Складывающаяся обстановка на кордонной линии не позволяла больше казакам довольствоваться полумерами и бесплодными переговорами.

17 апреля 1800 г. на имя войскового атамана Бурсака последовал царский рескрипт, которым разрешалась организация военных экспедиций в Закубанье. Для поддержания и усиления боевых сил черноморцев на Кубань были откомандированы 14–й и 15–й егерские полки Драшкевича и Лейхнера.

Поход против горцев проводился тремя отрядами в мае 1800 г. Цель экспедиции была четко определена рескриптом Павла I, в котором говорилось: «Господин полковник Бурсак! По случаю покушений, делаемых черкесами и абазинцами на селения вверенного вам Черноморского войска, дал я повеление… учинение оным горским народам репрессалий, в наказание их дерзости».

Военные действия начались серией мелких стычек, переросших затем в более серьезную борьбу. Казакам удалось захватить аулы Арслан–Гирея и Давлет–Гирёя на р. Аушет. Разорив эти аулы, они захватили огромную добычу: более 1,5 тыс. голов скота.

Горцы отрядом в 500 человек попытались заманить казаков в лес, где была устроена засада. Но натиск отряда Бурсака при столкновении с засадой в лесу был настолько велик, что горцы дрогнули и начали отступать. Казачий отряд, преследуя их, прошёл 30 верст к горам, но, не встретив сопротивления, повернул обратно.

После столь ошеломляющего похода в Закубанье горцы до 1802 г. не предпринимали крупных нападений на Черноморию.

Но в 1802 г. им удалось захватить войсковой байдак, везший из Бугаза в Екатеринодар 200 пудов пороха, 200 пудов свинца и трехфутовое орудие, которое было на вооружении байдака. Событие это вызвало ответную реакцию.

Войсковое начальство Черномории обратилось к императору с просьбой о разрешении совершить ответные репрессалии, чтобы наказать виновных и вернуть захваченный пброх и свинец. После этого случая было дозволено проводить экспедиции за Кубань по необходимости, не спрашивая разрешения сверху.

В царском рескрипте от 31 декабря 1802 г., коренным образом изменившим систему отношений черноморцев с горцами, говорилось: «1. Наистрожайше подтвердить всем командующим дистанциям по границе отнюдь никакой несправедливости соседним народам не делать, а иметь с ними дружественное обращение и всячески стараться приобрести их доверенность; всякий же противный сему поступок наистрожайше наказан будет… 2. Если, невзирая на сие доброе обращение, соседственные народы будут беспокоить границу нашу, тогда немедленно сделать им репрессаль и преследовать их, если нужда того востребует, в пределы к ним; но неучаствующих в учиненном злодеянии не трогать, а оставлять в покое и тем доказать им, что наказание единственно на виновных всегда простирается. О всяком таком происшествии и репрессалии мне доносить обстоятельно, означив именно за что оно учинено».

В течение 1803–1804 гг. горцы совершили целый ряд нападений на Черноморию в районе Петровского, Александровского, Копыльского, Протоцкого постов. Ответом были походы черноморцев, иногда по просьбе дружественных России черкесов.

Так, в октябре 1807 г. состоялась закубанская экспедиция по просьбе «мирных» черкесов. Полковник Еремеев с четырьмя полками и несколькими орудиями был отправлен на защиту преданных России князей. К казачьим отрядам присоединилось несколько тысяч черкесских наездников, которые перевязали правые руки белыми платками, дабы отличаться от неприятеля. Эти объединенные силы нанести ощутимый удар шапсугам и абадзехам.

В последующие годы боевые действия в форме набегов и походов в различной степени интенсивности продолжались с переменным успехом.

Из военных событий этого периода, пожалуй, наиболее показательно и характерно сражение у Ольгинского кордона. В январе 1810 г. несколько тысяч черкесских воинов перешли р. Кубань вблизи Ольгинского поста, где под началом полковника Тиховского было всего 150 казаков. Конная партия горцев, предоставив блокаду поста пешим, устремилась в глубь Черномории и напала на ст. Ивановскую.

На помощь Ольгинскому посту сумели прорваться только 50 казаков с Екатериненского поста во главе с есаулом Гаджановым. Со столь небольшими силами Тиховский решился атаковать неприятеля, заметив, что пешие черкесы двинулись в глубь территории. В течение некоторого времени маленький отряд с успехом отражал атаки превосходящего противника, умело используя орудия. Даже подоспевшая помощь из-за Кубани не дала горцам перевеса. Но в самый кульминационный момент боя на отряд Тиховского налетела черкесская конница, отбитая у ст. Ивановской егерями Бахманова. Ее появление и решило исход битвы. Практически весь отряд пал на поле сражения, В 1816 г. войска, дислоцированные на Кавказе, были объединены в Отдельный Грузинский корпус под командованием героя войны 1812 г. генерала А. П. Ермолова. Сторонник жесткого курса в отношении горских племен, он предпринял ряд мер по активизации наступательных действий.

Ермолов был крайне недоволен боевым состоянием Черноморского казачьего войска, кордонной линией и несением пограничной службы. Он отмечал, что черноморцы, не раз допускавшие врагов безнаказанно вторгаться в их земли, «нерадиво несут службу, и часто закубанцы, делая частые и весьма удачные набеги, содержат их в большом страхе».

За небрежности по службе казаков начали придавать военному суду, штрафовать провинившихся офицеров; пленных казаков, «чтобы черкесы не льстились на выкуп», приказано было не выкупать.