Мощи оставались в храме для поклонения верующих до 6 февраля, а затем они были перевезены в Москву. В тот холодный зимний вечер тысячи верующих петербуржцев провожали преподобного Серафима от Александро-Невской Лавры до Московского вокзала. Всю ночь Патриарх вместе с другими иерархами и духовенством читал акафист преподобному Серафиму перед его мощами, помещенными в специальный вагон поезда. Сохранилась запись этого богослужения, в которой через стук колес слышатся слова Святейшего Патриарха Алексия II: «Преподобие отче наш Серафиме, моли Бога о нас», и в конце, обратившись к присутствовавшему духовенству, он заметил: «Такой ночи у нас в жизни еще не было!»

Тысячи верующих москвичей ожидали мощи на Ленинградском вокзале столицы. На улицах холодной Москвы, покрытых слоем снега, в сумраке робкой зимней зари, в которой свет борется, чтобы победить тьму, процессия направлялась в сторону Патриаршего Богоявленского собора, где мощи были выставлены в главном приделе храма в течение пяти с половиной месяцев.

Множество верующих в течение всего времени пребывания мощей в Москве смогли им поклониться. 23 июля 1991 года Святейший Патриарх совершил вместе с сорока архиереями Божественную литургию в Богоявленском Патриаршем соборе. После этого мощи преподобного были обнесены вокруг храма, и крестный ход направился в Дивеевский монастырь, основанный преподобным. Вдоль пути, по которому шел крестный ход, стояли тысячи верующих, прихожан из окрестных храмов и специально приехавших, чтобы проводить преподобного и поприветствовать Патриарха, который благословлял их.

«Сколько мне ни даст Господь лет жизни, – вспоминал Патриарх, – я никогда не забуду этого события. В моей памяти сохранятся десятки тысяч людей, которые выходили навстречу святым мощам. Когда мы отъехали от Москвы, шел моросящий дождь, и сотрудники ГАИ не разрешали бросать цветы на дорогу, чтобы не создавать аварийной ситуации. И тогда люди выстилали цветами обочину дороги и стояли на коленях, с зажженными свечами. Под дождем они шли к автобусу, в котором стояла рака с мощами, чтобы только прикоснуться к ним. Молитвенное предстательство преподобного не посрамит тех надежд, которые возлагает на него православный народ. И не случайно, что именно в прошлом году были обретены его святые мощи – в то трудное время, когда злоба и противостояние так бурно проявляли себя. Преподобный Серафим напомнил нам о необходимости стяжания мирного духа, который будет умиротворять людей, помогать переживать испытания».

Первый этап долгого пути заканчивался в Ногинске (Богородске), куда процессия с мощами прибыла 23 июля. Тысячи верующих приняли участие в крестном ходе по улицам города до Богоявленского собора, который был передан Церкви и снова освящен только в 1989 году. В Богородске, Владимире, Нижнем Новгороде тысячи людей приходили днем и ночью, чтобы приложиться к мощам русского чудотворца. Это были совершенно разные люди. Некоторые из них, по словам Святейшего Патриарха, даже не знали, по какой причине находились в этом месте. Люди с различными представлениями о Боге, о Церкви, о святости, о мире, но все объединенные одним состоянием души, которое заставило их приехать в это место, в этот храм, преклонять колена, прикладываться к мощам и молиться святому, напоминая слова святителя Иоанна Златоуста в Пасхальном слове: «И последний приемлется как первый».

Затем процессия отправилась во Владимир, где два века назад святой был рукоположен в диаконы. Патриарх отслужил молебен под открытым небом, на площади, заполненной верующими, с ракой, поставленной в церковном дворе, перед собором. Таким образом, процессия проследовала в Боголюбове, Вязники, Нижний Новгород и Арзамас.

«Пожилая жительница Арзамасского района Мария Федоровна Саванина подарила мне икону преподобного Серафима, – вспоминал Святейший Патриарх Алексий II, – которую она спасла при закрытии храма в своем селе и 41 год хранила у себя дома. Обращаясь ко мне, она сказала: «Ваше Святейшество, мы с ним хорошо жили, я ему каждый день акафист читала, он всегда мне помогал. А прошлой Пасхой ночью у него лик просиял светом ярким». Я принял этот ценный дар и обещал ей, что подаренная икона будет сохранена в отреставрированном соборе Дивеевского монастыря… По известным пророчествам самого преподобного Серафима, надлежит ему лежать в Дивееве и прийти туда не по земле, а по воздуху, и будет при этом великая радость – среди лета воспоют Пасху. Все именно так и случилось».

Преподобный Серафим подвизался в Саровском монастыре, который впоследствии стал частью закрытого города Арзамас-16. Храмы этого городка были полностью разрушены, и поэтому естественно, что мощи святого обрели место упокоения и мира не в Саровском монастыре, а в Дивеевском, который был недавно возвращен Церкви. Мощи были принесены в это место буквально руками Патриарха, вместе с архиереями, духовенством и несколькими тысячами верующих. Возвращение мощей преподобного Серафима было большой духовной радостью для всех участвовавших в этом процессе, и потому, где проходила процессия с его мощами, верующие пели пасхальные песнопения.

В Дивеевский монастырь крестный ход прибыл 30 июля. Святейший Патриарх Алексий II перед царскими вратами произнес: «Перевернута последняя страница дивеевской летописи, пришло время исполнения пророчеств: мощи преподобного Серафима отныне упокоятся по его слову в соборе во имя Рождества Пречистой Матери Божией Дивеевского монастыря». Затем Святейший Патриарх отслужил молебен.

На следующий день, при всеобщем воодушевлении, паломники посетили Саров. Этот городок прекратил свое существование около 1940 года. Его имя исчезло с карт, а на его месте появилось название «Арзамас-16» – место, где было построено большое военное производство. Целые поколения верующих в течение долгих десятилетий могли только издали рассматривать колокольню собора, теперь использовавшуюся как контрольная вышка, – единственное в Арзамасе-16, что виднелось далеко за его территорией.

31 июля, накануне дня памяти преподобного Серафима, в это место прибыли Патриарх, иерархи и паломники. Они посетили места, где преподобный жил в затворе, пропели молебен перед камнем, на котором он на коленях молился тысячу дней и ночей. В «дальней пустыньке», где жил преподобный в полном затворе, Патриарх отслужил молебен с акафистом, благословив основание монумента, созданного в память о преподобном Серафиме Саровском скульптором В.М. Клыковым.

1 августа, в день памяти преподобного Серафима, в храме Дивеевского монастыря всю ночь длилось праздничное богослужение, завершившееся Божественной литургией, которая была отслужена самим Святейшим Патриархом под открытым небом, во дворе храма. После последнего обхода процессии вокруг стен храма мощи были помещены внутри его, где, по пророчеству преподобного, обрели вечный покой.