Это было довольно скромное начало, однако подводники наносили удары по коммуникациям Роммеля, проявляя редкие упорство, терпение и настойчивость. Их атаки были менее зрелищны, чем воздушные. Но в то же время базы подводных лодок меньше страдали от действий вражеской авиации, и они вскоре добились более заметных успехов. Например, в конце февраля британская подводная лодка потопила итальянский легкий крейсер. Дело в том, что итальянское верховное командование для обеспечения перевозок войск Африканского Корпуса привлекло крейсера, но обеспечение сопровождения конвоев было организовано из рук вон плохо, что и привело к плачевному результату.

Начиная с 23 февраля, в Ливию один за другим отправлялись конвои с германскими и итальянским войсками. За их безопасность отвечал итальянский флот. Вечером 23 февраля из Неаполя в Триполи вышли 5 германских быстроходных транспортов в сопровождении 4 и итальянских эсминцев. 24 февраля в море вышли 5 итальянских лайнеров, переполненных немецкими солдатами. На следующий день в путь отправился конвой из 5 итальянских и 5 германских транспортов. Так как в январе на Средиземноморском театре появилась германская авиация, англичане не могли держать на Мальте свои надводные корабли. Поэтому выглядит довольно странной отправка крейсеров «Банде Нере» и «Армандо Диац» в сопровождении 2 эсминцев для прикрытия первого из этих конвоев. Вице-адмирал Мориондо, командовавший дивизией крейсеров, не принял никаких мер для защиты от единственной реальной угрозы — подводных лодок.

Крейсера находились впереди конвоя и следовали в кильватерной колонне. Сначала они шли противолодочным зигзагом, но 25 февраля в 2.00 при подходе к банке Керкенна прекратили зигзаг. Ночь была очень темной, безлунной и тихой. При подходе к берегам Триполита-нии видимость сократилась еще больше. Чтобы не оторваться от конвоя, итальянские крейсера следовали со скоростью 13,5 узла. Поэтому перед лейтенантом Э.Д. Норманом, стоявшим на мостике подводной лодки «Апрайт», предстала цель, о которой подводник может лишь мечтать. В 3.45 в «Армандо Диац» попали 2 торпеды, которые вызвали детонацию носовых погребов. Уже через 4 минуты крейсер пошел на дно с большей частью команды. Спаслись только 147 человек. Попытка эсминцев атаковать «Апрайт» глубинными бомбами успеха не принесла.

В марте успеха добились «Атмоуст», «Юник» и «Апрайт». Когда 8 марта на Мальте получили сообщение о большом количестве транспортов, следующих в Триполи, все имеющиеся лодки тут же были отправлены в море. «Атмоуст» капитан-лейтенанта Р.Д. Кейли недавно вернулась с патрулирования и снова вышла в море, проведя в гавани лишь 24 часа. 9 марта она торпедировала и потопила итальянский транспорт «Капо Вита». На следующий день «Юник» лейтенанта Э.Ф. Коллетта, которой было приказано задержаться в море, потопила транспорт «Феничиа». «Атмоуст» 19 марта уже снова находилась у побережья Туниса. Лодка перехватила конвой из 5 германских транспортов со снабжением для Африканского Корпуса и торпедировала «Гераклею» и «Рур». Первый транспорт сразу затонул, но «Рур» противнику удалось отвести в порт. Когда этот конвой двинулся из Триполи в обратный путь, он натолкнулся на «Апрайт». Лодка торпедировала и тяжело повредила транспорт «Галилея».

В этот же период определенных успехов добились и лодки александрийской флотилии. Их главной целью оказались итальянские танкеры. Подводный заградитель «Ро-куэл» прибыл на Мальту, чтобы принять на борт мины. 25 и 26 марта он поставил заграждения возле Палермо. Это минное поле итальянцы обнаружили довольно быстро, так как на нем подорвался и затонул маленький танкер «Верде». А командир «Рокуэла» капитан 2 ранга Р. Г. Дьюхерст, израсходовав мины, отправился на поиски целей для своих торпед. Сначала он потопил танкер «Тичино». 30 марта был торпедирован танкер «Лаура Кор-радо». Так как танкер не затонул, Дьюхерст отважно поднялся на поверхность и добил его артиллерией. На следующий день «Рокуэл» израсходовал последние торпеды на потопление итальянской подводной лодки «Каппони». Она имела глупость следовать в надводном положении среди бела дня. После этого совершенно довольный экипаж повел «Рокуэл» на Мальту за новыми торпедами.

Уничтожение танкеров стало основным занятием александрийской флотилии. В следующем месяце лодка «Тетрарх» потопила возле Триполи танкер «Персиано» с грузом драгоценного топлива для армии Роммеля. Однако, если говорить о количестве потопленных судов и их тоннаже, то пальма первенства принадлежит, разумеется, маленьким лодкам типа «U» с Мальты. Наибольших успехов добилась лодка «Апхолдер», которой командовал чернобородый долговязый шотландец Малькольм Дэвид Ванклин. 21 марта он вышел с Мальты, чтобы патрулировать в проливе Лампедуза. За свое терпение через 4 дня он был вознагражден, встретив во время шторма транспорт «Антониэтта Лаура». Чтобы наверняка добиться успеха, Ванклин стрелял с такого малого расстояния, что первая торпеда попала в цель еще до того, как третья покинула торпедный аппарат. Помня о малом запасе торпед (эти лодки имели 4 торпеды в аппаратах и 4 запасные), Ванклин успел отменить третий и четвертый выстрелы.

После этого он получил приказ уничтожить германский транспорт «Арта», который был поврежден эсминцами Мака 10 дней назад и сейчас сидел на мели на банке Керкенна. «Апхолдер» подошел к борту транспорта, и подводники подожгли «Арту». Ценный груз автомобилей для Африканского Корпуса был уничтожен. Ванклин остался ждать, и через 5 дней на него налетел конвой из 4 германских и 1 итальянского транспортов, возвращающийся из Триполи домой под прикрытием 4 эсминцев. Плохая погода не помешала Ванклину атаковать.

Лодка проскользнула сквозь завесу эсминцев и торпедировала 2 германских транспорта — «Арктурус» и «Леверкузен». Эсминцы начали сбрасывать глубинные бомбы, но лодка ускользнула. Когда все стихло, Ванклин подвсплыл на перископную глубину, чтобы проверить результаты своей атаки. «Арктурус» затонул, а второй транспорт на буксире у эсминца медленно направлялся обратно в Триполи. Ванклин устремился в погоню и в новой атаке 2 торпедами потопил «Леверкузен».

Именно Ванклин во время своего следующего похода показал врагу, что у Мальты еще остались довольно острые зубки, хотя Люфтваффе и Реджиа Аэронаутика сделали все возможное, чтобы их выбить. На сей раз он охотился у юго-восточного побережья Сицилии в районе Мессинского пролива, где сходились коммуникации врага. 20 мая он дал торпедный залп с большой дистанции по неволимому конвою, но попаданий не добился. Зато глубинные бомбы кораблей эскорта вывели из строя «уши» «Анкиллера» — асдик и гидрофоны.