В целом боевой состав подводных лодок 14-й дивизии обеспечивал полное превосходство над любым противником в Черном море. Но к концу 1996 г. произошло следующее: в составе флота осталась одна (!) боеспособная подводная лодка. Дизельная торпедная подводная лодка с экспериментальным водомерным двигателем Б-87Г смогла только в 1996 г. получить долгожданные аккумуляторы и начать практические выходы в море.

Вторая торпедная лодка — Б-435 (с 1997 г. «Запорожье») — стояла у плавпирса и в лучшем случае могла быть использована для учебных целей из-за невозможности погружаться и отсутствия аккумуляторов.

Третья лодка — Б-380 («Горьковский комсомолец») — в 1991 г. поставлена к причальной стенке Севморзавода для капитального ремонта.

19 февраля 1992 г. название «Горьковский комсомолец» было упразднено. Лодка предназначалась к передаче Украине, но ввиду плохого технического состояния Б-380 Киев отказался принять ее.

В 2000 г. правительство РФ решило отремонтировать Б-380 и ввести в боевой состав Черноморского флота. Лодка была введена в плавдок ПД-16. В 2008 г. ей присвоили имя «Святой князь Георгий». Увы, хоть средства на ее ремонт отпускались регулярно, на май 2014 г. она так и стояла в ПД-16 под гордо развевающимся Андреевским флагом.

Спустя 14 лет после начала ремонта вопрос о вводе Б-380 в боевой состав флота уже не стоит, ее хотят обратить в плавучую зарядовую станцию. Но, увы, трофейный германский док ПД-16 прогнил, и адмиралы с инженерами уже несколько лет думают, как его затопить, чтобы не пострадала лодка и не развалился док.

Остатки подводных сил Черноморского флота представляют три подводные лодки (СС-533, СС-226, СС-310) и переоборудованная в плавучую зарядовую станцию ПЗС-50 подводная лодка С-49, призванная заменить списываемую ПЗС-63.

Судьба остальных лодок Черноморского флота вкратце прослеживается следующим образом. «Варшавянки» (Б-177; Б-459; Б-471; Б-300) и пр. 641Б (Б-437, Б-498) были переведены к 1991 г. на Север, а отправленная на ремонт в Ленинград БС-555 в 1996 г. была разобрана на металл из-за отсутствия средств на ее модернизацию. В 1991 г. на слом в Турцию или Инкерманскую судоразделочную базу в Севастополе отправились субмарины: С-76; С-96; С-100; С-172; С-197; С-230; С-234; С-296; С-339; С-344; С-383 (пр. 613), Б-59 (пр. 641). Из состава флота вывели ракетную подводную лодку Б-318. Часть вышеназванных лодок класса «Виски» была списана до 1990 г. и не указана в перечне. В 1991 г. на слом пошли С-74; С-287; С-379 (пр. 613) и выведена из состава флота большая специальная лодка БС-153, на которой проводились испытания баллистических ракет РСМ- 52 комплекса Д-19. На следующий год были разобраны подводные лодки Б-6 и Б-105 (пр. 641), С-11 и С-37 класса «Ромео», С-70 и С-243 (пр. 613). В 1993 г. флот потерял С-384 (пр. 613) и Б-36 (пр. 641), а в 1994 г. сданы для разборки на металл Б-109; Б-326; Б-854 (пр. 641), С-128 (пр. 633КС) и С-376 (пр. 513). В 1995 г. была списана Б-67 (пр. 651) и разобрана Б-9, предназначенная для ВМС Украины, Лодка-мишень СС-256 также предназначалась для Украины и была основательно разграблена. Однако Украина от нее отказалась. 1 декабря 1997 г. СС-256 исключена из состава флота и в декабре 1999 г. отбуксирована в Очаков для разделки на металл.

Две ремонтирующиеся в Болгарии на заводе «Арсенал» (порт Варна) субмарины класса «Фокстрот» Б-41 и Б-326 из-за отсутствия финансирования были проданы на металл за долги.

Главную ударную силу Краснознаменного Черноморского флота в 1990 г. представляли 150-я бригада надводных кораблей и 30-я дивизия надводных кораблей (ДИНК), базировавшиеся на Севастополь.

