У. Пенн был одним из наиболее известных в Англии во второй половине XVII в. пропагандистов идеи всеобщей веротерпимости. Очевидно, что в значительной степени именно под его влиянием Яков II решился пойти на предоставление свободы совести всем христианским конфессиям Британии.

Таким образом, Яков II рекрутировал новую политическую элиту по четырем основным каналам. В его администрацию частично вошли старые «слуги короны», принадлежавшие к британскому нобилитету и выдвинувшиеся еще в правление Карла II. Однако за исключением Сандерленда и Мидлтона большинство из них занимало второстепенные должности и не имело серьезного влияния на принятие решений. Небольшую группу составили единоверцы короля, также принадлежавшие к аристократическим семействам. Третьим каналом рекрутирования новой элиты стала прежняя оппозиция, отдельных и наиболее талантливых представителей которой Яков II начал привлекать себе на службу задолго до восшествия на престол. Наконец, Яков II пытался опереться на военных. В XVII в. вооруженные силы, наряду с церковью, были единственной структурой, которая отличалась высоким уровнем внутренней организации и жесткой дисциплиной. При Якове II начался процесс более широкого, чем ранее, выдвижения на гражданские посты представителей генералитета и высшего офицерства.

Вместе с тем король стремился расширить социальную опору монархии. С этой целью он внес изменения в налоговое законодательство, облегчив положение землевладельцев, предложил парламенту создать новый земельный регистр, который должен был удешевить процедуры передачи земли, а также ее использование. С 1687 г. король начал постепенный курс на проведение протекционистской политики в отношении торговли и текстильного производства, одновременно привлекая на работу в Англию талантливых специалистов из-за рубежа [321] . Яков II пытался отменить практику тюремного заключения за долги и расширил государственную помощь неимущим. Однако «Славная революция» прервала эти начинания короля, и во многих из них Вильгельм III в значительной степени выступил в качестве его продолжателя [322] .

Ключевыми направлениями внутренней политики Якова II стали эмансипация лиц, не принадлежавших к государственной церкви (как католического, так и протестантского вероисповедания), реформирование государственного аппарата и армии, посредством которых король надеялся найти опору внутри страны, и умиротворение наиболее неспокойных частей монархии Стюартов — Шотландии и Ирландии.

Религиозные реформы Якова II и их основная направленность являются одними из самых дискуссионных вопросов во всем комплексе проблем, связанных с политической деятельностью этого монарха. В отечественной и, отчасти, зарубежной историографии является распространенным взгляд на Якова II как на одного из лидеров европейской Контрреформации конца XVII в., который пытался уничтожить на Британских островах протестантизм. Сам король характеризовался многими историками как мрачный и упрямый фанатик [323] . Данная оценка представляется односторонней и упрощенной.

Документальные свидетельства позволяют утверждать, что в действительности Яков II выступал против любых преследований на религиозной почве [324] . Британский монарх начал свое правление с того, что в Англии и Шотландии выпустил из тюрем всех лиц, заключенных за религиозные убеждения, в том числе около 1,2 тыс. квакеров [325] , в то время как в правление Карла II было казнено и замучено около полутысячи последователей этого учения [326] . В 1685 г. в беседе с нидерландским послом в Лондоне Арноутом ван Ситтерсом Яков II осудил отмену французским королем Людовиком XIV (1643–1715) Нантского эдикта [327] . Британский монарх охарактеризовал данный шаг как политически непродуманный и антихристианский [328] . Значительное недовольство французского двора вызвало то, что Яков II принял в своих владениях более 4 тыс. беженцев-гугенотов [329] , предоставив им британское подданство и право занимать государственные должности [330] . Кроме того, британский монарх выделил из коронных доходов средства на оказание материальной помощи французским кальвинистам, прибывшим в его владения [331] .

Протестант Дж. Рересби отмечал, что Яков II стремился использовать приход к власти, чтобы улучшить положение своих единоверцев, которые с эпохи Реформации подвергались значительным притеснениям со стороны протестантского большинства [332] . Согласно карательным законам, которые в эпоху Реставрации были дополнены «Тест-Актами» [333] , католикам было запрещено совершать мессу, занимать государственные должности, выступать в суде, иметь оружие. Они были лишены активного и пассивного избирательного права, не могли обучаться в университетах, в то же время им запрещалось иметь собственные образовательные учреждения. Католики не могли селиться в Лондоне и его округе. Непосещение обязательной англиканской мессы каралось штрафами. В Англии католический священник, обративший в свою веру протестанта, приговаривался к смертной казни [334] . В целом, карательные законы и другие методы преследования католиков фактически являлись пережитком эпохи Реформации.

Яков II полагал, что создание юридической базы станет недостаточной мерой в борьбе за равноправное участие представителей религиозных меньшинств в жизни государства, поскольку в реставрационном обществе не существовало механизмов, способных привести к власти протестантских нонконформистов и католиков, и декларирование любых свобод останется лишь на бумаге, если одновременно не добиться выдвижения на ведущие посты представителей католической и диссентерских общин. В связи с этим меры Якова II в области религии носили двоякий характер: с одной стороны, внесение изменений в действующее законодательство, с другой — практические шаги по реализации прав подданных, нередко — путем прямого королевского вмешательства.

В религиозных реформах Якова II выделяются два этапа. На первом этапе (1685–1686 гг.) он надеялся создать союз своих единоверцев и «Высокой англиканской церкви», поскольку из всех британских протестантов считал наиболее близкой к католицизму доктрину сторонников епископального устройства церкви. В связи с этим, первые два года своего правления король пытался добиться от государственной церкви (в Англии — англиканской, в Шотландии — епископальной [335] ) максимального расширения прав католического населения [336] . Религиозные преобразования задумывались Яковом II как постепенный и многоступенчатый процесс, осуществлять который было необходимо с осторожностью, но, в то же время, настойчиво и не отступая перед трудностями [337] . Проведение реформ Яков II начал в Шотландии, поскольку в северном королевстве у него были более прочные позиции, в то время как любой даже самый незначительный ошибочный шаг в Англии мог привести к катастрофическим последствиям. В Ирландии ситуация была более сложной: здесь конфессиональные противоречия накладывались на этнические и социально-экономические и отличались особенной остротой. Поэтому из всех трех британских королевств Шотландия, хорошо контролируемая верными Якову II гражданскими и военными властями, представляла собой наилучшую базу для апробации новой политики [338] .

В Шотландии в ноябре 1685 г. Яков И, используя королевскую прерогативу, освободил от «Тест-Акта» двадцать шесть католиков, назначив их сборщиками налогов, и ввел в состав Тайного совета северного королевства своего единоверца генерал-майора графа Дамбартона [339] .

В январе 1686 г. для обеспечения отправления тайных католических месс из Англии в Шотландию начали поступать предметы культа. В том же месяце Тайный совет Шотландии получил королевский указ, разрешивший католикам занимать государственные должности без принесения присяги государственной церкви. Последняя была заменена клятвой верности королю. Шотландскому духовенству было запрещено в своих проповедях высказываться против католицизма. Тайный совет приостановил распространение протестантских сочинений в шотландской столице [340] . По сведениям Дж. Рересби, «король разрешил издание католических книг» [341] , хотя формально это было запрещено английскими и шотландскими законами.