Жесткие меры не могли не вызвать сопротивления со стороны гордого народа — и в Гранаде вспыхивают восстания. Но что могла сделать кучка мавров против многотысячных войск испанского короля? Конечно, восстания были подавлены, и к 1501 году арабское население Гранады стало полностью католическим.

В 1502 году появляется королевский указ, по которому всем некрещеным маврам предписывалось в трехмесячный срок покинуть Испанское королевство. Большинство мавров предпочло креститься, чем покинуть страну, но как для них, так и для евреев, крещение не послужило действительной гарантией от преследований инквизиции.

Все провинции Испании, где проживали мавры, сделались театром непрекращающейся гражданской войны. Восстания вспыхивали одно за другим, и кровь лилась рекой.

Оставшихся в Испании мавров, насильственно принявших католичество, стали называть морисками (от латинского слова «moro» — мавр).

Испанский король и германский император Карл V, надо отдать ему справедливость, вступил на престол с намерением, внушенным ему воспитателем Вильгельмом де Круа и канцлером Сельваджио, уничтожить инквизицию или по крайней мере реорганизовать ее согласно с требованиями естественного права. Поэтому он с благосклонностью принял петиции, адресованные ему единогласно кортесами Кастилии, Арагонии и Каталонии в 1518 году. К несчастью, Сельваджио, на которого возложено было составление нового кодекса инквизиции, умер, а Великий инквизитор Адриан, сделавшийся впоследствии папой, сумел так повлиять на короля, что постепенно сделал из него страстного покровителя инквизиции.

Тогда начался период интриг перед римской курией, волновавших всю Испанию в течение двух лет.

Папа Лев X, бывший тогда в ссоре с инквизицией за допущение восстаний и народных волнений, был склонен поддержать мавров Арагона, взбунтовавшихся против власти Карла V. Он издал грамоты, коими все инквизиторы отставлялись от должностей, а на епископов и состоящие при них советы возлагалось избрание новых кандидатов. Однако в намерения папы не входило прекращение преследований, обусловленных нетерпимостью католицизма, и он не мог допустить свободу совести и мысли. Речь шла лишь об изменении некоторых деталях методов «психологического» угнетения.

Инквизиторы отказались повиноваться папе, а Карл V послал в Рим специального посла с поручением добиться отмены папских грамот. Папа приостановил приведение в исполнение своих решений, но не отменил их. Булла — папская грамота — о реформе не была приведена в исполнение, и инквизиция продолжала свое дело.

В то время как изложенные события происходили в Арагоне, Кастилия восстала против инквизиции; во главе восстания встал епископ Замара и несколько священников. Восстание было подавлено, а епископ казнен.

Великий инквизитор Адриан, выделявшийся своим рвением в уничтожении еретиков, был избран папой по смерти Льва X и вступил на престол в 1522 года под именем Климента VII.

С его благословения Карл V потребовал в 1525 году, чтобы христианизация всех арабов бывших королевств Арагона и Валенсии была завершена в максимально короткие сроки. И в 1527 году он радостью пишет папе о том, что ислам полностью изгнан из Испании, но при этом добавляет, что крещение для многих мавров не было добровольным и что многие из новых христиан — морисков — не очень хорошо понимают католичество.

Справедливости ради необходимо отметить, что среди духовенства Испании были и истинные гуманисты-просветители. К их числу относится епископ Антонио де Гевара, который стремился приобщить к новой вере мавров не только формально. Однако эти попытки «евангелизации» арабов успехов не имели.

И с середины 1520-х годов за дело искоренения ереси среди морисков берется инквизиция. В 1529 году в Гранаде происходит первое аутодафе, на котором были сожжены первые три мориска.

Особо отличился во времена преследования мавров инквизитор Родригес де Герреро. Основным его свойством была необыкновенная жестокость, благодаря которой он получил название Сумрачный. В 1566 году он подал королю Филиппу II меморандум с перечнем отступлений от веры морисков.

Филипп поручил рассмотрение этого вопроса особому совету под председательством Великого инквизитора Эспиноза. Было решено единогласно прибегнуть к огню и мечу и восстановить действие декрета, изданного Карлом V в 1526 году, но оставшегося без применения, в котором арабам строго воспрещается говорить и писать на арабском языке как публично, так и у себя дома. Морискам предписывалось говорить и писать только по-кастильски, выдать свои арабские книги для сожжения, отказаться от всех обрядов, костюма, имен и обычаев мавританского происхождения, равно как от пользования горячими банями. Свадебные обряды у мавров должны были с этого момента совершаться публично по христианскому обряду, причем двери дома, где совершалось бракосочетание, должны были целый день оставаться открытыми, чтобы каждый мог убедиться в том, что там не совершается запрещенных обрядов. Мавританские женщины должны ходить по улицам с открытым лицом.

Подобный декрет мог только вызвать последнее, самое страшное восстание.

Декрет был провозглашен с большой торжественностью на площади Гранады особым герольдом при звуке труб и барабанов. Мавры слушали чтение этого распоряжения со слезами стыда и бешенства. Ужас, отвращение и негодование овладело всеми сердцами.

Восстание вспыхнуло бы немедленно, если бы мавры, живущие в городе, развращенные и изнеженные роскошью, не сдержали своих соотечественников, живущих в горах.

Начались переговоры с королем, длившиеся целый год и оказавшиеся совершенно бесполезными. И в это же время были изданы новые королевские указы, в которых было предписано маврам отдавать своих детей от трех до пятнадцати лет на воспитание в христианские школы.