Флотоводец в полной мере освоил умение на флотилии из разномастных кораблей и судов, часто маломореходных, выполнять сложные задачи, умело планировать операции, координировать действия судов с авиацией и сухопутными войсками. Все это потребовалось на Дунае.

С 20 апреля по 12 декабря 1944 года С.Г. Горшков командовал Дунайской флотилией, которая поддерживала советские войска в наступлении по Восточной Европе. Флагман взял с собой на Дунай опытных моряков, которые в новых условиях продемонстрировали свое умение.

Перебазирование катеров и орудий береговых батарей с Азовского моря к Одессе происходило на 16 эшелонах. В организационный период флотилия тралила мины и проводила подготовку одиночных кораблей, сбор и изучение данных обстановки. Спускали суда в районе Днепровско-Бугского лимана, в Херсоне, Очакове и Одессе. С 1 июля по 12 августа проходила подготовка бригад бронекатеров и речных кораблей к высадкам десанта, переправе войск и другим действиям, которые ожидали в ходе наступления 3-го Украинского фронта в дельте Дуная. К началу августа прошедшие подготовку силы флотилии были сосредоточены в Одессе [800] .

По плану наступления силы 2-го и 3-го Украинских фронтов при поддержке Дунайской флотилии должны были окружить и ликвидировать ясско-кишиневскую группировку противника. Флотилии следовало во взаимодействии с Черноморским флотом и с левым флангом 3-го Украинского фронта разбить аккерманскую группировку гитлеровцев и выйти к устью Дуная. Морякам флотилии предстояло помочь войскам форсировать Днестровский лиман и действовать на Нижнем Дунае, воды которого были засорены многочисленными минными постановками.

Форсирование Днестровского лимана планировал и осуществлял штаб под руководством Горшкова. 11 августа маршал Ф.И. Толбухин поставил задачу и назначил командующим операцией генерал-лейтенанта Бахтина, а его заместителем по морской части – командующего Дунайской флотилией. Все силы следовало подготовить к 20 августа [801] .

В августе началась подготовка к преодолению Днестровского лимана. На окраине Одессы две недели бойцов готовили садиться на суда и высаживаться, грести веслами. Нередко за подготовкой наблюдал сам командующий. Для переправы использовали гребные суда и малые катера [802] . Горшков решил неожиданно для противника высадить десанты на флангах позиции под Аккерманом, чтобы создать при поддержке артиллерии, авиации и кораблей плацдарм для переправы главных сил.

11–12 августа были разработаны основные оперативные документы. Для удобства взаимодействия командные пункты Горшкова и Бахтина расположились рядом в Овидиополе [803] .

20 августа началось успешное наступление фронтов, 21 августа поступило указание о форсировании лимана силами флотилии, уже скрытно сосредоточенными вблизи пунктов посадки. Высадка проходила в ночь на 22 августа. Первая волна десанта шла скрытно без артподготовки и была обнаружена в 100–200 метрах от берега. Когда десантники под огнем высадились на другом берегу, в лиман вошли бронекатера, минометные катера и тральщики, прикрываемые катерами-дымзавесчиками. Корабли поддержали наступающих, которые вскоре овладели Аккерманом (Белгород-Днестровским).

Командующий и в этой, и в последующих операциях использовал ранее применяемые методы, ведущие к победе: тщательное планирование и подготовка, внезапность и стремительность действий, отработанное взаимодействие между различными силами флотилии и с сухопутными войсками. Он требовал от штаба четкого руководства действиями и сам нередко выезжал на места, разъясняя задачу командирам [804] .

24 августа корабли прорыва при поддержке авиации и торпедных катеров вошли в Килийское гирло Дуная, заняли Вилково, Килию, Тулчу и другие населенные пункты, а бронекатера направились вверх по Дунаю, расчищая берега от противника. 25 августа был взят Измаил. Стремительно наступая, нередко моряки занимали порты до того, как к ним подходили войска 3-го Украинского фронта. В частности, 25 августа Горшков доносил в Москву: «Частей армии нет. Прошу уточнить обстановку» [805] . К 27 августа флотилия выполнила задачу, овладев руслом реки до Галаца. 31 августа бронекатера флотилии заняли остров Змеиный. 27–29 августа капитулировали суда Румынской речной дивизии [806] .

Чтобы завершить освобождение Румынии и Болгарии, войскам 2-го и 3-го Украинских фронтов по приказу Ставки Верховного главнокомандования было приказано наступать за Дунай. Переправу в районе Измаил – Галац и у Тулчи и Исакчи в конце августа – начале сентября 1944 года обеспечивали корабли Дунайской флотилии.

8 сентября советские войска вступили в Болгарию. Переправу войск обеспечивала флотилия. Так как Болгария выступила на стороне СССР, то во второй половине сентября вся ее територия была очищена от гитлеровцев общими усилиями. Флотилия в сентябре обеспечивала траление, перевозку и переправу войск и грузов на Дунае.

В период освобождения Болгарии и Румынии имя Горшкова не раз упоминали приказы Верховного главнокоман дующего. В сентябре 1944 года его произвели в вице-адмиралы [807] .

В Белградской операции (28 сентября – 20 октября) Дунайская флотилия содействовала наступлению войск, проводила траление на реке и наблюдение за минными постановками противника, переправу и перевозку войск и грузов для них. Река была разбита на участки, подчиненные старшим морским начальникам. Командный пункт развернули у Калафата, вблизи штаба 57-й армии, с которой предстояло ваимодействовать, тогда как штаб оставался в Измаиле. При необходимости создавали вспомогательные пункты управления [808] .