Вечером 28 ноября Бернадот получил приказ отходить к Брно и, совершив 36-часовой марш-бросок, соединился с главными французскими силами в Моравии, чтобы 2 декабря 1805 года успеть принять участие в знаменитом Аустерлицком сражении. Немецкий биограф Бернадота А.-Э. Имхоф считает роль 1-го корпуса при Аустерлице (Славкове) не достаточно ясной. С ним соглашаются многие другие историки, включая шведских, которые пишут, что его вклад в успех французской армии оказался недостаточным.

Бернадот участвовал в битве с не более, чем 10 500 чел., кавалерийскую дивизию Келлермана у него отобрали, и 1-й корпус располагал под Аустерлицем лишь пехотой. Бернадот стоял в центре французских позиций, Ланн и Мюрат были справа, а Сульт и Даву — слева от него. В бой 1-й корпус вступил после корпуса Мюрата и то лишь в половинном составе, и о его роли косвенно могут свидетельствовать его потери: всего 86 человек убитыми и 360 — ранеными, в то время как потери в корпусе Ланна измерялись соответственно 583 и 3854, а у Даву, участвовавшего в сражении лишь одной своей дивизией, — 325 и 1165 человеками.

А. Палмер и некоторые мемуаристы, напротив, утверждают, что когда Бернадот, получив приказ выдвинуться к Сокольницам, на свой страх и риск пошёл на Пратценские высоты, он тем самым внёс решающий вклад во французскую победу. Он послал на помощь Сульту одну из своих дивизий, после чего в битве наступил перелом. По мнению А. Блумберга, рьяного панегириста Бернадота, когда русская гвардия была вынуждена отступить, маршал предпринял энергичную кавалерийскую атаку и во многом способствовал прорыву русского фронта (откуда у Бернадота появилась кавалерия, если её перед сражением у него отобрали?). С другой стороны, нет никаких признаков, указывавших и на то, что Наполеон после Аустерлица остался Бернадотом недовольным.

Давая своим маршалам последние распоряжения о порядке сражения, Наполеон по отношению к Бернадоту принял демонстративно сухой и деловой тон. Император в окружении маршалов Мюрата, Ланна, Мортье, Лефевра, Сульта, Даву и Бернадота пытался во всём подчеркнуть своё превосходство над ними, но как он боялся всех этих выдающихся военачальников! Все они не раз слышали, как он говорил, что предпочёл бы иметь дело не с ними, а с серыми посредственностями.

После заключения Прессбургского84 мира 26 декабря 1805 года французская армия осталась на своих местах. Франция оставалась державой, господствующей на суше, в то время как Трафальгарское сражение двумя месяцами раньше подтвердила статус Англии как ведущей морской державы. Но антифранцузская коалиция распалась в очередной раз, а Пруссия, не успев вступить в эту войну, заключила с Францией наступательно-оборонительный союз.

23 февраля 1806 года корпус Бернадота, которму были приданы корпус Мортье и кавалерийские дивизии Нансути и Бурсье, во исполнение приказа Наполеона-Бертье нарушил суверенитет княжества Ансбах-Байрейт, фактически принадлежавшего союзнику Пруссии. Территорию княжества маршал Бернадот использовал для удобного маневра в тыл австрийцам. Оккупировав княжество, Наполеон отдал его Баварии, а Пруссии в качестве компенсации предложил Ганновер. Оскорблённый кайзер Фридрих Вильгельм III ответил на этот вероломный шаг Наполеона занятием Ганновера и пропуском русской армии через Силезию.

Дни нахождения Пруссии в одном лагере с Францией были сочтены.

