Верховным Советом СССР 1 сентября 1939 г. был принят Закон о всеобщей воинской обязанности, который завершал перевод вооруженных сил на кадровое положение. Этим законом устанавливались новые сроки прохождения военной службы, нахождения в запасе, порядок призыва, начальной и допризывной подготовки. Сроки действительной военной службы рядового и сержантского состава в Сухопутных войсках и авиации были увеличены до трех лет, на флоте – до пяти лет. В армию призывались лица, которым исполнилось 19 лет, окончившие среднюю школу – в 18 лет.

К середине 1941 г. общая численность армии и флота превышала 5 млн чел. и была в 2,8 раза больше, чем в 1939 г.

С учетом качественных изменений, произошедших в вооруженных силах, летом 1940 г. было принято решение о введении полного единоначалия в армии и на флоте. Указом Президиума Верховного Совета СССР «Об укреплении единоначалия в Красной Армии и Военно-морском флоте» от 12 августа 1940 г. институт военных комиссаров был в очередной раз отменен. Должность комиссара снова была заменена должностью помощника командира по политической работе.

Великая Отечественная война внесла существенные коррективы в организацию жизнедеятельности политсостава армии и флота, системы подготовки кадров политработников. В рамках перестройки всей жизни страны и вооруженных сил на военный лад Президиум Верховного Совета СССР 16 июля 1941 г. издал указ «О реорганизации органов политической пропаганды и введении института военных комиссаров в Рабоче-крестьянской Красной Армии». В указе отмечалось, что война расширила объем политической работы и потребовала, чтобы политработники не ограничивали свою работу пропагандой, а взяли на себя ответственность также и за военную работу на фронтах. Этим указом в полках, дивизиях, штабах, военно-учебных заведениях и учреждениях Красной Армии был введен институт военных комиссаров, а в ротах, батареях, эскадронах – институт политических руководителей. 20 июля 1941 г. данное решение было распространено на Военно-морской флот.

В августе 1941 г. должность военного комиссара была введена во всех батальонах и ротах танковых войск, в дивизионах и батареях артиллерийских частей, в сентябре – должность военкома штаба во всех дивизиях, а в начале декабря – должность военкома батальона стрелковых частей и соединений.

Главные управления политической пропаганды Красной Армии, а также Военно-морского флота были преобразованы в Главное политическое управление Рабоче-крестьянской Красной Армии (ГлавПУ РККА) и Главное политическое управление Рабоче-крестьянского Военно-морского флота (ГлавПУ РКВМФ). Управления и отделы политической пропаганды в войсках и на флотах были реорганизованы в политические управления и отделы.

Эти меры вызывались условиями фронтовой обстановки, возросшей ролью политработы, нехваткой опытных кадровых командиров. Только небольшая часть командиров, призванных из запаса, имела военное образование. В начальный период войны намного расширялся объем партийно-политической работы. Политработники не могли ограничиваться только пропагандой и агитацией, они должны были осуществлять и другие важные функции.

Следует подчеркнуть, что введение института военных комиссаров было временной, чрезвычайной мерой, оно не означало принципиального отказа от единоначалия как наиболее целесообразного принципа руководства и управления войсками и силами флота. Институт военных комиссаров не преследовал цели контроля за действиями командиров, не вызывался недоверием к ним. Основное в деятельности военных комиссаров периода Великой Отечественной войны – это помощь командирам в решении боевых задач. В сравнении с функциями заместителя командира по политической части комиссар имел больше прав, но и нес большую ответственность.

Указом Президиума Верховного Совета СССР «Об установлении полного единоначалия и упразднении института военных комиссаров в Красной Армии» от 9 октября 1942 г. институт комиссаров был заменен институтом заместителей командиров по политической части [3] .

В соответствии с этим Указом Президиума Верховного Совета СССР 9 октября 1942 г. был издан приказ народного комиссара обороны СССР № 307 «Об установлении полного единоначалия и упразднении института военных комиссаров в Красной Армии». На командиров (начальников) целиком возлагалась ответственность за все стороны жизни и деятельности частей, соединений и учреждений Красной Армии. В соединениях, частях, штабах, подразделениях, военно-учебных заведениях, центральных и главных управлениях комиссариата обороны и учреждениях Красной Армии вводился институт заместителей командиров по политчасти. Для политработников устанавливались общие для всех командиров воинские звания и знаки различия.

Заместители по политической части не имели комиссарских полномочий, их функции ограничивались политической работой среди личного состава. В большинстве своем после замены должностей комиссары частей и соединений автоматически стали заместителями по политической части. Тем из них, кто имел воинские звания политсостава, были присвоены общевойсковые воинские звания (как правило, по занимаемой на момент переаттестации должности обычно на ступень ниже штатного звания соответствующего командира). Вместе с тем должности членов военных советов фронтов и армий сохранялись.

В настоящее время происходят переоценка и переосмысление истории Советского государства. К тематике функционирования института военных комиссаров сегодня обращаются многие исследователи отечественной военной истории. Однако и на сегодняшний день, несмотря на имеющиеся разрозненные диссертационные исследования и публикации, тема создания и функционирования этого института, его места и роли в жизнедеятельности вооруженных сил нашей страны является недостаточно разработанной.

Исследование такой многоплановой темы позволяет глубже понять роль военных комиссаров в создании массовой регулярной Красной Армии, в достижении победы в Гражданской войне и в совершении перелома в Великой Отечественной войне.