DNA polymerase ### — ДНК-полимераза ###. Фермент клеток млекопитающих, состоит из двух субъединиц с суммарной молекулярной массой около 150 кД, обладает 3’-экзонуклеазной активностью.

DNA primase — ДНК-праймаза. Фермент, осуществляющий синтез РНК-затравки для последующего синтеза фрагментов Оказаки <Okazaki fragments>, а также синтез РНК-затравок в процессе синтеза репликативной формы <replication form> ДНК бактериофагов; у Е. coli кодируется геном dnaG, ее молекулярная масса составляет 60 кД; у эукариот ДНК-п. является субъединицей ДНК-полимеразы ### <DNA polymerase ###>; в отличие от обычных РНК-полимераз ДНК-п. способна использовать в качестве субстрата как рибо-, так и дезоксирибонуклеотиды; образует комплекс с другими ферментами — праймосому <primosome>.

DNA-relaxing enzyme = DNA topoisomerase (см.).

DNA synaptase — ДНК-синаптаза. Фермент, участвующий в процессах рекомбинации (по крайней мере у микроорганизмов), обусловливает (как и белок RecA) соединение между собой двухцепочечных ДНК или двухцепочечных с гомологичными одноцепочечными.

DNA topoisomerases, DNA-relaxing enzymes — ДНК-топоизомеразы, ДНК-релаксирующие ферменты, Группа ферментов, осуществляющих превращение топологических изомеров ДНК друг в друга, контролируют уровень суперскрученности ДНК. По механизму действия ДНК-Т.Т. разделяют на два типа — ДНК-Т.Т. I и ДНК-Т.Т. II (см. DNA topoisomerase I, II и III <DNA gyrase>). Для внесения одноцепочечных разрывов в ДНК все ДНК-Т.Т. используют остаток Туг, который осуществляет нуклеофильную атаку фосфатной группы ДНК с образованием фосфотирозина, что сопровождается ковалентным связыванием фермента с 3'- или 5'-концами ДНК в одноцепочечном разрыве и, в свою очередь, исключает необходимость затраты энергии при восстановлении фосфодиэфирных связей в ДНК на заключительных этапах реакции.

DNA topoisomerases I — ДНК-топоизомеразы I. Группа мономерных ферментов, релаксирующих суперскрученную ДНК без затраты энергии, путем внесения одноцепочечных разрывов. В каждом акте катализа изменяет число зацеплений ДНК на 1. ДНК-Т.Т. I разделяют на два подтипа — IA и IB, которые будучи неродственными ферментами как по первичной <primary structure of protein>, так и по пространственной структуре, выполняют одни и те же функции с использованием разных механизмов. ДНК-Т.Т. IA релаксирует только ДНК, содержащую отрицательные супервитки, работает в присутствии Мд2+ и в одноцепочечном разрыве ковалентно соединяется с 5'-концами ДНК, обнаружена у прокариот и эукариот. ДНК-Т.Т. IB релаксирует ДНК, содержащую как отрицательные, так и положительные супервитки, не требует ионов металлов и взаимодействует с 3'-концами ДНК, обнаружена только у эукариот (исключение — вирус вакцины).

DNA-agar technique — ДНК-агаровый метод. Метод анализа гомологии ДНК разных организмов: денатурированную ДНК одного из сравниваемых организмов иммобилизуют в агаре и гибридизуют с мечеными фрагментами ДНК (тысяча пар оснований) другого организма; количество гибридных молекул ДНК, сохранившихся после отмывания солевым раствором, является мерой гомологии сравниваемых ДНК; метод разработан Э.Боултоном и В.Мак-Карти в 1964.

[DNAase] hypersensitive site — сверхчувствительные [к ДНКазе] сайты. Открытые, не упакованные в нуклеосомы участки ДНК в хроматине, с которых начинается ее расщепление при низких концентрациях ДНКазы, — например, в случае целого генома Drosophila melanogaster при действии низких концентраций ДНКазы образуются фрагменты ДНК размером 2–20 тыс. пар нуклеотидов в соответствии с распределением С.с.

DNAase protection — защита от ДНКазы. Метод выявления участков ДНК, взаимодействующих с белком (например, с РНК-полимеразой в процессе транскрипции) путем разрушения ДНКазой всех не защищенных таким контактом последовательностей ДНК (для сравнения см. <footprinting>).

DNA-dependent RNA synthesis — ДНК-зависимый синтез РНК. Процесс синтеза молекул РНК на матрице ДНК; по сути, ДНК-з.с. РНК = транскрипция < transcription>.

DNA-dependent RNA polymerase — ДНК-зависимая РНК-полимераза. Фермент, осуществляющий ДНК-зависимый синтез РНК <DNA-dependent RNA synthesis>; у прокариот существует 2 типа ДНК-з. РНК-п.: ДНК-праймаза <DNA primase> катализирует синтез РНК-затравки для фрагментов Оказаки <Okazaki fragments> при репликации ДНК, в то время как РНК-полимераза синтезирует все остальные клеточные РНК; у эукариот все типы клеточных РНК (мРНК <mRNA>, тРНК <tRNA>, рРНК <rRNA>) синтезируются разными ДНК-з. РНК-п.; была открыта у нескольких эу- и прокариотических организмов (в частности, у Е. coli) С.Вайсом с соавт. в I960.

DNA-DNA hybrid — ДНК-ДНК гибрид. Двухцепочечная молекула ДНК, образовавшаяся в результате гибридизации, в том числе включающая цепи ДНК с разными последовательностями нуклеотидов (например, происходящих от разных организмов), тогда ДНК-ДНК-г. — гетеродуплекс.

DNA-relaxing enzyme = DNA topoisomerase (см.).

DNA-RNA hybrid — ДНК-РНК гибрид. Двухцепочечная молекула, состоящая из цепи ДНК и полностью или частично комплементарной ей цепи РНК, образовавшаяся в результате гибридизации (обычно при нагревании); метод получения ДНК-РНК-г., разработанный Б.Халлом и С.Спигельманом в 1961, позволил выделять и анализировать мРНК.

DNei = — Wei genetic distance (см.).

Dollo's rule — правило Долло. Концепция, согласно которой в пределах каждой эволюционной ветви эволюционный процесс необратим, — например, эволюция птиц уже никогда не приведет к появлению археоптерикса.

domain — домен. Участок полипептидной цепи белка, выполняющий какую-либо его функцию (например, цитоплазматический Д., трансмембранный Д. и т. п.); по мнению некоторых генетиков, каждый Д. кодируется участком гена, расположенным между соседними интронами <intron> (т. е. одним экзоном), что обусловливает эволюционный консерватизм положения интронов (например, в генах ###- и ###- гемоглобина млекопитающих); также Д.
– дискретный участок хромосомы, спирализующийся независимо от соседних участков (доменов), или обладающий повышенной чувствительностью к ДНКазе.

5' domain — см. domains of 16S-rRNA.

domains of 16S rRNA: central domain, 3' major domain, 3' minor domain, 5' domain — домены 16S-pPHK. Четыре элемента вторичной структуры 16S-pPHK, входящей в состав большой РНК малой субчастицы рибосом прокариот; модель f1.16S-pPHK составлена с учетом наличия консервативных функциональных последовательностей нуклеотидов; выделяют центральный домен, 5'-домен, малый и основной 3'-домены.

Dombrock blood groups — группы крови Домбрака. Система групп крови человека, основанная на параметрах эритроцитарных антигенов, кодируемых геном Do: аллель Do — доминантный, он впервые описан Й.Свонсоном в 1965.