Алексий стал первым помощником Великого князя в его борьбе за централизацию Русского государства, приложил немало усилий для устранения на Руси княжеской междоусобицы. Благодаря усилиям святителя Алексия, преподобного Сергия Радонежского и князя Дмитрия Донского в нужный момент вокруг Москвы сплотились русские княжества, и это объединение стало основой будущей победы на Куликовом поле.

Приняв постриг, Алексий погрузился в водоворот столичных забот. Феогност приблизил молодого человека к себе и поручил управление судебными делами Церкви в звании наместника митрополита. С подачи всё того же Феогноста получит сан епископа Владимирского, а позже сменит своего наставника на должности митрополита.

Несколько раз Алексий бывал в Константинополе. В том числе в феврале 1354 года с подорожной грамотой на проезд от ханши Тайдулы [16] (ханша официально приказывала ордынским властям не чинить святителю никакого вреда) для решения вопросов Московской митрополии. Второй раз в 1356 году, в разгар борьбы за титул митрополита Киевского. Именно после этой поездки произошло примечательное событие. Возвращаясь домой, Алексий и его люди попали в страшную бурю. Присутствующие оказались на волоске от гибели, но святая молитва помогла выжить. Буря прошла стороной, не зацепив корабль. После чудесного спасения, Алексий дал обет устроить храм во славу божию и славу Святого дня, когда всё это случилось (день празднования Спаса Нерукотворного). В результате этого был основан московский Спасо-Андроников монастырь на Яузе.

В 1358 году после посещения Константинополя Алексий отправился в Киев, но, попав в эпицентр религиозно-церковных распрей, был взят под арест. В плену он провел два года, подвергся самым разным мытарствам, но и это не сломило характера и не изменило деятельной натуры. Стоило Алексию оказаться дома, на родной земле, он занялся распределением епископов по местам, пустующим после моровой язвы.

Ещё до возвращения Алексия великий князь Иван II скончался и престол занял его девятилетний сын Дмитрий. Переход власти к несовершеннолетнему правителю не мог обойтись без боярских распрей, придворных интриг и страстей. Усугубляла ситуацию смута в Орде. Ярлык на Великое княжество Владимирское достался Суздальско – нижегородскому князю Дмитрию Константиновичу. Алексий стремился сохранить верность правящей династии, но взял вынужденную паузу, для того чтобы дождаться подходящего момента для осуществления своих планов. Как только такой момент настал, он успешно инициировал через московских послов пересмотр дела. В результате великокняжеский ярлык был передан двенадцатилетнему Дмитрию Ивановичу Донскому, Алексий поспособствовал заключению полезного брака Дмитрия Ивановича с Евдокией Суздальской – дочерью Дмитрия Константиновича.

Поскольку Алексий являлся сторонником традиционной политики и укрепления власти Московского великого князя (теперь в лице Дмитрия Донского) с 1367 года, он уделял много внимания разрешению конфликта с тверскими князьями и пытался уладить целый комплекс проблем, из этого конфликта вытекающих. Для устранения распрей митрополит использовал авторитет церкви: талантливо лавировал между сторонами, поворачивая ситуацию так, чтобы Москва получала наибольшую выгоду. Междоусобица есть междоусобица. Потрудиться пришлось. Однако благодаря усилиям Алексия власть Москвы признали. Договор о мире был заключен.

Всё это дела великие, дела важные. Но не только о крупных политических свершениях стоит вспомнить, говоря о личности Алексия. Настал момент, когда рассказы о чудесах им творимых, достигли Орды. Произошло это по воле Господа в тот самый момент, когда любимая супруга хана Джанибека заболела. Болезнь Тайдулы оказалась тяжёлой и привела к слепоте. Тогда хан обратился к Алексию за помощью. Естественно, обратился так, как мог обратиться хан. Выбора у святителя не оставалось. Либо согласиться помочь, либо…

Долго Алексий не думал, сразу стал собираться в дальний путь. Согласно легенде, накануне отъезда во время службы сама собой зажглась свеча при гробе чудотворца Петра. Алексий разделил эту свечу на множество частей и раздал всем присутствующим, а из остатков слепил маленькую свечку, которую прихватил с собой в дорогу. 18 августа 1357 года Алексий покинул Москву, а в это же время ханша Тайдула видела чудесный сон, предвещающий скорое выздоровление.

