От царя пришёл новый указ – схватить (арестовать) Шакловитого и доставить в Троицу в железах (в цепях) для сыска (следствия) по делу о покушении на царя, а все, кто поддержит Шакловитого, разделят его судьбу.

Остававшиеся в Москве стрельцы потребовали от Софьи выдачи Шакловитого.

Она сначала отказывалась, но была вынуждена уступить. Шакловитый был отвезён в Троицу, под пыткой дал признание и был обезглавлен. Одним из последних явился в Троицу князь Василий Голицын, где он не был допущен к царю, и сослан с семьёй в Пинегу, в Архангельский край.

У правительницы не осталось приверженцев, готовых рискнуть головой ради её интересов, и когда Пётр потребовал, чтобы Софья удалилась в Святодуховский монастырь (Путивль), ей пришлось подчиниться.

Вскоре Пётр решил, что держать её вдалеке небезопасно, и перевёл в Новодевичий монастырь. В монастыре к ней была приставлена стража.

Жизнь в монастыре, смерть

Во время стрелецкого восстания 1698 года стрельцы, по данным следствия, намеревались позвать её на царство. После подавления бунта Софья пострижена в монахини под именем Сусанны.

Умерла 3 (14) июля 1704, перед смертью постриглась в великую схиму, взяв себе прежнее имя, София.

Похоронена в Смоленском соборе Новодевичьего монастыря в Москве.

Но в этой печальной истории есть и одно важное противоречие!

Дело в том, что в старообрядческом скиту Шарпан находится захоронение схимницы Прасковьи («царицына могила») в окружении 12-ти безымянных могил.

Староверы считают эту Прасковью царевной Софьей, якобы бежавшей из Новодевичьего монастыря с 12-ю стрельцами.

Прошло темного столетий, а этот спор не решен.

Хотя можно было бы провести эксгумацию могилы царицы Прасковьи и провести генетическую экспертизу по идентификации ее с царевной Софьей! И возможно так нам бы отрылась и еще одна тайна российской истории.

А подводя итог этой части я скажу кратко: так был расчищен путь на царский трон Петру Первому!

Но о Петре Первом и всех связанных с ним тайнах российской истории мы поговорим уже в последующих частях данной работы.

Продолжаем наше новое историческое расследование. И теперь когда вы уважаемый читатель уже точно знаете обо всех событиях, что произошли в Московском царстве сразу после смерти царя Алексея Михайловича и до единоличного восшествия на царский трон молодого Петра Первого, мы с вами имеем полное «моральное право», вернуться к главному сюжету нашего исторического расследования, в ходе которого нам предстоит выяснить:

Как? Когда? и Кем был убит царь Алексей Михайлович?

И тут, я вновь напомню, что 30 января (9 февраля) 1676 года царь Алексей Михайлович "Тишайший" скоропостижно скончался на 47 году жизни будучи как говорится мужчиной» в полном соку" , жизнелюбивым и планировавший жить еще долго и счастливо!

И чтобы погрузить современного читателя в описываемое нами историческое время для лучшего понимания описываемых событий, я далее приведу воспоминания очевидца этих событий!

Это иноземец Рейтенфельс Я. и его книга "Сказания светлейшему герцогу Тосканскому Козьме Третьему о Московии // Утверждение династии." – М. Фонд Сергея Дубова. 1997. С. 289-290

Справка: Якоб (Яков) Рейтенфельс (в русских источниках XVII века также упоминается как Яков Рутфель; нем. Jacob Reutenfels; точные годы жизни неизвестны) – путешественник и дипломат, уроженец Курляндии; автор книги о Московии.

О его жизни сохранилось мало достоверных сведений. Его отец, по свидетельству самого Рейтенфельса, был влиятельным вельможей при дворе польского короля Яна II Казимира, а его дядя, Иоганн Костер фон Розенбурх, был личным врачом царя Алексея Михайловича. Известно ходатайство Розенбурха, датированное 1672 годом, о направлении Рейтенфельса для учёбы в Вильну с последующим поступлением на русскую службу. Хотя оно было удовлетворено, об учёбе Рейтенфельса в Вильне ничего не известно; есть достоверные сведения, что он пребывал в Москве с 1670 по 1673 год.

В 1674 году Рейтенфельс находился в Риме, где познакомился с Атанасиусом Кирхером. Приобретя определённое влияние, он пытался реализовать проекты массовой посылки в Россию католических миссионеров, созданию церковной унии, заключения с Россией союза против Османской империи, развития торговли с Русским государством. Потерпев неудачу, Рейтенфельс переселился во Флоренцию и поступил на службу к великому герцогу Козимо III Медичи, где добился высокого положения. Перед отъездом в Польшу в 1676 году он посвятил правителю Тосканы свою книгу; далее следы Рейтенфельса теряются.