30—31 марта 1989 года — Баку. Уроженец Керчи, ранее совершивший крупное хищение и находившийся во всесоюзном розыске, сообщил, что в салоне Ту-134 (рейс Воронеж — Астрахань — Баку) якобы находятся два его сообщника, а в грузовом отсеке — взрывное устройство. Он угрожал привести в действие устройство с помощью дистанционного управления, если его условия — полмиллиона долларов и возможность вылета за границу — не будут выполнены. Террорист был обезврежен сотрудниками «Альфы».

10 мая 1989 года — Саратов. Во время прогулки четверо уголовников изолятора № 1 УНТУ УВД Саратовского облисполкома, вооруженные заточками и «гранатами» (раскрашенные муляжи из хлебного мякиша), набросились на контролеров. Они предъявили ультиматум: два автомата, четыре пистолета с боекомплектом, гранаты, 10 тысяч рублей и автомобиль. Было выдвинуто условие — обеспечить беспрепятственный выезд из тюрьмы за пределы области. В доме № 20 по улице Жуковского террористы взяли в заложники супругов Просвириных и их двухлетнюю дочку и выставили новые требования: самолет для вылета за границу, крупная сумма денег, наркотики и водка. Операцию по освобождению заложников провела группа «А» (старший — Герой Советского Союза В. Ф. Карпухин, заместитель — М. В. Головатов). В 3 ч 25 мин бойцы с помощью специального снаряжения спустились с крыши и буквально влетели в окна захваченной квартиры. Одновременно вторая группа вышибла дверь и также ворвалась в квартиру. Бандит, вооруженный пистолетом Макарова, успел сделать два выстрела. Пользуясь фактором внезапности, группа обезвредила бандитов. Никто из заложников не пострадал. Ранен сотрудник «Альфы».

1990 — Азербайджан. «Альфа» и «Вымпел» вместе с учебным батальоном спецназа «Витязь» переброшены в Баку. Сводную группу возглавлял Герой Советского Союза Г. Н. Зайцев. Задача: нейтрализация лидеров Народного фронта Азербайджана, недопущение свержения законного правительства республики, пресечение массовых беспорядков, выявление и задержание лиц, подозреваемых в подрывной деятельности. Сотрудники группы «А» обеспечивали безопасность первого секретаря Компартии Азербайджана А. Визирова.

1990 — операция «Капкан». Внедрение в среду подпольных торговцев оружием и захват лиц, причастных к этому криминальному бизнесу.

1990 — Ереван, Армянская ССР. Бойцы «Альфы» принимали участие в нейтрализации особо опасной вооруженной группы — банды Серого. В ходе операции три уголовника были уничтожены, двое ранены, шестеро задержаны.

1990 — Сухуми, Абхазская АССР. 22 сотрудника группы «А» под командованием В. Ф. Карпухина, а также 31 боец учебного батальона спецназа отдельной мотострелковой дивизии особого назначения им. Ф. Э. Дзержинского были срочно переброшены в Сухуми, где 75 уголовников захватили заложников и изолятор временного содержания. В ходе переговоров главари выдвинули требование: предоставить им микроавтобус РАФ, чтобы они могли выехать за пределы изолятора, в горы. Когда вооруженные бандиты вместе с заложниками погрузились в микроавтобус, группа захвата начала операцию по их обезвреживанию. Одновременно две группы начали штурм изолятора. За считанные секунды преступники в микроавтобусе были обезврежены, заложники освобождены. Бандиты в изоляторе после недолгого сопротивления также сдались. Во время операции легкое ранение получили сотрудник «Альфы» и один из бойцов «Витязя». Эта специальная операция не имеет аналогов в отечественной и мировой практике применения подразделений спецназа для освобождения захваченных бандитами заложников в учреждениях уголовно-исполнительной системы.

1991 — Вильнюс, Литовская ССР. Вечером 11 января 65 офицеров группы «А» во главе с заместителем командира группы М. В. Головатовым и командиром отдела подполковником Е. Н. Чудесновым были направлены в столицу Литовской ССР. В Вильнюсе подразделение получило задачу взять под контроль Комитет по телевидению и радиовещанию, телевизионную вышку и радиопередающий центр. Здания были окружены многочисленными сторонниками литовского движения «Саюдис». Группа «А» взяла под контроль все три объекта и удерживала их до подхода подразделений внутренних войск. Во время захвата здания Комитета по телевидению и радиовещанию погиб лейтенант Виктор Викторович Шатских.

1991 — Москва, Васильевский спуск. Вооруженный ножом преступник захватил в экскурсионном автобусе «Икарус», выехавшем с Комсомольской площади (площадь трех вокзалов), 7-летнюю Машу Пономаренко. В переговорах принял участие депутат Госдумы Аман Тулеев. В результате молниеносно проведенной операции террорист был обезврежен.

