Не прошло и года после возвращения, как Массино предъявили еще одно обвинение по РИКО: вместе с Расти Растелли он обвинялся в рэкете и вымогательстве. Массино был доставлен в свой дом на Говард-Бич и вежливо попросил надеть на него наручники на улице, а не в присутствии жены и дочерей-подростков Аделин и Джоанны. «Поскольку он всегда был джентльменом и сердечно общался с нами, Маршалл оказал ему эту услугу.

Вскоре после этого, в июне 1985 года, Маршалл снова набросился на него в Говард-Бич, когда тот сидел и разговаривал в припаркованном «Бьюике» Сэла Витале возле дома Джо. На этот раз Маршалл преследовал обоих мужчин. В деле об убийстве трех капо было выдвинуто дополнительное обвинение против Массино: сговор с целью убийства Джозефа До Пасторе, ростовщика и бутлегера, который был застрелен в квартире над магазином J&J Deli десять лет назад. В дополняющем обвинительном заключении Витале также фигурировал, но не как обвиняемый в одном из четырех убийств, а как соучастник предполагаемых угонов.

В наручниках свояков посадили в отдельные машины ФБР, а Маршалл поехал в одной машине с Массино и двумя другими агентами. Из-за большого роста Массино Маршаллу понадобилось два комплекта наручников, чтобы закрепить его руки за спиной. Когда агенты остановились на светофоре, рядом с ними с визгом затормозила другая машина. К ним приближалась внушительная фигура Джона Карнелья, одного из головорезов Джона Готти, который жил по соседству и помогал Массино избавляться от тел трех капо. Хлопнув рукой по крыше машины ФБР, Карнелья потребовал: «Джоуи, ты в порядке?». Агенты, зная о ненависти Карнелья к представителям закона и его репутации склонного к насилию, потянулись к пистолетам. «Убирайтесь отсюда, пока не пострадали», — предупредил Карнелья один из агентов. После обмена ледяными взглядами Карнелья отступил, сказав, что позвонит адвокату Массино.

Во время задержания Маршалл отметил, что у Массино было много денег: в его карманах лежало 3192 доллара. Он быстро собрал залог в 1 миллион долларов за новые обвинения. В соответствии со своим положением важного мафиози, Массино казался невозмутимым, готовясь к двум предстоящим битвам по РИКО. Он продолжал появляться в своих привычных местах в Маспете, контролируя свой полулегальный бизнес по продаже тараканов и продуктов питания, а также свои подпольные предприятия мафии. Он даже нашел время порезвиться в казино Caesar's Palace в Атлантик-Сити, где набрал 15 000 долларов на кредитную линию, которые так и не выплатил.

В редких случаях Массино, за которым велась слежка, проявлял осторожность, когда появлялся на публике вместе со своим давним товарищем по мафии Джоном Готти, который в то время был капо Гамбино. Демонстрируя свои отношения, два мафиози из разных семей были часто замечены в гостях друг у друга в своих клубах. Не обращая внимания на запрет Комиссии на близкие отношения с изгнанными Бонанно, Готти демонстрировал мафиози свое доверие к Массино. Одним из демонстративных примеров их близких отношений стало присутствие Массино на свадьбе Виктории Готти в 1984 году. Год спустя, после смерти главаря Гамбино Аниелло Деллакроче, Массино прибыл на поминки Деллакроче в той же машине, что и Джин Готти. Его появление рядом со скорбящими братьями Готти было ответным знаком его поддержки в их яростной конфронтации с боссом Гамбино Полом Кастеллано. (Некоторое время спустя подслушивающие записи ФБР всколыхнут Массино, когда он узнает, что Готти в разговорах с приятелями пренебрежительно называл его «китом» и «панком»).

Весной 1986 года Массино наконец-то предстал перед Федеральным окружным судом в Бруклине на первом процессе в качестве соответчика вместе с Расти Растелли, главной целью правительства. Крестный отец Бонанно был обвинен годом ранее на Манхэттене по делу Комиссии, но эти обвинения были сняты в пользу гигантского дела о трудовом рэкете против него, Массино и десяти других обвиняемых. На протяжении двух десятилетий главари Бонанно и чиновники профсоюза 814 объединялись для систематических, стандартных расправ. Мафиози и коррумпированные профсоюзные боссы ежегодно выкачивали более 1 миллиона долларов из крупнейших нью-йоркских компаний по перевозке и хранению грузов, подтасовывая контракты и вымогая отступные, чтобы избежать проблем с трудоустройством.

Огорченный Массино считал, что ему досталось за безделье. «Я не заработал ни копейки», — говорил он своим коллегам в ответ на обвинения в том, что он получил огромную прибыль от заговора. Решающие показания дал признанный коррумпированным член профсоюза Энтони Джилиберти, который сотрудничал с правительством, пережив неудачное покушение. Массино признался другим мафиози, что надавал пощечин Джилиберти: «Я дал ему затрещину». В масштабах мафиозных злодеяний он считал легкое избиение несправедливым поводом для обвинения. Джилиберти, которому угрожал Массино, был уверен, что тот стоял за заговором с целью его убийства, но это обвинение не было выдвинуто против Массино.

Повседневно одетый в готовые темные костюмы и спортивные пиджаки, Массино был более учтив и весел с прокурорами и агентами в зале суда, чем его коллеги-подозреваемые. Лаура Бреветти, ведущий прокурор из федеральной ударной группы по борьбе с организованной преступностью, заметила его легкомысленное отношение во время перерыва в почти безлюдном зале суда. В тот день Бреветти использовала диаграмму, иллюстрирующую фальсификацию предложений и завышенные цены, которые поглощала компания по переездам, обвиняемая в предоставлении 5-процентных откатов Бонанно. Изучая диаграмму и упоминая о сверхприбылях, полученных главой фирмы, Массино хмыкнул достаточно громко, чтобы прокурор услышал: «Кажется, этот сукин сын должен мне денег». (По иронии судьбы, один из контрактов, надутый мафией, заключался в перевозке мебели и оборудования ФБР в новые офисы в центре города).

Столкнувшись с Пэтом Колганом в зале суда, Массино дружелюбно поприветствовал своего давнего противника. «Привет, Пэт, я слышал, тебя повысили, — сказал Массино, сообщив, что знает о назначении агента ФБР на руководящую должность. — «Я слышал то же самое о тебе, Джоуи». Огромная ухмылка была молчаливым ответом Массино.

Растелли страдал эпилепсией, и Массино несколько раз приходил ему на помощь во время судебного процесса. Однажды Массино продемонстрировал свою исключительную силу, открыв дверь телефонной будки и вытащив зажатого Растелли во время припадка. Он также утешал Растелли и следил за тем, чтобы он не прикусил язык, когда тот рухнул за стол защиты. Во время этого припадка с Растелли слетели мокасины, и когда Массино поднял их, Бреветти услышал, как другой обвиняемый, Николас «Ники Очки» Маранджелло, бывший подчиненный босса, сказал: «Не спеши натягивать эти ботинки, Джо».