Беспокойство относительно судьбы Украины не оставляло царя. Петр Суховей со 100-тысячным войском татар подошел к Каневу. Петр Дорошенко запросил помощи у Москвы. В это время появился новый соперник Дорошенко — уманьский полковник Михаил Ханенко, которого Польша провозгласила гетманом Правобережной Украины (он утвердился в Умани). Суховей начал помогать Ханенко. Юрий Хмельницкий, сбросив монашескую рясу, соединился с ними. Из Москвы дали знать, чтобы Многогрешный не вмешивался в эти внутренние распри. Однако положение Многогрешного тоже было непрочным. Он думал, что Суховей и Ханенко заставят бежать Дорошенко, но вышло наоборот. Дорошенко победил Суховея, Ханенко и Хмельницкого, взял последнего в плен и отослал турецкому султану. Сначала Хмельницкий сидел в темнице, но затем султан его освободил. Торжествующий Дорошенко был опасен для Многогрешного. Борьба на Украине разгорелась также и между церковными деятелями — митрополитом Киевским Иосифом Тукальским и архиепископом Черниговским Лазарем Барановичем. Летом 1671 г. на Правобережной Украине началась война. С одной стороны, Дорошенко с турками и татарами, с другой — поляки опустошали несчастную страну. Ханенко и Серко были на польской стороне, но вскоре Серко попал к русским в плен. На Восточной Украине тоже было неспокойно. Гетман Многогрешный был недоволен Москвой. К нему из России было направлено посольство. На Многогрешного посыпались доносы старшин, он был схвачен и привезен в Москву. Бывшего гетмана допросили и отправили в ссылку. Новым гетманом Восточной Украины избрали Ивана Самойловича — сына священника с западного берега Днепра. Он был грамотным, умным, хорош собой, ко всем ласков и услужлив. Сначала Самойлович был черниговским полковником, а затем генеральным судьей.

Пока на Левобережной Украине выбирали нового гетмана, на Правобережной Украине разразилась настоящая буря. Турецкое войско численностью свыше 300 тысяч перешло Дунай и пошло на Польшу. Передовой отряд татар в 40 тысяч человек ворвался в Подолию. При Батоге (около г. Каменец-Подольский) татары встретились с польскими войсками, которыми командовал Лужецкий. С ним был и Ханенко. Поляки опрокинули татар, хотя их число и было невелико (до 6 тысяч). Лужецкий решил гнаться за татарами, но был ими побит: войско погибло, сам он едва спасся. Турки по главе с султаном Магометом IV взяли Каменец. Эта весть произвела в Москве тяжелое впечатление. Царь собрал совет.

В марте 1673 г. из ссылки в Москву вернули Ивана Серко. Сначала он был представлен Алексею Михайловичу, затем духовенству. Серко послали на Украину в помощь гетману Самойловичу.

Еще в бытность Дорошенко гетманом Украины он направил к хану генерального писаря Ивана Степановича Мазепу. Но тот был схвачен запорожцами и выслан в Москву. Мазепа был родом из казаков, шляхетство получил от короля Яна Казимира. Затем, в поисках счастья в ратном деле, Мазепа оказался в России и стал служить царю. Алексей Михайлович отпустил его на Украину в войско Григория Ромодановского.

23 июля 1674 г. воевода Ромодановский и гетман Самойлович подошли к Чигирину, где был разбит отряд Андрея Дорошенко (брата гетмана). Турки же захватили Умань, а татары пошли на Чигирин. Ромодановский и Самойлович отступили в Черкассы, а 12 августа сюда подошли Саип-Гирей и Дорошенко. Произошел бой, победителя не оказалось. Страх, нагнанный на Украину, был недолгим. Вскоре турки возвратились в Турцию, хан — в Крым.

В 1674 г. королем Речи Посполитой был избран 45-летний Ян Собеский (Ян III).

Царь Алексей Михайлович поддерживал дипломатические отношения со многими странами Европы и Азии. Пристальное внимание уделялось Грузии. Грузинский народ, страдая от насилия турок, постоянно искал помощи у единоверной России. После неудачной попытки при Борисе Годунове помочь Грузии Россия отказалась от мысли послать войска на Кавказ. Русский народ помогал Грузии деньгами, посылал духовенство, поддерживая православную церковь. С 1653 г. начались приезды в Москву грузинских царей. Грузия, которую постоянно притесняли турки и персы, с надеждой смотрела на укрепляющуюся Россию и ждала от нее реальной помощи. Но Персия и Россия издавна находились в дружественных отношениях, и с этим приходилось считаться.

В 1667 г. русскими было начато строительство кораблей для Каспийской флотилии. Через 2 года на воду было спущено несколько кораблей. Первый получил название «Орел», капитаном его стал голландец Давид Бутлер.

Продолжалось освоение Сибири. С закладкой Якутска русские первопроходцы двинулись по двум направлениям. Одни устремились на северо-восток — на Яну, Индигирку, Колыму, Анадырь, Чукотку и Камчатку. В освоение этого края большой вклад внесли выдающиеся русские путешественники Семен Дежнев, Федот Алексеев, Михаил Стадухин. Другой поток первопроходцев направился к Ламскому (Охотскому) побережью и к Амуру. Крупный вклад в это дело внесли Василий Поярков (в 1643 — 1646 гг.) и Ерофей Хабаров (в 1649 — 1653 гг.).

Экспедиция Федота Алексеева, в состав которой вошел и Семен Дежнев, была снаряжена богатым купцом из Москвы Алексеем Усовым, который имел своих торговых людей на Урале, в Енисейске, Якутии, Мангазее. Летом 1647 г. экспедиция в составе четырех кочей (кораблей) вышла из устья Колымы в Студеное море. Перезимовали в Нижнеколымском остроге. Из Колымы на восток поплыли уже семь кочей. Море постоянно штормило, несколько кочей разбилось о скалы. Проплыли низменный остров Айок, вблизи неизвестного пролива экспедиция высадилась на берег. Произошла стычка с местным населением — «чухочьими людьми», как их называл Дежнев. В этой стычке был ранен Алексеев. Кочи круто повернули на юг, миновав Каменный нос. Таким образом было сделано величайшее географическое открытие. Русские мореплаватели первыми миновали пролив, отделяющий Азию от Америки и соединяющий Северный Ледовитый океан с Тихим.

Судьба экспедиции Дежнева была тяжелой, можно сказать трагической. Тонули кочи, гибли люди. Дежнев решил идти в острог по Анадырь-реке. Но последний коч затонул, тогда оставшиеся 25 человек экспедиции оказались значительно южнее устья Анадыря, где-то на Олюторском берегу. Изматывающий силы поход, холод, голод и болезни унесли 13 человеческих жизней. И лишь 12 человек во главе с Дежневым в 1649 г. достигли Анадырьского острога. В 1664 — 1666 гг., во время пребывания в Москве, Семен Иванович Дежнев был произведен в казачьи атаманы.