1991 — Москва. По приказу председателя КГБ сотрудники группы «А» блокировали в подмосковном поселке Архангельское-2 дачу, в которой находились Президент России Б. Н. Ельцин и лица из его окружения. В дальнейшем, выполняя распоряжение руководства, они осуществляли рекогносцировку вокруг Белого дома. 20 августа перед командиром группы «А» Героем Советского Союза В. Ф. Карпухиным в устной форме была поставлена задача захватить Белый дом, интернировать правительство и руководство России. Для этого «Альфе» были приданы группа «Вымпел» и силы МВД. Без больших человеческих жертв среди гражданского населения взять Белый дом было невозможно. Это было главной причиной отказа офицеров группы «А» участвовать в штурме.

1992 — Москва, аэропорт «Внуково». Освобождение 347 пассажиров рейса Минеральные Воды — Москва, захваченных террористом-одиночкой Захарьевым.

1993 — Москва, Белый дом. Сотрудники группы «А» (старший — командир группы Герой Советского Союза Г. Н. Зайцев) вместе с бойцами «Вымпела» приняли участие в разрешении острейшего политического кризиса, приведшего к массовым акциям неповиновения и боевым действиям в центре российской столицы. Отказавшись штурмовать Белый дом, представители «Альфы» по собственной инициативе вступили в переговоры с руководством Верховного Совета и оппозиции, которые увенчались успехом, а затем обеспечили эвакуацию людей из горящего здания. Спасая раненого солдата у стен Белого дома, смертельное ранение получил младший лейтенант Геннадий Николаевич Сергеев — посмертно ему присвоено звание Героя России.

1993 — Ростов-на-Дону — Краснодар — Минеральные Воды — Махачкала. Четверо террористов захватили в заложники учительницу и 15 учеников 9-го класса «В» средней школы № 25 Ростова-на-Дону. В Ростов-на-Дону на самолете Ту-134 вылетели 53 сотрудника «Альфы» во главе с командиром Героем Советского Союза Г. Н. Зайцевым. К моменту их прибытия бандиты, выпустив трех заложников, уже находились в вертолете Ми-8. Вечером вертолет приземлился в Краснодаре. Следом за ними на Ан-12 приземлилась «Альфа». Ночью 24 декабря вертолет поднялся в воздух, взяв курс на Минеральные Воды. Следом за ним вылетел вертолет со спецназовцами, основная же часть «Альфы» направилась туда самолетом Ан-12. Вечером 25 декабря преступники освободили одного из заложников. После передачи денег они выпустили учительницу и семь школьниц. Оставшихся заложников — четырех школьников, водителя автобуса и двух пилотов — бандиты отпускать отказались. Вечером 27 декабря бандиты освободили трех школьников, водителя автобуса и поднялись в воздух, приказав пилотам взять курс на Ичкерию. Однако летчики, рискуя жизнью, направили машину в сторону Махачкалы. Вертолет с преступниками совершил посадку на северной окраине Махачкалы. Бандиты разбились на пары и попытались скрыться в лесополосе. Однако район их нахождения был оцеплен спецназом МВД Дагестана, который вскоре обезвредил всех преступников.

1994 — Махачкала — Бачи-Юрт. В районе населенного пункта Кинжал Ставропольского края четыре вооруженных бандита захватили экскурсионный автобус «Икарус» со школьниками, их родителями и учителями. В заложниках оказались 33 пассажира автобуса и три подростка, которых бандиты захватили по дороге. В тот же день группа «А» во главе с командиром Героем Советского Союза Г. Н. Зайцевым получила приказ срочно вылететь из Москвы в Минеральные Воды. Такой же приказ был отдан краснодарскому отделению «Альфы». Вечером в Минводы самолетами было доставлено 64 спецназовца. Общее руководство операцией осуществлял командующий внутренними войсками МВД генерал-полковник А. Куликов. 27 мая вертолет поднялся в воздух и взял курс на Ичкерию. Следом за ним стартовало шесть вертолетов, на борту которых разместились 38 бойцов «Альфы», 24 сотрудника ГУОП МВД и 20 военнослужащих спецназа ВВ. В результате нехватки горючего был изменен маршрут полета и совершена посадка в районе селения Бачи-Юрт. Бойцы под командованием офицера «Альфы» подполковника А. Е. Старикова начали преследование. Вертолеты вели наблюдение залесным массивом с воздуха. Через час террористы были обезврежены. Скрыться сумел только один бандит, который унес два автомата и 47 400 долларов, — через год он был арестован и осужден.