3 ноября все прибыли в Глухов. Сотник Туранский встретил прибывших как хозяин места. В тот же вечер полковники и прочие начальные лица собрались у князя Долгорукого и обменялись с ним взаимными предположениями о выборе.

На другой день, 4 ноября, в Глухов прибыл и сам царь. Князь Долгоруков, переговоривший с полковниками, сообщил Петру, что достойнейшими получить гетманский сан казаки считают двух полковников: черниговского и стародубского. «Полуботок очень хитр, – сказал Петр, – с него может выйти другой Мазепа. Лучше пусть выберут Скоропадского». Обстоятельства были таковы, что при малочисленности участников выбор вольными голосами мог считаться только для вида, а на самом деле гетманом должен был стать тот, на кого укажет царь.

5 ноября 1708 г. по приказу царя в городе Глухове состоялась театрализованная церемония лишения Мазепы гетманства и его последующей заочной казни. На церемонии помимо старшины и рядовых казаков присутствовали многочисленные представители малороссийского и русского духовенства во главе с Феофаном Прокоповичем. На эшафоте была возведена виселица, к которой привязали куклу, изображавшую Мазепу в полный рост, в гетманском облачении и со всеми регалиями. Взошедшие на эшафот андреевские кавалеры Меншиков и Головкин разодрали выданный Мазепе патент на орден Андрея Первозванного и сняли с куклы андреевскую ленту. Лишенную «кавалерии» куклу палач вздернул на виселице.

На следующий день собралась Рада. После литургии и молебна в церкви Святой Троицы малороссийские полковники и старшины вышли на улицу, где уже стояла толпа казаков и посполитых. Князь Григорий Долгоруков произнес вступительную речь, а посольский дьяк Родостамов, встав на стол, прочитал царскую грамоту.

«Теперь, – сказал князь Долгоруков, – по древнему вашему обыкновению пусть все войско малороссийское и народ, съехавшийся на избрание гетмана, подают голоса, кому быть гетманом».

Он отошел. Должно было произойти совещание. Но все уже было решено заранее.

«Быть гетманом стародубскому полковнику Ивану Ильичу Скоропадскому! – провозгласили начальные люди. – Понеже он человек есть царскому величеству верный и в войске малороссийском заслуженный и в делах искусный».

«Я стар, – отвечал Скоропадский. – Я не могу снести такого тягостного уряда. Гетманом быть следует человеку молодому и заслуженному. Изберите черниговского полковника Полуботка».

Большинство казаков действительно расположено было тогда избрать Полуботка. Его все любили. Полуботок притом был всегда верен царю.

Павел Полуботок и его отец Леонтий много лет конфликтовали с Мазепой. Однако полковники и старшины были заранее предупреждены, что царь хочет именно Скоропадского. Посему старшины предупредили дальнейшие толки, еще раз провозгласив имя Скоропадского. Схватили его под руки и поставили на стол, с которого перед тем посольский дьяк читал царскую грамоту. Скоропадский поклонился и сказал, что недостоин такой чести. «Нет, нет, – кричали старшины, – ты достоин! Ты – старый и верный слуга царского пресветлого величества». Затем все ему кланялись и поздравляли с возведением в гетманское достоинство.

Тогда князь Долгоруков по принятому обычаю вручил новоизбранному гетману один за другим клейноты: бунчук, знамя, булаву, царскую грамоту и печать малороссийского края, сделанную по образцу печати, применявшейся прежними гетманами. По окончании этого обряда все пошли в церковь. Там после эктении, в которой за именем царя помянули имя нового гетмана, Скоропадский присягал по присяжному листу, выданному из посольского приказа. В этой присяге, кроме обычного обещания верности, гетман обязывался не водить пересылки и сообщения с царскими неприятелями, особенно с бывшим гетманом Мазепой, и доносить царю о всякой «шатости» и склонности к сношениям с неприятелями в малороссийском народе. Произнесением присяги руководил глуховский протопоп Борзаковский. Полковники со своими полковыми старшинами стояли тут же, но сами присягнули уже после, 9 ноября, когда к ним присоединился приехавший на избирательную Раду наказной лубенский полковник Василий Савич со своими полковыми старшинами.

Во время Рады Петр находился в помещении Меншикова вместе с фельдмаршалом Шереметевым и канцлером Головкиным. Новоизбранный гетман с полковниками и полковыми старшинами явился к царю на поклон. Царь поздравил его, а за царем поздравили и вельможи. Гетман уехал от царя с почетом – в карете, запряженной шестеркой лошадей, в сопровождении князя Долгорукого. Вечером гетман дал обед, к которому были приглашены полковники и полковые старшины. Целый день происходила стрельба, а народу разбрасывались от новоизбранного гетмана деньги в бумажных свертках, от семи алтын до гривны в каждом свертке.

Петр и его походная канцелярия оставались в Глухове несколько дней. 11 ноября туда приехали киевский митрополит Иоасаф Кроковский со своим духовенством и переяславский епископ Захария Корнилович. 12 ноября в той же Троицкой церкви, где происходила присяга гетмана, после литургии в присутствии царя, вельмож и малороссийских чинов служился молебен, а после молебна духовными властями была провозглашена анафема и вечное проклятие вору и изменнику Мазепе. Новгородсеверский протопоп Афанасий Заруцкий говорил проповедь, в которой вспоминал прежде бывших изменников и оправдывал проклятие, наложенное на Мазепу.