В 1560 году наступление русских войск в Ливонии во­зобновилось. Был взят Маринебург (Алуксне). Как писал Скрынников, «царские воеводы разгромили отборное ры­царское войско под Эрмесом и заняли резиденцию маги­стра — замок Феллин. Победителям досталась почти вся орденская артиллерия. Военные силы Ливонии были со­крушены. По всей Эстонии крестьяне восстали против не­мецких баронов».

Как отмечалось во «Всемирной истории», «эстонский и латышский народы, видевшие в русских своих союзников и защитников в борьбе против ненавистных угнетателей, выступали в начальный период Ливонской войны с оружи­ем в руках против своих немецких господ, оказывали по­мощь и содействовали русским войскам. Осенью 1560 года эстонские крестьяне подняли против немецких фео­далов восстание, которое приняло значительные размеры и потребовало немалых усилий для его подавления».

Однако, как отмечал Скрынников, «Адашев и его това­рищи не использовали благоприятной обстановки, опаса­ясь удара со стороны находившихся под Ригой литовских войск. После неудачной осады небольшого замка Пайды (Вейсенштейна) наступление русских войск приостанови­лось».

Поражениями ордена воспользовались Дания и Шве­ция. Дания захватила Сааремаа-Ляанемааское епископ­ство, а Швеция овладела Таллином и стала расширять свою власть в Северной Эстонии.

Стараясь предотвратить создание широкой антирус­ской коалиции, правительство Ивана Грозного заключило союзный договор с Данией и 20-летнее перемирие со Швецией.

В 1561 году магистр Ливонского ордена стал вассалом польского короля, а в 1562 году орден прекратил свое су­ществование. Возглавил Курляндское герцогство ма­гистр ликвидированного ордена Кеттлер, потомки которо­го продолжали им управлять, хотя их права были урезаны так, что это герцогство называли «дворянской республи­кой». Курляндское герцогство долго оставалось вассалом Польши.

Война переместилась за пределы Ливонии. В первых числах февраля 1563 года русские войска осадили Полоцк и добились его сдачи. Под Полоцком русские подписали перемирие с Литвой.

После заключения перемирия царь Иван, по словам Скрынникова, «вызвал в Москву королевских послов и ре­шительно потребовал от них очищения Ливонии до Двины. Послы отклонили эти требования и выехали на родину. Следом за ними в Литву двинулись царские рати».

Однако в правящих кругах Русского государства не было единства. При этом, как это уже было не раз на про­тяжении ряда последних столетий, враги царя искали под­держку в Литве. Скрынников писал: «Оттесненная от кор­мила власти, но все еще не сокрушенная удельно-бояр­ская оппозиция все чаще обращала свои взоры в сторону Литвы... Оттуда ждали помощи те, кто подумывал об устранении царя Ивана. Тревога властей по поводу лито­вских связей возрастала по мере того, как сражение на русско-литовской границе приобретало все более ожес­точенный характер. В конце концов царь заподозрил в из­мене своего двоюродного брата князя Владимира. Подо­зрения имели основания. В то самое время, когда царская армия и старицкие удельные полки скрытно двигались к Полоцку, из царской ставки бежал знатный дворянин Бо­рис Хлызнев-Колычев, предупредивший полоцких воевод о намерениях Грозного».

Возможно, что подобным образом литовцы сумели уз­нать и о военных планах Грозного после взятия им Полоц­ка и смогли предотвратить соединение двух русских ар­мий, одна из которых шла от Полоцка, а другая — из Смо­ленска. В битве под Улой 26 января 1564 года литовцы разгромили полоцкую армию. В апреле 1564 года в Литву бежал друг царя князь Андрей Курбский. Осенью 1564 году был совершен набег войск крымского хана Девлет- Гирея, разоривших русские земли.

Воспользовавшись трудностями России, в Москву в 1566 году прибыло посольство Литвы, предложившее раз­делить Ливонию на основе фактического положения войск. Однако созванный в том же году Земский собор предложил царю вести войну «до победного конца».

Готовясь к новым боям, Литва пошла на Люблинскую унию с Польшей, следствием которой было создание в 1569 году единого государства — Речи Посполитой. В том же году турецкая армия совершила поход под Астрахань, а в 1571 году Девлет-Гирей совершил набег на Москву.

Несмотря на все эти неблагоприятные события, Рус­ское государство вскоре возобновило наступление в Ли­вонии. Новым врагом России с 1570 года стала Швеция. Поддержав брата датского короля Магнуса, поставленно­го русскими во главе созданного ими в Ливонии «королев­ства», войска Ивана Грозного и Магнуса взяли 1 января 1573 года опорный пункт шведов в Прибалтике — Пайду (Вейсенштейн), затем — Пернов (Пярну). К 1576 году Рос­сия овладела всем прибалтийским побережьем, за исклю­чением Ревеля и Риги. Одновременно правительство Ива­на Грозного вело переговоры с императором Австрии Максимиллианом о ликвидации Люблинской унии и рас­членении Речи Посполитой. Зимой 1575/76 года в Москву прибыло австрийское посольство. Однако Максимиллиан отказался признать права России на Прибалтику.

В 1577 году начался новый поход русских войск в Ливо­нию. В этом году была предпринята осада Ревеля, и летом взяли бывшую резиденцию магистра Ливонского орде­на — Венден (Цесис).

Однако в 1579 году начался поход на русские земли но­вого польского короля — Стефана Батория, который су­мел взять Полоцк, Великие Луки, а в 1581 году осадил Псков. В том же 1581 году шведы взяли Нарву.

Лишь героическая оборона Пскова сорвала планы Ба- тория двигаться дальше на Новгород и Москву. В 1582 году было заключено 10-летнее Ям-Запольское переми­рие между Россией и Речью Посполитой. Все завоевания в Ливонии были Россией утрачены. Полоцк и Ливония от­ходили к Речи Посполитой, но русские земли, захвачен­ные войсками Батория, возвращались России.

В 1583 году было заключено Плюсское перемирие со шведами, по которому к Швеции перешли Нарва, Ям, Ко- порье и Ивангород.

24-летняя Ливонская война завершилась. Инициатор войны — Россия ничего не получила от этой войны. Напро­тив, она потеряла ряд земель, понесла большие людские потери, а хозяйство страны было подорвано непомерными военными расходами. Объект борьбы — Ливония переста­ла существовать как государственное образование, но эс­тонцы и латыши не освободились от ига иноземцев. По­следствием Ливонской войны явилась и ликвидация само­стоятельного Литовского государства, и превращение его в часть Речи Посполитой с ограниченной автономией. Утверждалось, что в 1569 году литовские магнаты оплаки­вали «погребение и уничтожение на вечные времена воль­ного и независимого некогда Великого княжества Лито­вского».