Значительная высота хвостовой опоры шасси и связанный с этим большой просвет между грунтом и фюзеляжем предопределили выбор Ju-88 в качестве летающей лаборатории для испытаний реактивных двигателей. На одном снимке плохого качества – летающая лаборатория Ju-88 с двигателем JUMO-004, на другом снимке – под фюзеляжем Ju-88.4-5 подвешен ТРД BMW-003.

Вверху и справа: устройство «Dobbas» позволяло быстро переоборудовать Ju-88 в транспортный самолет. Рима Dobbas монтировалась на нижней поверхности фюзеляжа между внешними бомбодержателями ЕТС. К раме крепился сбрасываемый контейнер с полезным грузом (например с пушкой).

Радар FuG 350 Naxos, как и FuG 227 Flensburg служил для обнаружения английских радаров H2S. Naxos устанавливали на раме кабины под обтекателем или его выполняли в одном блоке с FuG 220.

Другим современным типом радаров, применявшихся на Ju 88G-6 был FuG 220 SN-2. Радар работал в двух диапазонах: 84- 82 МГц (I, II и III частоты) и 91-116 МГц (IV, V, VI и VII частоты). Радиус действия радара был свыше 10 км, однако он был эффективен и на коротких дистанциях. Использовали два типа антенн: «елочка» и «звезда» (Morgenstein). Антенну «звезда» закрывал обтекатель, если эта антенна была сблокирована с антенной FuG 350 Naxos. Обтекатель изготавливали из фанеры, а верхушка обтекателя из оргстекла.

Прототип истребителя Ju-88C был сделан на базе Ju-88V7, четыре стрелковые точки оборудованы по правому борту фюзеляжа в носовой части. V7 был переоборудован в скоростной пассажирский самолет, в фюзеляже сделали иллюминаторы, а остекление носовой части устранили, заменив более аэродинамически чистым металлическим обтекателем.

На самолеты этой модификации ставили моторы Jumo 213Е, оснащенные системой форсирования MW 50 (использовалась водно-метанольная смесь) и четырехлопастные деревянные винты. Размах крыльев увеличили до 21.935 мм за счет установки внутренних сегментов крыльев от Ju 188. Вооружение оставалось то же, что и у Ju 88G-6. Радиооборудование состояло из радара FuG 220 SN-2 с антенной Morgenstein или радара FuG 240 Berlin. Экипаж три или четыре человека. Самолет не выпускали серийно. был изготовлен прототип Ju 88V112 (W.Nr. 621045), прототип Ju 88V113 (W.Nr621044), оснащенный GMI и еще два прототипа V114 и V115. Два первых прототипа были уничтожены во время налета союзнической авиации. Самолеты Ju 88G-7 получили неофициальное название Mosquitojaeger («охотник на Mosquito»).