В целом пребывание Бернадота в Ансбах-Байрете напоминало его жизнь в Ганновере. На местах оставались прусские администраторы и чиновники, в то время как маршал являлся французским наместником. Задача Бернадота в «маркграфстве Байрет», как теперь называлось княжество, была достаточно деликатной: нужно было соблюсти интересы Франции, не поссорившись ни с Берлином, ни с Мюнхеном. Берлин не имел желания передавать баварцам всю территорию княжества, а уступал им только ту её часть, которая называлась собственно Ансбахом, в то время как территория Байрет рассматривалась им как личное владение своего короля. Баварцы, естественно, настаивали на получении всего куска пирога. Пруссаки хотели договориться обо всём наедине с баварцами, в то время как баварцы всё время апеллировали к помощи Парижа. Бернадот, несмотря на свою явную предрасположенность к Пруссии и нелюбовь к баварцам, с этой задачей успешно справился. Он сумел завоевать расположение в обеих столицах и поддерживать хорошие отношения как с представителем Пруссии в его администрации, тайным советником-легатом Наглером, в чью единственную задачу входило саботировать любое начинание в пользу Баварии, так и с делегатом Баварии, графом Тюрхеймом. Наглер не мог нарадоваться на маршала, в то время как Тюрхейм на него не переставал жаловаться. Неприязнь Бернадота к баварцам, по мнению Тюрхейма, объяснялась его неудачным опытом командования баварской армией и «неблагодарностью» баварцев, которые якобы не оценили его заслуги в деле приобщения Ансбаха в лоно Баварии и, минуя его, искали совета и помощи у Бертье и Наполеона. Впрочем, граф признавал, что Бернадот выгодно отличался от Мортье и Даву, и успешно употреблял «нетрадционные» средства оказания влияния на Бернадота, включая «приношения», ордена и... деньги. Баварский министр иностранных дел действовал, однако, так неуклюже и грубо, предлагая Бернадоту взятку в размере 100 тыс. далеров, что маршал, только что обласканный самим королём Пруссии и награждённый прусским орденом Чёрного Орла с бриллиантами, был вынужден вежливо отказаться от неё, уведомив об этом курфюрста Максимилиана Йозефа.

Однако дело всё равно решилось в пользу Баварии. На Бернадота из Мюнхена стал давить Бертье, а из Парижа медленным процессом передачи Ансбаха выразил своё недовольство Наполеон. В конце концов, к маю 1806 года княжество полностью передали Баварии. Канат перетянули более сильные.

В Ансбахе «недорогой и расчётливый» маршал держал за «собственный счёт» пышный двор и многочисленный штаб (достаточно упомянуть, что в штате его прислуги значился специальный человек для ловли лягушек), с головой окунулся в светскую жизнь, устраивал парады и балы и принимал участие в бесконечных приёмах и обедах в свою честь. Деньги на содержание двора брались, естественно, из кассы княжества. Расходы лично утвердил король Пруссии. Здесь Бернадот снова продемонстрировал свои администраторские и дипломатические таланты и так же, как когда-то в Италии и незадолго до этого в Ганновере, довольно преуспел в управлении чужим княжеством.

В круг самых близких друзей Бернадота, кроме Наглера, входила местная графиня Паппенхейм, которую маршал освободил от постоя своих офицеров и солдат, и отставной полковник Гастон — прусский пенсионер, бывший майор полка Рояль-Марин и командир гренадёра по кличке «Месье». Бернадот принимал его у себя по два раза на день и сохранил ему пенсию, несмотря на переход Ансбаха под управление Баварии.

В лице местного тайного и государственного советника Карла Хейнриха фон Ланга он нашёл себе способного помощника, который оставил об этом времени воспоминания:

«Мне посчастливилось увидеть там сразу четырёх маршалов: Бернадота, высокого брюнета со сверкающими очами, прятавшимися под толстыми бровями; верзилу Мортье с длинной жёсткой косичкой и бездушной фигурой часового; Аефевра, старого, классического образца кнехта с супругой, бывшей полковой прачкой, и Даву, маленького лысого непритязательного мужчину, который никак не мог вдосталь навальсироваться... В день рождения Наполеона Бернадот приказал позаботиться о том, чтобы в гарнизонах каждый француз получил по бутылке вина, расходы он брал на себя. Счёт составил 12000 флоринов... Маршал обращался ко мне обычно со словами: “Eh! Monsieur Lang, je Vous fis beaucoup travaillerr! ” Затем он начинал описывать, в какие деньги ему обходятся удовольствия администрации, каким счастливым человеком он чувствовал себя в Ганновере, где приходилось заниматься и правительственной работой. Он вообразил, что Ансбах — это его княжество, что оно, благодаря ему, должно стать счастливым — особенно если рядом с ним окажутся такие советники, как я. Всеми своими действиями маршал показывал, что он серьёзно подумывал о том, чтобы где-нибудь получить скипетр».