у Помпея. Вторая копия оставалась на хранении в Александрии». По словам Цезаря, в этом документе Птолемей заклинал римский народ во имя всех богов и во имя союза двух стран помочь обеспечить его точное исполнение.

Египтология предоставляет мало надежных данных по интересующему нас вопросу, однако сохранились некоторые папирусы 51 года до н.э. где говорится: «Тридцатый год (правления) Птолемея XII и первый год правления Клеопатры». Это позволяет сделать предположение о том, что Клеопатра, старшая наследница, получила уже в это время статус соправительницы отца. Такая практика в Египте вовсе не была новостью, и возвращение к ней объяснялось, скорее всего, резким ухудшением состояния здоровья Птолемея XII. В любом случае его правление быстро приближалось к концу.

Хотя 51 год до н.э. и считался годом совместного правления Птолемея XII и Клеопатры, но продолжалось оно всего несколько месяцев или даже недель.

Птолемей скончался не позднее мая этого же года. Однако последние папирусы, где речь идет о его «совместном» с Клеопатрой правлении, относятся к июлю того же года, и это, возможно, свидетельствует о том, что Клеопатра (как и некоторые из ее предков) какое-то время скрывала кончину отца, чтобы укрепить свою власть. Однако вскоре после этого официально началось совместное правление Клеопатры и ее брата Птолемея XIII, римляне же узнали о том, что Птолемей XII скончался, только в начале августа (см. Цицерон. Письма к друзьям).

Система дат Птолемеев не очень удобна для современных исследователей, поскольку датировка в тот период велась по царствованиям, так как считалось, что новое царствование означает и новую эпоху. Клеопатра VII и Птолемей ХIII пришедшие к власти в 51 году до н.э. не только сохраняли титулы Филадельфов, пожалованные отцом, но и добавили к ним титулы Филопаторов – «Возлюбленных (или возлюбивших) отца». Такой титул взял себе и Птолемей, которому, как незаконнорожденному сыну, хотелось подчеркнуть близость к отцу; встречался он у Птолемеев и прежде.

Клеопатра же, принимая этот титул, хотела выразить уважение к памяти отца, рядом с которым она была в самые трудные для него времена. Он, со своей стороны, сделал ее своей старшей наследницей (ведь его старший сын был еще слишком юным). В то время как старшие сестры Клеопатры предали отца, захватив власть, пока он был в изгнании, Клеопатра хотела подчеркнуть свою преданность ему (словно оправдывая собственное имя, означающее дословно «слава отца»). Несколько лет спустя после ее воцарения в финикийском городе Берите (Бейруте) была выпущена монета, посвященная не только Клеопатре (это было обычным делом), но и ее отцу, которого давно уже не было в живых (обычно подобных вещей не делалось). Конечно, и это был знак особого почтения Клеопатры к памяти ее отца. Она разделяла также его идеи и никогда не забывала его печального опыта правления своей страной, как и общения с римлянами.

Доминирующим этническим элементом в Египте, со времени его завоевания Александром, постепенно стали эллины и эллинизированное население. В отличие от своей прародины они не жили в городах-государствах, а селились в привилегированных кварталах среди коренного населения. Однако четыре египетских города представляли своеобразное исключение – здесь жили практически только эллины и эллинизированные. Старейшим из них был Навкратис в западной части дельты Нила, основанный греческими купцами еще в VII веке до н.э. а самым новым – Птолемаида в Верхнем Египте, основанная Птолемеем I Сотером. Основателем двух остальных городов – Парэтония и Александрии – был Александр Македонский.

Основанная в 332 году до н.э. Александрия стала крупным торговым центром, и именно к ней перешла роль ведущего центра средиземноморской торговли после поражения Карфагена в 1-й и 2-й Пунических войнах в III веке до н.э.

В эту эпоху Александрия стала величайшим городом Средиземноморья, и только возвышение Рима затмило этот египетский город. Он был возведен почти на границе западной пустыни, рядом с дельтой Нила, на узкой полосе земли между морем и лагуной, именовавшейся Мареотидским озером. Климат здесь был благоприятным, запасы питьевой воды обширными, и Александрия быстро превратилась в центр культуры и искусств всего греко-римского мира. Поэты прославляли этот город, а в одном из папирусов того времени утверждалось, что «Александрия – это весь мир».

Огромный многоязычный город Александрия не имел представительного совета, как обычные греческие города, а если таковой когда-то и существовал, то ко времени Клеопатры он уже давно исчез. Но город этот стал блестящей столицей царства Птолемеев, какой не имели другие эллинистические монархи. Правда, он, как и другие греческие города и поселки, был скорее продолжением Эллады, чем частью страны. Египет, по сути, начинался с Саиса, расположенного в нескольких милях к востоку от Александрии. Судя по сохранившимся папирусам, люди тогда говорили о поездках из Александрии в Египет, а римские хозяева, пришедшие на смену Клеопатре, своего наместника именовали «префектом Александрии и Египта».