Однако начало широкомасштабной операции "Цеппелин" по разложению советского тыла не привело к ожидавшимся переменам в "тайной войне" против СССР.

В этой связи в мае 1943 г. фронтовые команды "Цеппелина" были расформированы и частично влились в состав двух сформированных Главных команд "Цеппелина" на германо-советском фронте - "Русланд Зюд" и "Русланд Митте" (с лета 1943 г. она изменила название на "Русланд Норд").

Начальники "главных команд" подчинялись только "руководящему штабу "Цеппелина" в Берлине, а в практической работе имели полную оперативную самостоятельность. "Главные команды" "Цеппелина" были мощными подразделениями, насчитывавшими несколько сотен сотрудников.

Главная команда "Цеппелина" "Русланд Зюд" дислоцировалась в Крыму, в Симферополе и Симеизе. А зона ее оперативной ответственности простиралась от северных областей Украины до побережья Черного моря.

Задачами являлись вербовка, подготовка и заброска агентов-разведчиков, диверсантов и организаторов повстанческих формирований на Северный Кавказ, Закавказье и в Среднюю Азию. "Кавказское" отделение разведшколы команды действовало в Евпатории, а "туркестанское" - в местечке Освитц (Верхняя Силезия). Заброска агентуры производилась самолетами, главным образом, в районы Кавказа, Закавказья, низовий Волги.

"Русланд Зюд" были подчинены 4 периферийных органа - "ауссенкоманды" с номерами 7 - 10, первоначально дислоцировавшиеся в городах Славянске, Харькове, Таганроге, Керчи.

В декабре 1943 г. "Русланд Зюд" через Одессу была эвакуирована в г. Галац (Румыния).

Главная команда "Русланд Митте" последовательно дислоцировалась в Полоцкой области Белоруссии, затем Пскове, с марта 1944 г.
– в местечке Ассари в 30 км от Риги, а в августе перебазировалась в столицу Латвии. В подчинении "Русланд Митте" имелись 4 периферийных подразделения - "ауссенкоманды".

В конце сентября 1944 г. в результате бомбардировки при эвакуации в Германию команда понесла значительные потери.

Не, помогла однако в переломе в "тайной войне" против России, помимо создания новых фронтовых органов "Цеппелина", также и передача в середине 1943 г. подотдела Абвер - 3 ФПдВ (Фельдполицай-дер-вермахт) в прямое подчинение отдела "Абвер-Аусланд".

Ни ужесточение карательного режима на временно оккупированных территориях Советского Союза, ни увеличение количества перебрасываемой через линию фронта агентуры не приводили желательным для руководства германских спецслужб результатам.

Приведенное ранее вынужденное признание Гиммлером перехода стратегической инициативы на фронтах "тайной войны" к советским органам государственной безопасности, по времени совпало с их очередной реорганизацией, призванной усилить их наступательный потенциал.

14 апреля 1943 г. повторно был образован Наркомат государственной безопасности СССР (нарком В.Н. Меркулов), с возложением на него прежних задач. (В связи с реорганизацией системы государственного управления в Советском Союзе 15 марта 1946 г. НКГБ был переименован в Министерство государственной безопасности СССР). Л.П. Берия остался наркомом внутренних дел, на который также возлагались задачи борьбы с агентурой иностранных спецслужб.

18 апреля также были преобразованы органы военной контрразведки - они стали Главным управлением контрразведки "СМЕРШ" Народного комиссариата обороны СССР (ГУКР "СМЕРШ" НКО), которое возглавил начальник Управления Особых отделов НКВД В.С. Абакумов (до 15 мая 1943 г. он являлся также заместителем Народного комиссара обороны СССР И.В. Сталина).

К числу несомненных достижений В.С. Абакумова как начальника ГУКР "СМЕРШ", следует отнести, в первую очередь, разработку в кратчайшие сроки ряда инструктивно-методических документов для действий оперативного состава подчиненных органов: Инструкции по организации ведения радиоигр с противником (объявлена директивой ГУКР "СМЕРШ" НКО от 16 июля 1943 г.) и Инструкции по организации розыска агентуры разведки противника (директива ГУКР "СМЕРШ" НКО от 9 сентября 1943 г.). Данные документы были призваны рационализировать работу военных контрразведчиков, что способствовало повышению ее эффективности и результативности.

Отныне уже не Второе (контрразведывательное) управление НКГБ СССР, а ГУКР "СМЕРШ" рассылал в подчиненные органы - Управления военной контрразведки "СМЕРШ" фронтов и в подчиненные им отделы "СМЕРШ", а также в НКВД и НКГБ СССР, ориентировки по розыску выявленных агентов германских, финских и иных разведорганов противника, действовавших на советско-германском фронте.

Обобщив все ранее добытые органами государственной безопасности данные о германских спецслужбах, уже в августе 1943 г. ГУКР "СМЕРШ" подготовил справочник "Органы германской разведки, действующие на советско-германском фронте", который также широко использовался в розыскной и следственной работе НКВД и НКГБ СССР, и сыгравший заметную роль в разоблачении германской агентуры. В этом справочнике содержались систематизированные сведения о задачах, местах дислокации, личном составе абверкоманд и абвергрупп, приданных их разведывательных школах, особенностях подготовки и использования агентуры, а также приметы и характеристики на выявленных агентов, объявленных в оперативный розыск. (Аналогичный справочник об органах финской разведки был подготовлен в марте 1944 г.).

Накопленный за предыдущие годы военными контрразведчиками опыт позволял им теперь заводить оперативные разработки конкретных разведывательных, контрразведывательных и карательных органов противника, действовавших на временно оккупированной советской территории в зоне ответственности УВК "СМЕРШ" соответствующих фронтов. Это позволяло не только заводить с ними радиоигры и дезинформировать их относительно "эффективности" разведывательно-подрывной деятельности, но и проводить операции по агентурному проникновению, обеспечивавшие выявление официального состава и агентуры этих органов, готовить и проводить мероприятия по их ликвидации, а также по захвату личного состава, агентуры, зданий и документов.