Вторая группа военнослужащих ТОФ, находившаяся в поле зрения контрразведки флота, была взята на учет как лица, которые во время пребывания в иностранных портах «скомпрометировали себя связями с иноподданными». Военнослужащие, отнесенные к этой группе лиц, состояли на особом учете в связи с тем, что они поддерживали связи с иностранцами, посещали их квартиры, выпивали вместе с иностранцами, но среди их связей не было выявлено иностранных разведчиков. Именно поэтому они состояли на учете, но проверочные мероприятия не проводились.

В ходе военной кампании на Востоке была разгромлена Квантунская армия противника в Маньчжурии. Япония лишилась крупнейшей военно-промышленной базы на азиатском материке и сильной армии. Советские войска изгнали японцев из Маньчжурии и Кореи, Южного Сахалина и Курильских островов. Япония лишилась всех военных баз и плацдармов, которые готовила против СССР. Она оказалась не в состоянии вести вооруженную борьбу.

2 сентября 1945 г. был подписан акт о безоговорочной капитуляции Японии, ознаменовавший окончание Второй мировой войны. Верховный командующий союзными войсками в юго-западной части Тихого океана генерал армии Д. Макартур принял формальную капитуляцию Японии на борту американского авианосца «Миссури». От Советского Союза акт подписал генерал-лейтенант К.Н. Деревянко.

3 сентября был принят указ Президиума Верховного Совета СССР об объявлении этой даты днем Победы над милитаристской Японией.

За боевые заслуги 19 кораблям, частям, соединениям Тихоокеанского флота присвоены гвардейские звания, 13 — почетные наименования, 16 награждены орденами. Более 30 тысяч тихоокеанцев награждены орденами и медалями, 43 присвоено звание Героя Советского Союза. В 1965 г. Тихоокеанский флот награжден орденом Красного Знамени [545] .

С началом Великой Отечественной войны находившиеся в составе ВМФ СССР Краснознаменная Амурская, Дунайская, Пинская и Каспийская флотилии были отмобилизованы и развернуты в соответствии с нормами военного времени. Однако в ходе боевых действий возникла необходимость в создании на прифронтовых реках и озерах новых соответствующих флотских формирований. В результате возникли Беломорская, Волжская, Днепровская, Ильменская, Ладожская, Онежская и Чудская военные флотилии, основным боевым ядром которых стали вооруженные суда гражданского транспортного флота.

С началом Великой Отечественной войны в июле 1941 г. из мобилизованных судов Азово-Черноморского пароходства была сформирована Азовская военная флотилия (АВФ) в составе дивизиона канонерских лодок (3 единицы), дивизиона сторожевых кораблей тральщиков (5 единиц), отряда сторожевых катеров и катеров-тральщиков (8 единиц). Впоследствии состав флотилии менялся. Главной базой флотилии был Мариуполь, маневренными базами — Бердянск, Ейск, Ростов-на-Дону, Приморско-Ахтарск. 27 августа 1941 г. по приказу наркома Военно-морского флота был сформирован Отдельный Донской отряд Азовской военной флотилии (командир капитан 1-го ранга С.Ф. Белоусов), состоявший из дивизиона речных канонерских лодок и дивизиона речных сторожевых катеров (4 и 8 единиц из судов Доно-Кубанского речного пароходства), 8 бронекатеров и 9 полуглиссеров, 40-го отдельного артиллерийского дивизиона, береговой батареи № 661, бронепоезда № 10 «За Родину!» и пулеметной роты. Штаб отдельного Донского отряда располагался в Азове. Сам же город был обозначен как маневренная база № 3 АВФ. Подразделения Отдельного Донского отряда базировались на Азов и Ростов-на-Дону, маневренными базами отряда были Калач, Каменская и Цимлянская [546] .

В сентябре 1941 г. Отдельный Донской отряд вошел в состав Азовской военной флотилии. В октябре 1941 г. в низовьях реки Дон развернулись военные действия. Подразделения Азовской военной флотилии (канонерские лодки, сторожевые корабли) отражали атаки во время штурма немецкими войсками Таганрога. Корабли и части морской пехоты Азовской флотилии оказывали эффективную поддержку частям 56-й Отдельной армии (входила в Приморскую оперативную группу) в низовьях Дона.

Азовская военная флотилия, оперативно подчиненная Кавказскому фронту, совместно с войсками и ВВС фронта, силами Черноморского флота участвовала в Керченско-Феодосийской десантной операции (25 декабря 1941 г. — 2 января 1942 г.), проводимой с целью овладения Керченским полуостровом, отвлечения сил противника от Севастополя и создания условий для освобождения Крыма. К операции привлекались 250 кораблей и судов, которые обеспечивали высадку морского десанта для захвата северо-восточного побережья Керченского полуострова и города Феодосия, а также оказывали огневую поддержку огнем корабельной артиллерии.

В апреле — мае 1942 г. Отдельный Донской отряд кораблей Азовской флотилии, оперативно подчиненный Южному фронту, оказывал огневую поддержку 56-й армии, осуществлял переправу войск и боевой техники у Таганрога и в устье Дона.

21 апреля 1942 г. АВФ была включена в состав сил СевероКавказского направления, а 19 мая подчинена Северо-Кавказскому фронту. 17 июля командование фронта поставило перед флотилией следующие задачи: силами Отдельного Донского отряда оборонять устье Дона, заблокировать его гирло, оставив фарватеры для прохода кораблей флотилии, оказывающих огневую поддержку Ростовскому укрепленному району, содействовать войскам 56-й армии на таганрогском направлении. В устье Дона в районе Азова были сконцентрированы силы флотилии в составе 3 канонерских лодок, одного монитора, 4 бронекатеров, 2 дивизионов сторожевых катеров, бронепоезда № 10 «За Родину!». Силы флотилии через несколько дней оказались в центре интенсивных боевых действий, так как противник, развивая наступление, 21 июля вышел к Дону, а через два дня прорвал фронт 56-й армии. В эти дни 3 бронекатера и 4 сторожевых корабля флотилии обеспечивали переправу советских войск у станицы Константиновской и уход гражданских судов из Северского Донца, прикрывали переправу войск Южного фронта на левый берег Дона. Морские пехотинцы при поддержке кораблей Отдельного Донского отряда вели бои за населенные пункты на берегах Дона и Малого Дона. Бронекатера отряда совместно с частями 12-й армии вели оборонительные бои.

После оставления станции Манычанской и Сальска экипажи взорвали свои катера и убыли в Краснодар [547] .

После оставления Азова 28 июля корабли Отдельного Донского отряда перебазировались в Ейск. 2 августа личный состав Отдельного Донского отряда прибыл в Краснодар и влился в Отдельный Кубанский отряд.

В сентябре 1942 г. Азовская военная флотилия была расформирована, а ее корабли и части включены в состав Новороссийского оборонительного района.