А для юристов Десницкий считал совершенно необходимым широкое фундаментальное общее образование. «Незнание закона отечественного всегда почиталось, даже у древних, бесчестным для тех, коим доверенность возложило отечество наблюдать и производить в действование закон». Десницкий впервые добился учреждения кафедры русского законоведения, которую возглавлял с 1773 г., затем разделения ее на теоретическую и практическую и был первым преподавателем курса русского права. Он настоял, чтобы русскому праву было отведено одно из главных мест в учебной программе. Именно Семен Ефимович создал традиции преподавания русского законоискусства, которые сохранились в университетской жизни и после введения в 1835 г. нового устава, формально исключившего эту дисциплину из программы юридического факультета. Кафедру практического законоискусства возглавляли ученики и единомышленники Десницкого. Он стремился расширить рамки юридического образования, ставил перед ним важные задачи. Изучение отечественных законов считал необходимой частью воспитания. С его кафедры до слушателей доносилось живое слово о высших началах справедливости.

Вообще Десницкий был сторонником развития науки и просвещения, высказывался за введение всеобщего образования. Его лекции отличались смелыми и широкими обобщениями острых вопросов философии и права и имели большое влияние на слушателей. Взгляды и мысли отличались свежестью и оригинальностью. Эрудиция, талант быстро принесли молодому профессору широкую известность и уважение студентов. Спустя десятилетия еще сохранялась в университетских преданиях, передаваемых студентами из поколения в поколение, слава Десницкого.

К сожалению, научно-литературное наследство выдающегося российского ученого невелико, печатных работ мало. Это была общая беда российской науки того времени: руководство университета не видело необходимости в популяризации идей передовых ученых путем их публикации, что резко суживало круг людей, имеющих возможность с ними ознакомиться. Это же привело к тому, что взгляды российских ученых, во многом опередивших западную науку, были совершенно незнакомы их коллегам за рубежом. Отдельные представители науки выступали с предложениями печатать труды и обменивать их на книги западноевропейских ученых. Но, к сожалению, руководство посчитало реализацию этой идеи излишней, что, конечно, обеднило и российскую, и европейскую науку.

По этой причине мы может судить о взглядах Десницкого лишь по его лекциям, речам, произнесенным по торжественным случаям и во многих отношениях являющимся интересным литературным памятником. Во время пребывания в университете профессор сделал ряд докладов, в которых обобщал свои научные исследования и развивал идеи по государственно-правовым вопросам. Главный же научный труд С.Е. Десницкого «Представление об учреждении законодательной, судительной и наказательной власти в Российской империи», подготовленный им в 1768 г. для законодательной Комиссии и содержавший план государственных преобразований, был долгие годы неизвестен современникам и опубликован лишь в 1905 г.

Но и ранее опубликованные материалы свидетельствуют о необычайной широте научных интересов Десницкого, его новаторском и оригинальном мышлении. Попробуем коротко напомнить хотя бы некоторые из его основополагающих воззрений.

Ученый был не удовлетворен состоянием юридической науки своего времени. По его мнению, она занималась мелочами и сводилась «к безмерному и беспорядному множеству законоучительских примечаний, которых прочтение отнимало у всех почти размышление, утомляло рачительную память и в изнеможение приводило всю остроту разума и рассуждения». Десницкий первый переработал нормы российского законодательства в правовые определения и создал цельную систему русского права.

По вопросу о происхождении государства Десницкий стоял на точке зрения, что оно тесно связано с появлением собственности. Искал не только истоки происхождения власти, но и видел зависимость ее от эволюции собственности, которая развивается по общественным законам. Основным источником власти при всех формах правления считал богатство.

Учитывая уровень развития общественных наук в то время, анализ Десницким происхождения и развития частной собственности признан выдающимся. Значительный интерес имеют представления ученого о происхождении права. По его мнению, правовые нормы существовали в человеческом обществе на всех этапах его развития. Усложнялись законы по мере сосредоточения в руках отдельных членов общества значительного имущества, а правовая система была призвана охранять собственность. Возникновение законов профессор относил, прежде всего, к появлению собственности на землю. Десницкий не рассматривал, подобно большинству европейских ученых того времени, государство как институт, добровольно созданный всеми членами общества и отвечающий интересам народа. Он даже намекает на его антинародный характер, что было значительным шагом вперед. Возникновение власти связывает с насилием, вытекающим из неравенства состояний.

К числу неотъемлемых прав человека С.Е. Десницкий относил право собственности. Он стремился обосновать требования юридических гарантий личных прав граждан в рамках и формах, допустимых в то время. Не стоит забывать, что речь о таких понятных нам сейчас требованиях демократических свобод велась Десницким в период крепостничества, когда большая часть населения России была в полной зависимости от землевладельцев. Это позволит полнее оценить роль мыслителя – в учении о личных правах он опередил своих современников, создал правовую конструкцию, получившую признание в юриспруденции лишь через 100 лет!

Исходя из своих взглядов и будучи истинным патриотом, С.Е. Десницкий видел основной источник настоящего и будущего могущества России в развитии ее экономики.

Ученый стремился содействовать развитию прогрессивных буржуазных тенденций в российской экономике и способствовать улучшению материального положения народа. С этой целью он разработал проект финансового законодательства, представленный под названием «Об узаконении финанском». В нем Десницкий предлагал постепенно перейти от подушной подати, налагавшейся только на крестьян и посадских людей, к косвенным налогам, которые, как он говорил, «более касаются для всех вообще государственных жителей». Это позволило бы облегчить положение беднейших граждан страны, более справедливо перераспределив налоговые тяготы, лишив необоснованных преимуществ высшие слои общества.