Прибыв на место, митрополит отслужил над болящей молебен. Используя ту самую свечу, прочитал необходимые молитвы и окропил женщину святой водой. Было ли это чудо мистического характера или обладающий знаниями Алексий применил какие-то медицинские навыки, необходимые для исцеления, легенда умалчивает. Но Тайдула пошла на поправку. Растроганный хан отблагодарил Алексия и преподнёс в подарок ханский перстень. Сама ханша пожаловала участок на территории Московского Кремля, ранее принадлежавший ордынскому посольскому двору. На этом участке Алексий и построил храм во имя Чуда Архангела Михаила в Хонех, на основе которого позже будет организован Чудов монастырь, нежно любимый митрополитом. Но самое главное, что в лице Тайдулы Русь обрела надёжную заступницу. Несколько позже, когда Джанибека убил его собственный сын Бердибек, в Москву явился посол нового хана и потребовал от русских князей даров. Смягчать гнев Бердибека снова был отправлен Алексий. Беду удалось отвести благодаря его успешному взаимодействию с Тайдулой, которая добра не забыла. В результате переговоров, Алексий получил ярлык и охрану русского духовенства. По определению некоторых учёных, Алексий максимально долго сохранял лояльность по отношению к Орде, понимая, что худой мир, лучше (выгоднее) доброй ссоры. Не обходилось и без хитрости. Соблюдая лояльность к верховной власти мусульманских правителей, в тоже время Алексий последовательно проводил политику, направленную на создание союза русских княжеств для последующей борьбы с Ордой.

Алексий умел не только праведно молиться и творить чудеса исцеления. Это был мудрейший человек, сильный дипломат (дипломатия – ещё один конёк Плещеевых), талантливый политик. За всё Алексий брался основательно, с пониманием дела.

Кроме этого, святитель занимался устройством иноческих обителей и храмов. В том числе развивал монастыри общежительного типа. В 1357 году им основан Спасо-Андроников монастырь. Согласно преданию, примерно в 1358 (по другим версиям в 1360/61 гг.) Алексий по просьбе сестёр Иулиании и Евпраксии создал Ново-Алексеевский Зачатьевский девичий монастырь (на Остоженке). Принято считать, что это был один из первых женских общежительных монастырей в Москве, а Иулиания приняла сан настоятельницы. В 1362 году святителем основан Введенский Владычный монастырь под Серпуховом. Кроме строительства новых Алексий неоднократно восстанавливал обители, пришедшие в упадок. Им восстановлены Благовещенский монастырь в Нижнем Новгороде и Константино-Еленской во Владимире. В обоих введено общежитие. В 1365 году основан упомянутый Чудов монастырь в Хонех. Между 1375–1377 гг. Алексий обустроил Симонов монастырь, столь востребованный в опричную эпоху. Возможно, именно Алексий воздвиг над могилами своих сестер церковь Неопалимой Купины [17] .

По-житейски мудрый Алексий, советовал Великому князю построить каменный Кремль, чтобы усилить защиту от пожаров и вражеских набегов.

Святитель ушёл из жизни 12 февраля 1378 года. Алексий завещал погрести своё тело в Чудовом монастыре «за алтарем». Но Дмитрий Донской распорядился иначе. Бывшего своего опекуна с почестями похоронил в самой церкви, а не за её пределами. При Василии Тёмном во время литургии рухнула деревянная крыша храма Архистратига Михаила. В 1431 году, в процессе глобального ремонта были обретены мощи святителя. Мощи оказались чудесным образом не тронуты тленом. Перезахоронили Алексия в новом каменном храме, в приделе Благовещения Пресвятой Богородицы. В дальнейшем мощи переносили несколько раз. В наше время они обрели постоянное место упокоения в Елоховском соборе Москвы.