Большую опасность в то время представляли резидентуры и боевые группы организаций националистов, особенно в местах дислокации советских войск и в районах предполагаемых театров военных действий на Украине, в Прибалтике, Белоруссии. Немало агентов немецко-фашистской разведки, оуновцев и других антисоветских элементов и участников шпионско-диверсионных банд было арестовано накануне войны в Риге, Каунасе, Белостоке, Лиепае и других западных городах нашей страны.

Ликвидация таких резидентур была делом сложным и не всегда обходилась без жертв со стороны наших военных контрразведчиков. Так, 5 апреля 1941 года при операции по захвату в Риге в одном из домов но улице Медус действующей немецкой резидентуры. Луксиса погиб военный чекист Боголюбов Реваз Герасимович, посланный в военную контрразведку Центральным Комитетом комсомола Грузии и с 1936 года непрерывно находившийся на оперативной работе по обеспечению безопасности советских войск. После того как резидентура была выслежена и блокирована, он одним из первых ворвался в дом, где засели шпионы. Враг встретил Боголюбова яростным огнем. В завязавшейся перестрелке Боголюбов обезвредил одного шпиона, потом другого, но сам получил два тяжелых ранения, от которых вскоре скончался. В ходе операции контрразведчики захватили всех шпионов с радиоаппаратурой и шифродокументами. Так был ликвидирован один из очагов шпионажа в Прибалтике.

Общее количество выявленной немецко-фашистской агентуры в 1940 году увеличилось по сравнению с 1939 годом почти в четыре раза. У вражеских агентов и разоблаченных участников антисоветских организаций были изъяты радиостанции, средства тайнописи, значительное количество оружия, взрывчатых веществ, боеприпасов, немалые суммы денег. Разведывательные и националистические центры за рубежом снабжали своих агентов деньгами, инструкциями и наставлениями, определяли основные направления их деятельности. Поэтому для успешной борьбы с агентурой внутри страны, предотвращения внезапности военного нападения на СССР необходимо было проникать в замыслы и намерения вражеских зарубежных разведывательных центров, националистических и других антисоветских организаций, в замыслы политического, и военного руководства Германии.

В этих целях советская военная контрразведка оказывала всестороннюю носильную помощь советским разведывательным органам. В результате накануне войны усилиями главным образом разведывательных и при некотором содействии военных контрразведывательных органов Советского государства удалось добыть очень важные данные о подготовке Германии к нападению на СССР.

Теперь доподлинно известно, что фашистская Германия не была готова к войне с СССР и в разведывательном отношении. Ей так и не удалось в полной мере обеспечить вермахт всесторонней и достоверной информацией об СССР. Советская военная контрразведка в контакте с другими органами Советского государства сорвала вероломные планы абвера. Это признают и буржуазные специалисты.

Разведывательную неподготовленность Германии Гитлер признал уже 3 октября 1941 года. Он говорил:

А еще через три недели, 25 октября 1941 года, Гитлер при переговорах с министром иностранных дел Италии Чиано признавался, что он, возможно, вовсе не начал бы вторжения, если бы ему было заранее известно все то, с чем немцам пришлось встретиться в России.

Трудно судить, были ли эти слова Гитлера дипломатической игрой, направленной на подталкивание Италии к вступлению в войну с СССР, или искренним признанием. Но очевидно, что поражения и потери немецко-фашистских войск на советско-германском фронте уже в начальной стадии войны привели Гитлера к этим выводам.

О причинах неудачной разведывательной деятельности фашистских спецслужб перед войной говорил один из ее руководителей:

Начавшуюся войну советский народ и его Вооруженные Силы встретили с полной решимостью отстоять свободу и независимость своей Родины и разгромить немецких захватчиков. Агрессоры натолкнулись на сильнейшее противодействие.

На войну с СССР гитлеровцы отводили самое большее 8 недель, а преодолеть сопротивление пограничных войск рассчитывали в 30 минут. Однако советские пограничники совместно с частями прикрытия Красной Армии отстаивали рубежи своей Родины несколько суток. Больше месяца продолжалась оборона пограничной Брестской крепости. Защищавшие ее подразделения Советской Армии активно противостояли гитлеровским войскам, почти в десять раз превосходящим их по численности. Потери, понесенные фашистской армией перед Брестской крепостью, по немецким источникам, составляли 5 процентов их общих потерь на Восточном фронте за первую неделю боевых действий.

Первые месяцы войны были самыми тяжелыми и кровопролитными. Однако, несмотря на достигнутые успехи немецко-фашистских войск, теснивших нашу армию по всему фронту, их генералам не удалось выполнить задуманные планы окружения и уничтожения наших войск, особенно на южном и северном направлениях.

Шпионаж и диверсионно-террористическая деятельность фашистских разведок продолжались на всем протяжении войны. Главным средством достижения ее целей неизменно оставалась агентура. Задачи, направленность и методы агентурной работы существенно менялись. Они всецело зависели от военно-политической обстановки, складывающейся на советско-германском фронте. В начале войны, примерно до марта 1942 года, задачи и направление деятельности разведывательных служб фашистской Германии вытекали из стратегической доктрины «молниеносной войны». Сущность ее применительно к войне с Советским Союзом, как известно, состояла в том, чтобы разгромить Советские Вооруженные Силы серией мощных концентрических ударов и закончить войну за два месяца. Основная цель вермахта и всех военных органов Германии заключалась в уничтожении Красной Армии. После этого захват важных для Германии советских экономических районов, включая нефтеносные территории Кавказа, представлялся немцам делом техники. Раз вооруженная борьба с Советским Союзом будет проходить скоротечно, стало быть, задачи немецкой разведки сводятся к обеспечению фашистских войск как можно большей и точной информацией о советских войсках в районе военных действий на сегодня и ближайшее-время. Разведка должна была представлять данные о дислокации и численности войск на фронтах, подходе новых войсковых соединений, о наличии оборонительных рубежей, их прочности и уязвимых местах, о моральном состоянии военнослужащих действующей Красной Армии. Абверу предписано было также вести подрывную работу в рядах Красной Армии, ее тылу и ближайшем окружении войсковых частей.