В то же время войска Уэрты терроризировали села и вовсю мародерствовали, политические убийства стали повседневностью. Правительство Уэрты обрушилось с репрессиями на рабочее движение, попыталось расправиться с партизанами – однако результатом стало лишь усиление революционного движения. В июле 1914 года под давлением США Уэрта ушел в отставку и был выслан за пределы Мексики, временным президентом Мексики был назначен Карбахал. Обладая незаурядными военными способностями, Сапата сыграл большую роль в свержении контрреволюционного правительства Уэрты.

К тому времени Северная дивизия Вильи захватила город Сакатекас, войска конституционалистов Обрегона взяли Гвадалахару и Куэретаро и продвигались к Мехико. В июле 1914 года отряды Вильи и Сапаты, насчитывающие 70 тысяч бойцов, заняли столицу. Но у повстанческих лидеров к тому времени назрел острый конфликт с новым президентом. Карранса отправил Вилью в отставку, Сапата же не признал Каррансу «первым вождем». Официальная пресса изображала партизан Вильи и Сапаты как обычных уголовников, которые занимались грабежами и убийствами в столице.

Когда Вилье, еще до взятия Мехико, предлагали стать во главе революционного правительства, он категорически отказался, заявив, что его задача – отдать крестьянам землю, а для руководства страной он недостаточно образован и вообще считает власть занятием, недостойным честного человека. В августе 1914 года временный президент Карбахал бежит за пределы Мексики, и войска генерала Обрегона вступают в столицу. Генерал Обрегон провозгласил Каррансу «первым руководителем» Мексики. Однако Конгресс отправил в отставку президента Каррансу и назначил временным президентом Мексики генерала Гутьерреса.

В сентябре 1914-го Вилья объявляет о своем конфликте с Каррансой и Обергоном и обращается к Сапате с предложением начать совместную борьбу против новых правителей. В сентябре – ноябре 1914-го вспыхнула война революционной группировки Вильи и Сапаты против «умеренных» Каррансы и Обрегона.

В начале декабре 1914 года состоялась встреча лидеров враждующих группировок для формирования нового правительства страны. Руководители не пришли к соглашению, и повстанческая армия Вильи и Сапаты вновь заняла Мехико, оттеснив войска Каррансы и Обрегона к Веракрусу. Однако в январе 1915 года войска Каррансы и Обрегона выбили отряды Вильи и Сапаты из столицы. Через месяц Карранса договорился с лидерами анархо-синдикалистов о «борьбе с реакцией во имя революции». На борьбу против повстанцев Вильи и Сапаты были брошены «красные» рабочие отряды анархистов-синдикалистов.

Генерал Обрегон в сражении 13–15 апреля 1915 года одержал победу над повстанческой армией Вильи, остатки которой, взорвав железную дорогу, начали отход в Чиуауа. В момент решающих боев Сапата не поддержал своего союзника, сославшись на то, что в его освободительной армии (50 тысяч бойцов) не хватает патронов и снарядов. В ноябре 1915-го правительственными войсками были разгромлены последние крупные группировки Вильи, после чего тот перешел к партизанским действиям, разбив свою армию на мелкие боевые отряды.

В июле 1915 года с юга на Мехико двинулись армия Сапаты, ненадолго захватила столицу, но была выбита правительственными войсками. В конце 1915 года армия Сапаты была полностью разгромлена.

В январе 1916 года повстанцы Вильи убили 16 граждан США, а в марте 1916-го отряд Вильи в 500 всадников ночью перешел границу Мексики и США и внезапным ударом захватил город Колумбус (штат Нью-Мехико). Вилья, провозгласив лозунг «Мексика для мексиканцев!», рассчитывал столкнуть мексиканское правительство с правительством США, что могло бы вызвать новый всплеск революции. Вскоре мексиканцы были выбиты кавалерийским отрядом американцев из Колумбаса. Это стало поводом для вмешательства США в борьбу против повстанцев. С согласия президента Мексики 12-тысячная армия генерала Першинга перешла мексиканскую границу с целью уничтожить «армию» Вильи. Вилья принимает активное участие в борьбе с интервентами, иногда становясь на сторону правительственных войск, которые тоже оказывали сопротивление воинским подразделениям из США. Правительство США, опасаясь, что Мексика может вступить в Первую мировую войну на стороне Германии, вывело свои войска из северных штатов Мексики.

До 1919 года Вилья вел партизанскую войну против помещиков севера Мексики и правительства Каррансы. Под давлением широкого крестьянского движения в 1917 году в мексиканскую конституцию был внесен ряд параграфов, отражавших интересы крестьянства. Карранса, издав закон об охране труда промышленных рабочих и опираясь на соглашение с руководством анархо-синдикалистов, использовал созданные синдикалистами «красные батальоны» для борьбы с повстанцами, которые в 1917 году были полностью разгромлены. За ненадобностью «красные батальоны» были распущены.

Сапата был убит 10 апреля 1919 года близ городка Куэрнавака при попытке покушения на президента Каррансу. Вилья в 1920 году отошел от политической борьбы и поселился на своей фазенде. 20 июля 1923 года в Идальго-дель-Парраль (штат Чиуауа) Вилья пал от руки наемного убийцы.