Условия работы дешифровщиков также не способствовали успеху. Из-за тесноты помещений и крайней скученности в них служащих химические тексты приходилось проявлять непосредственно в кабинете заведующего Особым отделом ДП, а наиболее кропотливую работу с ними вообще проводить дома. Дома же сотрудники разбирали и все шифрованные письма.

Еще в 1901 году Зыбин направил начальнику Особого отдела ДП Л. Ратаеву доклад, в котором указывал на то, что резко начал расти поток шифрованных писем, полученных при обысках и арестах. Вместе с тем все эти письма, как правило, для дешифровки направлялись в ДП, поскольку в среде чинов жандармского корпуса своих специалистов по шифрам не было. Основы дешифровки преподавались только в Академии Генерального штаба. Что касается жандармских офицеров, которым такие знания были также необходимы, то они их не получали.

В связи с этим Зыбин предлагал свои услуги для занятий с офицерами штаба Отдельного корпуса жандармов с целью ознакомить их с техникой разбора наиболее употребляемых в революционном подполье шифров. Он считал, что для получения ими необходимых знаний достаточно посвящать этому два часа в неделю. Вместе с ними могли бы заниматься офицеры наиболее важных жандармских управлений и «охранки». «И вскоре можно было бы достичь того, чтобы в каждом из наиболее важных жандармских управлений, а также в охранных отделениях были офицеры, „знакомые“ с приемами дешифровки», – писал Зыбин.

Такие занятия Ивану Александровичу разрешено было проводить. Одновременно с этим он начал преподавать основы дешифровки офицерам Главного военного штаба.

При этом он занимался дешифровкой не только революционной переписки. В функции департамента полиции входила и контрразведка, в том числе и наблюдение за дипломатами и другими иностранцами, находившимися на территории России. Известно, что Зыбин работал с шифроперепиской австрийской агентуры в России.

В период Первой мировой войны Зыбин и его коллеги из ДП работали над дешифровкой военных и агентурных сообщений противников России (Германии, Австрии и Турции). К сожалению, дешифровщикам МВД материалы поступали с задержкой, часто это были короткие сообщения, отдельные криптограммы, не передавалась информация о возможном содержании сообщений, обстоятельствах перехвата криптограммы.

Вся перечисленная информация могла бы существенно помочь криптоаналитикам. Но все же сотрудники и агентура ДП и военные старались делать все возможное для помощи своим дешифровщикам. Так известно, что в ходе войны были добыты ряд немецких и турецких военных и агентурных шифров и кодов. Разумеется, велась и аналитическая работа по вскрытию вражеских шифров.

Именно таким образом весной 1915 года команда Зыбина вскрыла ряд криптограмм австрийских и немецких агентов, посланных в Берлин, Вену и Брашов. В этом же году был прочитан ряд австрийских военных сообщений. В результате группа криптоаналитиков ДП во главе с Зыбиным за дешифровку вражеской шифропереписки была награждена денежной премией.

В июле 1915 года был проведен съезд руководителей кабинетов научно-судебной экспертизы при прокурорах судебных палат. На съезде внимание собравшихся было обращено на то, что этим кабинетам нередко приходится иметь дело с дешифровкой документов. Не имея специальной литературы и соответствующего руководства, сотрудникам кабинетов самим приходилось искать способы и приемы дешифровки.

Съезд принял решение о временном командировании чинов кабинетов в ДП, МИД и Военное министерство для ознакомления с практиковавшимися приемами дешифровки, принимая во внимание, что в этих ведомствах накоплен по данному вопросу уже большой опыт. Однако само Министерство юстиции не спешило выполнять решения съезда. Лишь через год, в июле 1916 года, было направлено письмо начальнику Особого отдела ДП Е. К. Климовичу с просьбой допустить сотрудника московского кабинета Русецкого на стажировку в ДП и ознакомить его с наиболее распространенными видами шифров и приемами их разбора. Такое разрешение было дано.

Конечно, в борьбе с революционным подпольем без агентов было не обойтись, но владея техникой раскрытия шифров, можно получить информации намного больше, чем ее давали несколько сотен агентов царской «охранки». Именно Зыбин ввел в практику чинов полиции, проводивших арест или обыск революционеров, обычай тщательным образом искать среди имеющихся книг именно те, которые могли заинтересовать Зыбина-дешифровщика.

Документальных подтверждений тому множество, например: «3.01.1910. Начальнику Санкт-петербургского губернского жандармского управления. Департамент полиции… препровождает при сем Вашему Превосходительству ключ к шифру и разбор шифрованной записки, отобранной по обыску у Якова Свердлова…».

Вот отрывок из его письма от 7 февраля 1910 года начальнику саратовского губернского жандармского управления: «…Отобранные по обыску у мещанина Николая Сергеевича Кузнецова записки зашифрованы 4, 15, 25, 29 и 35-й страницами какой-то неизвестной книги и разбору не поддаются по недостаточности материала. Прошу Ваше Высокоблагородие уведомить в самое непродолжительное время, не было ли обнаружено по обыску у названного Кузнецова, кроме означенных записей, какого-либо издания или легальной книги с пометками на отдельных страницах или загрязненных более других какой-либо страницей от частого, сравнительно с другими, употребления и, кроме того, не встретилось ли одно и то же издание у прочих лиц, принадлежащих к одной с Кузнецовым организации, так как подобное явление в большинстве случаев указывает, что таковое издание служит ключом для шифрованных сообщений».

Летом 1911 года Зыбин прибыл из Петербурга в Москву для работы с одним из перехваченных революционных шифрованных писем. Успев только поздороваться с Заварзиным, он сразу попросил показать ему письмо. Заварзин уступил столичному гостю свой кабинет, и Зыбин с председателем окунулся в разбор депеши, зашифрованной дробными числами. Когда Заварзин вернулся, чтобы пригласить гостя на обед, ему пришлось дважды обращаться к Зыбину – тот его просто не слышал. За обеденным столом он продолжал удивлять собравшихся.