На основании положений комментируемой статьи и ст. 16 комментируемого Закона Постановлением Правительства РФ от 27 ноября 2008 г. № 897 утверждено Положение о рассмотрении заявок на получение права пользования недрами при установлении факта открытия месторождения полезных ископаемых на участке недр федерального значения или на участке недр, который отнесен к участкам недр федерального значения в результате открытия месторождения полезных ископаемых пользователем недр, проводившим работы по геологическому изучению недр такого участка за счет собственных средств для разведки и добычи полезных ископаемых открытого месторождения [123] . Названное Положение согласно его п. 1 устанавливает порядок рассмотрения заявок на получение права пользования недрами при установлении факта открытия месторождения полезных ископаемых на участке недр федерального значения или на участке недр, который отнесен к участкам недр федерального значения в результате открытия месторождения полезных ископаемых пользователем недр, проводившим работы по геологическому изучению недр такого участка за счет собственных средств для разведки и добычи полезных ископаемых открытого месторождения, за исключением проведения таких работ в соответствии с государственным контрактом, а также порядок принятия решения об отказе в предоставлении права пользования участком недр для разведки и добычи полезных ископаемых юридическому лицу с участием иностранных инвесторов или иностранному инвестору при возникновении угрозы обороне страны и безопасности государства.

Согласно части 6 комментируемой статьи лицам, которым в соответствии с ч. 5 данной статьи отказано в предоставлении права пользования участком недр для разведки и добычи полезных ископаемых на участке недр федерального значения, осуществляются возмещение расходов на поиск и оценку открытого месторождения полезных ископаемых и суммы уплаченного в соответствии с условиями совмещенной лицензии разового платежа за пользование участком недр, а также выплата вознаграждения за выявление месторождения полезного ископаемого.

В части 6 комментируемой статьи также предусмотрено, что указанные выплаты осуществляются за счет средств федерального бюджета в порядке, установленном Правительством РФ. На основании данной нормы Постановлением Правительства РФ от 10 марта 2009 г. № 206 утверждено Положение о возмещении расходов на поиск и оценку открытого месторождения полезных ископаемых и суммы уплаченного в соответствии с условиями совмещенной лицензии разового платежа за пользование участком недр лицам, которым в соответствии с частью пятой статьи 21 Закона Российской Федерации «О недрах» отказано в предоставлении права пользования участком недр для разведки и добычи полезных ископаемых на участке недр федерального значения, и о выплате им вознаграждения [124] . Данным Положением наряду с прочим предусмотрено следующее.

Инвесторам возмещаются документально подтвержденные и осуществленные ими расходы на поиск и оценку открытого месторождения полезных ископаемых. В состав возмещаемых расходов включаются расходы:

а) на проведение общих и детальных поисков открытого месторождения полезных ископаемых, в т. ч. поисковых работ при геологической съемке;

б) на проведение работ по поиску и оценке открытого месторождения полезных ископаемых, в т. ч. тематических и иных исследований, связанных с геологическим изучением участка недр федерального значения и оценкой его перспектив;

в) на осуществление мероприятий по установлению факта открытия месторождения полезных ископаемых и постановке запасов полезных ископаемых на государственный баланс;

г) на компенсацию инвестором иным лицам их расходов, осуществленных на поиск и оценку открытого месторождения полезных ископаемых после выдачи инвестору лицензии на пользование участком недр;

д) на осуществление иных документально подтвержденных работ, проведенных на предоставленном инвестору в пользование участке недр федерального значения;

е) на выплату процентов, начисленных по долговым обязательствам, связанным с получением и использованием инвестором кредитных и заемных средств для финансирования работ (по кредитам, в том числе товарным и коммерческим кредитам, займам и иным заимствованиям независимо от формы их оформления), предельная величина которых равна ставке рефинансирования Банка России, увеличенной в 1,1 раза, о – при оформлении долгового обязательства в рублях и равной 15 % – по долговым обязательствам в иностранной валюте.

В составе возмещаемых расходов не учитываются расходы, которые:

а) ранее возмещены государством инвестору;

б) отнесены в состав расходов, связанных с извлечением полученных инвестором доходов и учтенных при определении налоговой базы по налогу на прибыль организаций в соответствии с гл. 25 части второй НК РФ, до даты их возмещения;

в) связаны с поиском и оценкой открытого месторождения полезных ископаемых иными лицами до даты выдачи инвестору лицензии на пользование участком недр, при выполнении условий которой инвестор эти расходы осуществил;

г) осуществлены инвестором и связаны с получением и использованием им кредитных и заемных средств для финансирования работ, за исключением указанных выше процентов.

В соответствии с заключительными положениями ч. 2 ст. 12 Федерального закона от 29 апреля 2008 г. № 58-ФЗ (в ред. от 2 мая 2015 г. № 121-ФЗ [125] ) положения ч. 5 и 6 комментируемой статьи (в ред. указанного Закона) применяются в случаях открытия месторождений полезных ископаемых после дня вступления в силу данного Закона (т. е. после 7 мая 2008 г.) и не применяются в отношении участков недр, которые расположены в Балтийском море, а также участков недр, которые предоставлены в пользование в целях осуществления геологического изучения недр, разведки и добычи полезных ископаемых, осуществляемых по совмещенной лицензии, и на которых пользователь недр завершил геологическое изучение недр и приступил в установленном порядке к разведке и добыче полезных ископаемых до дня вступления в силу данного Закона (т. е. до 7 мая 2008 г.).