14 октября 1942 года приказом командующего Черноморским флотом Азовская флотилия была расформирована. Но в начале 1943 года советские войска начали наступление, были освобождены Ростов, Ейск, Азов, Приморско-Ахтарская. Противник укрепился по линии рек Миус и Кубань, располагал флотилией на Азовском море. Вновь потребовалась Азовская флотилия, и 3 февраля 1943 года нарком ВМФ издал приказ о ее воссоздании. В тот же день началось формирование флотилии. Возглавил ее контр-адмирал С.Г. Горшков [786] .

Вторично Горшков принял Азовскую флотилию 20 февраля 1943 года, когда советские войска отбросили гитлеровские войска на запад от берегов Азовского моря. Флагман стоял во главе флотилии до 5 января 1944 года, затем – с 6 февраля по 20 апреля 1944 года [787] .

С.Г. Горшков в автобиографии записал: «Весной 1943 года командовал рядом десантных и набеговых операций на временно занятое немцами побережье для содействия наступающим сухопутным войскам Южного и Северо-Кавказского фронтов. Наиболее крупными операциями флотилии были: десанты в Мариуполь, Осипенко и Темрюк; поддержка с моря частей Северо-Кавказского фронта при освобождении Таманского полуострова и, наконец, крупная десантная операция в ноябре 1943 года по высадке частей отдельной Приморской армии на Керченском полуострове. Этот десант впоследствии перерос в операцию по систематическим перевозкам через Керченский пролив войск, техники и грузов армии» [788] .

Так как Керченский пролив оставался в руках противника, первоначально в апреле-мае перебрасывали на Азовское море по железной дороге катера. Более крупные корабли действовали на Черном море у берегов Кавказа. В состав флотилии входили подвижные артиллерийские батареи, авиация и морская пехота, которые при участии приданных войск обеспечивали противодесантную оборону. С апреля началось траление акватории и восстановление оборудования Ейского порта, ремонт судов, которые пополнили состав флотилии. Морякам приходилось бороться с неприятельскими десантами, снабжать сухопутные войска в плавнях.

В условиях численного превосходства неприятельских судов на Азовском море командование флотилии определило основными направлениями северные побережья Таманского полуострова и Таганрогского залива, чтобы обстрелами скоплений войск заставить неприятеля оттянуть силы с фронта для обороны берега. Кроме того, планировали удары авиацией и артиллерией по судам в портах и в море, нарушение коммуникации, в частности постановку мин на судоходных путях, и оборону собственных берегов [789] .

Германское командование, сняв авиацию с фронта, 25 апреля – 25 мая наносило удары по Ахтари и Ейску, потопив несколько катеров и судов. Однако моряки уже 1 мая высадили десант, способствовавший наступлению 9-й армии. Отвлекая вражеское внимание, в начале июня моряки флотилии на Черном и Азовском морях обстреливали пункты, занятые неприятелем. С появлением на флотилии артиллерийских катеров и речных бронекатеров, вооруженных ракетами, огневая мощь возросла настолько, что позволила малыми силами добиваться значительных успехов. Всего с 7 июля по 8 октября было выпущено 584 ракеты. Не раз суда флотилии вели успешные бои с неприятельскими. Интересно, что набеговые операции, как правило, проводили во взаимодействии с авиацией.

Когда 5-я ударная армия Южного фронта в августе 1942 года прорвала Миусский оборонительный рубеж противника, перед флотилией встала новая задача: не дать окруженным в районе Таганрога войскам уйти морем или берегом. Азовцы нарушали коммуникацию между городами Таганрог и Осипенко, поставили 11 минных банок, блокировали с моря Мариуполь и Таганрог силами кораблей, авиации и береговой артиллерии, высаживали десанты, которые перехватывали прибрежные дороги.

В ходе боев за Таганрог по заявке командования 44-й армии командующий флотилией организовал обстрел и блокаду 27 и 28 августа Таганрогского порта. 27–29 августа самолеты флотилии отгоняли неприятельские конвои, направлявшиеся для эвакуации окруженных. По указанию Военного совета Северо-Кавказского фронта контр-адмирал Горшков организовал высадку в тылу неприятеля в ночь на 30 августа усиленной роты морской пехоты в двух пунктах – у Безымяновки и Веселого. При поддержке кораблей и авиации тщательно подготовленная штабом высадка у Безымяновки завершилась успехом. Успешные движения десантников и обстрелы прибрежных пунктов с моря вызвали замешательство противника. Однако из-за задержки наступления армии десант пришлось снять с берега. Катера, направлявшиеся для высадки второго десанта, в ночь на 30 августа вступили в бой с шедшим в Таганрог конвоем противника и не пропустили его к цели, нанеся врагу потери. Днем удары по неприятельским плавсредствам наносила авиация. Вошедшие в занятый войсками Таганрог катера не позволили уничтожить или увести остававшиеся в порту суда. За участие во взятии Таганрога 70 моряков наградили орденами и медалями.

2 сентября Ставка Верховного главнокомандования передала Азовскую флотилию в оперативное подчинение Южного фронта. Флотилия продолжала поддерживать наступление 44-й армии в направлении Мариуполя. Как и под Таганрогом, с 31 августа моряки блокировали порт, действовали на его коммуникациях, а в ночь на 8 сентября высадили десант в тылу неприятеля у села Ялта; второй десант из-за бурной погоды высадить не удалось. Десантники лейтенанта К.Ф. Ольшанского четверо суток вели бои в тылу противника и 11 сентября вышли в район Мариуполя. Тем временем второй десант с целью овладеть портом Мариуполь и преградить пути отхода противника был высажен в ночь на 10 сентября в Мелекино и наступал на Мариуполь. В результате упорных боев город был взят.

Сразу же после взятия Мариуполя Горшков приказал развернуть в порту командный пункт, на который перешла из Ейска оперативная группа во главе с начальником штаба [790] .

В ходе боев за Осипенко с 16 сентября авиация и артиллерия флотилии наносила удары по скоплениям войск на берегу и судам в море. В ночь на 17 сентября высаженный по приказу Горшкова в районе Луначарское– Бердянск и непосредственно в порт десант помог 28-й армии овладеть городом.

Особенностью этого периода были непосредственные подготовка и проведение операций штабом флотилии; из штабных офицеров назначались командиры высадки и офицеры их штабов. К успеху приводила совместная работа командующего и штаба.