При этом очередность исполнения обязанностей по уплате налогов и сборов при ликвидации организации среди расчетов с другими кредиторами такой организации определяется гражданским законодательством Российской Федерации (п.3 ст.49 НК РФ).

Порядок погашения налоговой задолженности ликвидируемой организации установлен п.4 ст.49 НК РФ.

Согласно абз.1 п.4 ст.49 НК РФ если ликвидируемая организация имеет суммы излишне уплаченных этой организацией налогов и сборов и (или) пеней, штрафов, то вышеуказанные суммы подлежат зачету в счет погашения задолженности ликвидируемой организации по налогам, сборам (пеням, штрафам) налоговым органом в порядке, установленном гл.12 НК РФ, не позднее одного месяца со дня подачи заявления налогоплательщика-организации.

Из положений абз.2 и 3 п.4 ст.49 НК РФ следует, что сумма излишне уплаченного налога распределяется по бюджетам и внебюджетным фондам пропорционально общим суммам задолженности по другим налогам ликвидируемой организации перед соответствующими бюджетами и внебюджетными фондами. В случае отсутствия у ликвидируемой организации задолженности по исполнению обязанности по уплате налогов и сборов, а также по уплате пеней и штрафов сумма излишне уплаченных этой организацией налогов и сборов (пеней, штрафов) подлежит возврату этой организации не позднее одного месяца со дня подачи заявления налогоплательщика-организации.

Пунктом 5 ст.78 НК РФ предусмотрено, что налоговые органы вправе самостоятельно произвести зачет сумм излишне уплаченного налога, если имеется недоимка по другим налогам.

Филиал не является юридическим лицом, следовательно, ответственность по его обязательствам несет головная организация. Поэтому требования, предъявляемые ГК РФ к ликвидируемым юридическим лицам, при ликвидации филиала не действуют.

В случае ликвидации юридического лица согласно положениям ГК РФ должны быть уведомлены кредиторы организации. Но, поскольку филиал не является собственником переданного ему имущества и действует по доверенности головной организации, претензии кредиторов могут быть обращены только на имущество головной организации. Следовательно, уведомлять кредиторов филиала о его ликвидации необязательно.

Порядок ликвидации филиала аналогичен ликвидации юридического лица, но сначала требуется внести изменения в учредительные документы основной организации, в которых данный филиал отсутствует. Далее организация снимается с учета в ИФНС по месту нахождения филиала, согласует промежуточный и ликвидационный баланс, закрывает расчетный счет. Снимается с учета во внебюджетных фондах, уничтожается печать, документы передаются в архив. После получения уведомления о снятии с учета в ИФНС по месту нахождения филиала вносит изменения в налоговую отчетность основной фирмы.

Ликвидация филиала производится назначенной организацией ликвидационной комиссией, а в случаях прекращения деятельности филиала по решению суда или арбитражного суда – ликвидационной комиссией, назначаемой этими органами.

При ликвидации филиала увольняемым работникам гарантируется соблюдение их прав и интересов в соответствии с законодательством. При высвобождении работников в связи с ликвидацией филиала им гарантируется соблюдение их законных прав и интересов, в том числе права на льготы и компенсации.

Имущество ликвидированного филиала после расчетов по оплате труда его работников и выполнения обязательств перед бюджетом, кредитными учреждениями и кредиторами распределяется в соответствии с решением членов собрания акционеров главной организации. При ликвидации филиала имущество и финансы филиала, оставшиеся после расчетов главной организации с бюджетом и кредиторами, ей возвращаются.

Порядок удовлетворения претензий кредиторов в случае ликвидации филиала определяется также в соответствии с законодательством Российской Федерации. Ликвидация филиала осуществляется ликвидационной комиссией, назначаемой членами собрания акционеров этой организации, либо (в установленных законом случаях) судом.

Следует отметить, что филиалы как структурные подразделения организации могут иметь или не иметь отдельный баланс. От этого зависит порядок бухгалтерских записей.

Если филиал имеет отдельный баланс, то расчеты с ним головная организация отражает на счете 79 «Внутрихозяйственные расчеты», к которому могут быть открыты субсчета: 79-1 «Расчеты по выделенному имуществу» и 79-2 «Расчеты по текущим операциям».

В бухгалтерском учете головной организации по счету 79 должно быть дебетовое сальдо, а в бухгалтерском учете филиала – кредитовое.

Если филиал не имеет отдельного баланса, то операции, которые он осуществляет, отражаются на отдельных субсчетах счетов учета производственных затрат (20 «Основное производство», 23 «Вспомогательные производства» или 29 «Обслуживающие производства и хозяйства»).

Юридически ликвидация филиала отражается в учредительных документах. Вносятся изменения и в учетную политику организации.

В ходе своей деятельности филиал закупает необходимые для производства материалы, сырье, топливо, пользуется работами и услугами других организаций, т.е. ведет расчеты с поставщиками и подрядчиками. После ликвидации филиала задолженность по оплате материально-производственных ценностей (работ, услуг) переходит к головной организации. Однако, до того как это произойдет, головной организации целесообразно по мере возможности рассчитаться с кредиторами за счет денежных средств, находящихся на расчетном счете, специальных счетах в банках и в кассе филиала.