В регулярной армии, а также в казачьих территориальных формированиях имелось много подразделений, которых постигла похожая участь: в силу сложных объективных и субъективных предпосылок их формировали, обучали, посылали в бой, расформировывали и снова формировали. Постоянные изменения структуры принадлежали, очевидно, к стилю ведения войны. При этом никакая мелочь не ускользала от глаза Потемкина. Он заботился обо всем и решал основные задачи по охране колонизированной страны и по ведению войны с Турцией. Сколько проблем было только в бесперебойном снабжении подразделений продуктами питания! Проблема заботы о благе и образовании солдат в интересах основной цели была очень нелегким делом для генерала-губернатора и главнокомандующего. Эта забота забирала много сил и нервов и наталкивалась на сопротивление.

В письме от 14 августа 1787 года канцлеру Безбородко в связи с началом войны и большим количеством больных в Херсоне Потемкин писал: «Это лишает спокойствия меня, но, слава Богу, немногие умирают». Между тем Суворову был дан приказ: «Вы должны строго приказать своим командирам, чтобы новобранцы не подвергались телесным наказаниям, обучать их служебному долгу следует обучением и порядком». Потемкин издавал строгие указания для обеспечения гигиены. Он содействовал учреждению госпиталей и военных лазаретов и построил целую сеть таких учреждений в важных городах. Тем не менее многое оставалось только в зародышевом состоянии.

Страна и армия не были подготовлены к исправной санитарной службе. Поэтому контраст представляла картина усилий Потемкина и военный госпиталь в Елизаветграде, в котором лежали в мае 1788 года около 2000 солдат и в котором не хватало самого необходимого оборудования, медикаментов и белья. Потемкин лично основал аптеку в Херсоне. Она снабжала не только Крым, но и военно-морской флот. Эта единственная аптека не могла удовлетворить потребности по снабжению подразделений. Недостаток во врачах был огромным. Призывы Потемкина в реальной ситуации были беспомощными. Мало приносило пользы то, что он напоминал Суворову: «Если Вы постараетесь чаще посещать лазареты, врачи будут лучше стараться. Предписанные лекарства и контроль чистоты — это самые подходящие средства для улучшения… Из-за этих забот я плохо сплю, но я надеюсь на милость Бога, и я полагаюсь на Вашу неутомимую работу».

Даже подробные указания Потемкина помогали мало, так как им не сопутствовала никакая материальная поддержка, и указания исполнялись невесело: «Относительно больных я навел справки. Нельзя допускать, чтобы больные цингой засыпали; для них хороши овсяные отвары, а также нужно выдавать квас с хреном. Больных дизентерией нужно держать отдельно и мыть чаще… Берегитесь класть с ними тех, кто не болен этой болезнью. Больным дизентерией следует выдавать сухари со щами и супом и квас, чтобы было кисловато. Наблюдайте, как действует Витовская вода [Вода целебного источника. — Прим, авт.]».

Эта форма патриархальной благосклонности говорила о человеке Потемкине, а не о полководце и организаторе. Он мог одновременно выступать против турок и выдавать больным в Херсоне квас! Даже офицеры его штаба оставались бездеятельными, полагались на всезнание своего начальника и давали ему снова и снова повод для жалобы: «Вы молчите и молчите, но затем вы хотите получить что-нибудь из Сибири или Астрахани… Вы не удивитесь, если я не в настроении: Бог свидетель, сил не хватает; всюду нельзя быть самому. А от меня требуют всего, до самых мелких указаний». Это звучало как призыв разочарованного человека, который не был уверен в своих силах в предстоящей войне.

В действительности летом 1787 года, а также в течение предыдущих лет Потемкин серьезно болел. Загадочная крымская лихорадка привела уже ко многим жертвам. Потемкин находился в том состоянии, когда болезнь достигла своего пика. Обширная переписка и поток указаний остановились. Даже императрица получала только скудные сведения. Но война не принимала во внимание ни лихорадку, ни депрессии Потемкина.

Турки сосредоточивали свою подготовку на направлении Очаков-Кинбурн-Херсон. Они представляли доказательство правильности потемкинских поселенческих, политических и военных мер. Турецкий флот плыл в Кинбурн, в то время как сухопутные войска направлялись к Херсону. Третьим направлением турецко-татарского наступления был Крым. Потемкин спешно послал войска в Кинбурн и подчинил их Суворову. Русский фронт обороны в Крыму оставался неудовлетворительным еще в течение многих месяцев. Сам Потемкин организовывал оборону на Буге. Позиции в устье реки, которые он считал особо уязвимыми, он подчинил генерал-майору, а позже знаменитому полководцу Михаилу Кутузову.

В середине августа 1787 года турецкий флот оказался перед крепостью Очаков и начал боевые действия. Русский флот между тем еще не был готов к проведению полноценных операций. Адмирал Мордвинов оказался слишком медлительным для необходимой импровизации. Потемкин заставил, по крайней мере, укрепить гавань Кинбурна. Он рекомендовал Мордвинову произвести видимость подготовки нападения на турецкий флот. Но в то время, как Суворов отважно сражался под Кинбурном, было принято решение, которое отрицательно повлияло на Потемкина, его самооценку и внутреннюю выдержку. Последовало событие, которое валило гиганта, как гнилое дерево. По меньшей мере создавалось такое впечатление.

Адмирал Войнович вышел в Черное море с эскадрой, состоящей из трехлинейных кораблей и семи фрегатов. Перед болгарским портом Варна эскадра оказалась в сильном шторме. Один фрегат утонул. Остальным кораблям удалось спастись и с серьезными повреждениями возвратиться в Севастополь. Линейный корабль «Мария Магдалена» с разбитой мачтой унесло в Босфор… Адмирал Войнович полностью потерял голову. Он оказался неспособным управлять флотом на неспокойном море. Только одному офицеру повезло: командующий авангардом капитан Федор Федорович Ушаков привел свою флотилию в Севастополь относительно неповрежденной. Для Ушакова началась после этого успеха быстрая карьера, которая принесла ему на море такую же славу, как Суворову на суше — гениальный герой войны, неудобный, эгоцентричный, но успешный.