В состав 150-й бригады входили два ракетных крейсера: «Слава» (пр. 1164) и «Адмирал Головко» (пр. 58), два больших ракетных корабля: «Сдержанный» (пр. 61М) и «Неуловимый» (пр. 56У), а также два больших противолодочных корабля — «Скорый» (пр. 61) и «Проворный» (пр. 61Э). Но в конце 1990 г. РКР «Слава» был отправлен в Николаев на капитальный ремонт и модернизацию. РКБ «Неуловимый» и БПК «Проворный» были выведены в резерв, а затем сданы на слом. Оставшиеся три единицы влились в состав 30-й дивизии, а сама 150-я бригада надводных кораблей прекратила свое существование.

13 ноября 2002 г. на крейсере «Адмирал Головко» спустили флаг. Затем корабль отправили на металл, хотя по техническому состоянию он мог прослужить еще несколько лет.

Одновременно была переформирована и 30-я дивизия противолодочных кораблей, в составе которой на начало 1990 г. числились 16 кораблей: два противолодочных крейсера — «Москва» и «Ленинград»; БПК «Очаков», «Керчь», «Азов», «Комсомолец Украины», «Красный Кавказ», «Красный Крым» и «Сметливый»; сторожевые корабли «Пытливый», «Разительный», «Беззаветный», «Безукоризненный», «Деятельный», «Ладный» и «Пылкий». В 1990 г. ПКР «Ленинград» был выведен в резерв, а в 1992 г. продан в Индию на слом. В том же году в Севастополе на базе «Вторчермета» в Инкермане разобрали «Комсомольца Украины» (пр. 61), а в 1994 г. продали на слом в Индию БПК «Красный Крым» (пр. 61) и исключили из состава флота СКР «Деятельный» (пр. 1135).

Итогом флотских перестановок стало формирование в ноябре 1994 г. 30-й дивизии противолодочных кораблей из двух новых бригад надводных кораблей: 11-й и 21-й.

26 мая 1993 г. состоялся последний выход крейсера «Москва» на боевое дежурство в Черное море. В июне 1995 г. крейсер был переформирован в плавказарму ПКЗ-108. 27 мая 1997 г. «Москву» на буксире вывели из Севастополя и отправили на разборку в Индию.

Сторожевые корабли «Беззаветный», «Безукоризненный» (пр. 1135) и «Разительный» (пр. 1135М) по предварительному разделу флота должны были отойти к Украине. Предстоящая передача повлекла за собой полное разграбление сторожевиков, и как боевые единицы они перестали существовать. Сторожевой корабль «Пылкий» был переведен в Ленинград, модернизирован и включен в состав Балтийского флота. Капитальный ремонт «Москвы» (бывшей «Славы») затянулся, а законсервированный СКР «Решительный» (пр. 61) стали использовать на запчасти для остальных «систершипов» своего проекта. БПК «Очаков» также был небоеспособен из-за многолетнего капремонта и пожара во время пребывания на Севморзаводе.

БПК «Азов» (пр. 1134БФ) был крайне изношен и небоеспособен. В 2000 г. он был выведен из состава флота и к июню 2002 г. разделан на металл в Инкермане.

Сторожевые корабли «Красный Кавказ» и «Скорый» нуждались в капитальном ремонте и восстановлении.

После многолетнего капремонта еще не вошел в строй и модернизированный СКР «Сметливый», сданный Севморзаводом с недоделками.

Модернизация БПК «Сметливый» завершилась в 1995 г. Вместо кормовой артиллерийской установки и вертолетной площадки был установлен комплекс неакустического обнаружения подводных лодок МНК-300 с 300-метровой буксируемой антенной, воспринимающей тепловой, радиационный и шумовой сигнал подводной лодки, в районе ходовой рубки размещены постановщики помех ПК-10 и ПК-16, добавлено несколько новых РЛС и система управления ПКРК, 5 x 533 мм торпедные аппараты заменены на 7 x 406 мм. В 2002 г. на месте двух РБУ-1000 установили 8 направляющих для контейнеров противокорабельных ракет «Уран». Полное водоизмещение корабля достигло 4900 т.