«Дерзкий», «Поспешный» и «Беспокойный», под проклятия и угрозы неистово наседавших людей, снялись и бросили якоря у флагманского корабля «Воля». На «Керчи» поднимали сигналы: «Позор и смерть судам, идущим в Севастополь», «Изменники и предатели, одумайтесь» и т. д.

Многотысячная толпа по внешним молам шла к дредноутам. Старший офицер «Воли» не разрешил собрания команде, занятой судовыми работами. На «Свободной России» большевики устроили митинг, машинная команда отказалась идти в Севастополь.

Эскадра на рейде уже открыто разбилась на две части. Матросы с вещами покидали миноносцы, возвращаясь на берег вместе с уговорившими их типами. Стало ясно, что если корабли простоят еще, то или все команды разбегутся, или останется их часть, которая не сможет идти в Севастополь.

Командующий ждал «Свободную Россию», принимавшую уголь и нефть с транспортов. В 13 ч. на «Воле» подняли сигнал «Сняться с якоря и выйти на внешний рейд». За флагманом шли «Поспешный», «Беспокойный», «Дерзкий», «Пылкий», «Живой» (тянувший на буксире брошенный командой «Жаркий») и вспомогательный крейсер «Траян».

Корабли уходили под дикий рев и проклятия огромных толп, стоявших на обоих молах. И еще до самого вечера на катерах и шлюпках подходили темные личности, пытаясь уговорить моряков вернуться. На «Волю» неожиданно прибыли Глебов-Авилов и Вахрамеев. Оба просили командующего не уходить, а подписать приказ о потоплении судов, но Тихменев отказался. Комиссары, не рискнув обратиться к команде, спустились по штормтрапу, сели на катер и отвалили.

Вечером на рейд вышел миноносец «Громкий», но идти в Севастополь не собирался. На «Волю» поднялись представители «Свободной России» и просили дать им последний категорический ответ: «Пойдут ли они в Севастополь или нет?» — и если «Воля» пойдет, то и «Свободная Россия» пойдет тоже, хотя тут же кочегар прибавил, что машинная команда «России» не пойдет. «Воля» ответила, что своего решения не изменит.

Командующий еще надеялся, что хоть «Свободную Россию» удастся взять с собой. В 22 ч. снялись «Дерзкий», «Поспешный», «Беспокойный», «Пылкий», «Живой» и «Траян», ведя на буксире «Жаркий». На предложение начальника минной бригады взять на буксир «Громкий», тот заявил, что сам дойдет до того места, куда ему надо. «Воля» задержалась еще некоторое время на рейде, на «Россию» отправился флагманский инженер-механик генерал-майор Берг. Машинисты уже разбегались, и командующий приказал всей оставшейся команде «России» стать к котлам и механизмам, а капитану транспорта добровольного флота «Херсон» Родзянко приказал взять «Россию» на буксир. Но команда «Херсона» не повиновалась и подняла красный флаг с золотыми буквами «РСФСР».

Ночью 17 июня линкор «Воля», турбинные эсминцы («Беспокойный» «Дерзкий», «Поспешный», «Пылкий»), миноносцы «Живой», «Жаркий», вспомогательный крейсер «Траян» побрели в Севастополь, где их интернировали. Несколько позже к ним присоединилось посыльное судно «Креста» — база катеров.

«Свободная Россия», эсминцы: «Калиакрия», «Гаджибей», «Фидониси», «Керчь», «Пронзительный», «Громкий», «Лейтенант Шестаков», «Капитан-лейтенант Баранов», миноносцы: «Стремительный» и «Сметливый», посыльное судно «Летчик», 8 быстроходных катеров истребителей, транспорты и пароходы остались в Новороссийске для самоуничтожения.

Потоплением кораблей руководил демагог Раскольников, заявлявший, что к позорному Брестскому миру привели дворяне и кадровые офицеры, поэтому теперь приходится, как бы с болью в сердце, уничтожать корабли и т. д. и т. п.

Миноносцы топили на внешнем рейде, открыв кингстоны и взорвав машины. Буксиры вывели «Свободную Россию» на глубину 55 м, корабль взорвали залпом торпед с эсминца «Керчь», который затем ушел в Туапсе. Кукель с командой уехал по Армавир-Туапсинской дороге. Эмоциональная окраска этой трагедии отражена в фильме «Гибель эскадры», насыщенном тяжкой музыкой и слезами на глазах русских моряков.

«Керчь» затопили в Туапсе, так как в Новороссийске осталась недобрая память о январе 1918 г., когда матросы, расстреляв офицеров Варнавинского пехотного полка, грабили и насиловали. Хотя на «Керчи» вряд ли оставался кто-нибудь из той братвы, но команда боялась репрессий, если бы ей пришлось, утопив корабль, распылиться в городе.

На рейде Новороссийска утопили, по настоянию иностранных консулов, пароходы, застигнутые войной в Черном море и зачисленные в транспортную флотилию (английский «Тревориан», бельгийский «Эльбрус», итальянские «Женироза» и «Сербия», французский «Оксюз»).

Катера-истребители по железной дороге отправили на Волгу.

Теперь РККФ фактически состоял из морских, речных и озерных флотилий, комплектовавшихся Балтфлотом, направлявшим: корабли, личный состав, артиллерийское, минное, торпедное оружие, тралы, штурманское и другое оборудование.

Советская морская авиация, созданная одновременно с РККВФ, в январе 1918 г. имела 288 самолётов, из них 30 летающих лодок М-5 и М-9 конструкции Д. П. Григоровича, построенных на заводе «Гамаюн» (бывший С. С. Щетинина в Петрограде).