Новый этап в развитии контрразведки на Севере России связан со свержением советской власти в Архангельске 2 августа 1918 года, которое осуществилось во многом благодаря активной деятельности подпольной офицерской организации, возглавляемой капитаном 2-го ранга Е.Г. Чаплиным.

Несмотря на существовавшие различия, в целом же контрразведка Белого Севера организовывалась по тому же принципу, что и в других регионах страны — на Юге и в Сибири. Политически нестабильная ситуация, отсутствие территориальных органов безопасности привели к расширению функций военно-регистрационного отделения. Помимо решения основных задач (борьбы с военным шпионажем и диверсиями) ему вменялось в обязанность следить за настроением войск, противодействовать большевистской агитации среди солдат, нести охрану складов, военных объектов, путей сообщения, осуществлять контроль над перемещением населения на территории Северной области. Нормативно-правовой основой организации и деятельности военно-регистрационного отделения послужило «Временное положение о правах и обязанностях чинов сухопутной и морской контрразведки по производству расследований» 1917 г. [90] , которое потом было дополнено рядом инструкций.

На начальном этапе строительства контрразведывательных органов сотрудники пользовались «Инструкцией чинам военно-регистрационного отделения на кордонах», пункты которой в основном касались правил проверки документов, а также требований направлять задержанных лиц в распоряжение милиции. Этот документ подтверждает мнение М.К. Рындина о превалировании безагетурных методов работы над агентурными. Данная инструкция была составлена после инспекции контрразведывательной службы Селецкого войскового района, проведенной заведующим наружной службой наблюдения ВРО К.В. Мельниковым: «При обозрении Селецкого района усматривается масса дорог и тропинок, по которым весьма и весьма часто пробиваются сюда агенты-разведчики (большевики), что конечно влечет и уже влекло массу печальных для нас последствий. Все это я лично приписываю исключительно тому, что здесь нет буквально никакого контроля ни на дорогах, ни в местностях, где можно пробраться отсюда к большевикам и обратно» [91] .

Обращает на себя внимание «Инструкция по руководству агентурой», которой, в частности, классифицировались источники информации: «Основаниями к агентурному исследованию и дальнейшему дознанию могут служить: 1) личные наблюдения агентов; 2) сообщения официальных мест и лиц; 3) сообщения частных лиц; 4) анонимные сообщения» [92] .

Свои обязанности контрразведка выполняла на основе целого комплекса источников: донесений собственных агентов; полицейских органов; перлюстрации; радиоперехвата; сведений, полученных от частных лиц. Получение информации от союзных контрразведок (американской, английской, бельгийской и французской) было ограниченным. Более того, военно-регистрационное отделение находилось в зависимости от контрразведывательных органов интервентов, которые держали под своим надзором всех граждан Северной области, арестовывая их под видом большевиков и военнопленных. Даже мелкие, незначительные вопросы коллежский асессор М.К. Рындин и его подчиненные согласовывали с союзным военным контролем, что вызвало недовольство руководителя ВРС. По его словам, союзная контрразведка, «руководимая чуждыми нам мотивами, совершенно не в состоянии справляться со своей сложной задачей: общество было взволновано и озлоблено массовыми насильственными арестами граждан и военнослужащих» [93] . В то же время не знакомая с местными условиями иностранная контрразведка оказалась не в состоянии справиться «со своей сложной задачей» [94] .

Исследователи отмечают нежелание сотрудников союзного военного контроля, особенно англичан, выполнять законы и постановления, принятые Временным правительством Северной области, что «негативно сказывалось на установлении профессиональных контактов с русскими коллегами». Согласно докладу разведчика X. Мартина, «британцы были склонны обращаться с русскими как с низшими» [95] .

Временный штат контрразведки был утвержден врид командующего войсками контр-адмиралом Н.Э. Викорстом только 6 ноября 1918 года. Военно-регистрационное отделение состояло из 81 человека. При нем имелись: военно-контрольная команда и команда наблюдателей. Максимальное количество ее чинов было установлено в 30 человек, военно-контрольной команды — 75. Личный состав в эти подразделения набирался по мере надобности, определяемой руководством контрразведки. 16 декабря 1918 года был создан Чекуевский особый контрольный контрразведывательный пункт (1 июня 1919 года переименован в Онежское отделение военно-полевого контроля), несколько позже — Селецкий и Обозерский военно-контрольные пункты. Для ведения контрразведывательной деятельности в малонаселенных или отдаленных районах области, где создавать военно-контрольные пункты было нецелесообразно, приходилось прибегать к услугам отдельных агентов [96] .

После преобразования военно-регистрационного отделения в военно-регистрационную службу ее центральный аппарат состоял из общей канцелярии, отдела дознания и регистрационной части (заведующий специальной регистрацией, регистрационный отдел, фотографический отдел и отдел пропусков). Ей подчинялись служба Архангельского военно-контрольного района, военно-регистрационное бюро в Онеге, Обозерский, Чекуевский, Селецкий и Емецкий военно-контрольные пункты, Архангельское, Холмогорское, Пинежское, Двинское, Онежское, Тарасовское, Железнодорожное, Мезенское, Тыловое, Мурманское отделения.

Численность военно-регистрационной службы, имевшей пирамидальную структуру, доходила до 450 человек (в октябре 1919 года в центральном аппарате числилось 115 сотрудников вместе с рассыльными и сторожами) [97] .

По подсчетам историка А.А. Иванова, в июне 1919 года в войсках Северной области на одного контрразведчика приходился 101 военнослужащий, а в 6-й Красной армии на одного сотрудника особого отдела—223, что демонстрирует численное превосходство белых над красными [98] .

Историк отмечает также относительную независимость от центральной администрации отдельных региональных органов военного контроля. По его мнению, некоторой автономией от Архангельска пользовались Мурманское военно-регистрационное бюро (до его включения в структуру штаба 2-го пехотного полка в начале 1919 года), получавшее финансирование от союзников и местной администрации, и военно-контрольный район под командованием капитана М.В. Бастракова [99] .

С целью повышения эффективности работы контрразведки 1 июня 1919 года генерал-лейтенант Е.К. Миллер утвердил штат и «Временное положение о полевом военном контроле», на который возлагались задачи по обнаружению, предупреждению и пресечению деятельности агентов советской власти и содействующих им лиц в пределах Северной области. Учреждались полевые и тыловые отделения военного контроля. Первые действовали в районах дислокации войск, вторые — в тылу [100] .

Согласно инструкции начальникам отделений полевого военного контроля в войсковых районах, утвержденной 28 июня 1919 года, на них возлагались задачи по сбору информации о состоянии расположенных в зоне их ответственности воинских частей, об отношениях между офицерами и солдатами, их настроениях, политических взглядах и т. д.

Аналогичные сведения собирались и в отношении жителей населенных пунктов [101] .

В августе 1919 года генерал-лейтенант Е.К. Миллер издал приказ, ужесточавший наказание для гражданских лиц, мешавших работе сотрудников ВРС.